MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	GCAAC	2	10	16761	16770	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011603	AGTTA	2	10	17028	17037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011603	CAGAA	2	10	18893	18902	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011603	TCAGT	2	10	19131	19140	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011603	CTGGG	2	10	20205	20214	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011603	AAACA	2	10	20435	20444	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011603	AATTG	2	10	22124	22133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011603	TGAAC	2	10	22354	22363	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011603	TTCCT	2	10	24442	24451	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011603	TAAAT	2	10	24859	24868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011603	AGAAA	2	10	24871	24880	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011603	ATTGT	2	10	25740	25749	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011603	TGATT	2	10	26090	26099	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011603	TGTAG	2	10	27131	27140	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011603	ACCTT	2	10	28015	28024	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011603	GTTCG	2	10	28453	28462	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011603	AAGGT	2	10	28802	28811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011603	AGCGC	2	10	29202	29211	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011603	TGAGT	2	10	29405	29414	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011603	AATGA	2	10	32669	32678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011603	TTTTA	2	10	68281	68290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011603	CTTCC	2	10	76128	76137	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_011603	GTGCC	2	10	77329	77338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011603	GGCAC	2	10	77545	77554	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011603	GAATG	2	10	78280	78289	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011603	TGGGC	2	10	80628	80637	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011603	CTGTC	2	10	80956	80965	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011603	CACTT	2	10	82419	82428	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011603	TGTGA	2	10	83339	83348	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011603	GTACG	2	10	87614	87623	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011603	TGAAC	2	10	88076	88085	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.