MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	GTCAG	2	10	4860	4869	20 %	20 %	40 %	20 %	215276196
2	NC_011603	GGGAA	2	10	5992	6001	40 %	0 %	60 %	0 %	215276197
3	NC_011603	AAACA	2	10	7032	7041	80 %	0 %	0 %	20 %	215276199
4	NC_011603	ACGGC	2	10	7922	7931	20 %	0 %	40 %	40 %	215276199
5	NC_011603	GTTTA	2	10	11415	11424	20 %	60 %	20 %	0 %	215276202
6	NC_011603	TAAAG	2	10	11796	11805	60 %	20 %	20 %	0 %	215276203
7	NC_011603	AAAAG	2	10	11898	11907	80 %	0 %	20 %	0 %	215276204
8	NC_011603	GAAAA	2	10	12085	12094	80 %	0 %	20 %	0 %	215276204
9	NC_011603	TCTTT	2	10	12386	12395	0 %	80 %	0 %	20 %	215276204
10	NC_011603	AAGAA	2	10	12427	12436	80 %	0 %	20 %	0 %	215276205
11	NC_011603	TTATA	2	10	13055	13064	40 %	60 %	0 %	0 %	215276206
12	NC_011603	GTTAT	2	10	13451	13460	20 %	60 %	20 %	0 %	215276206
13	NC_011603	TGTCT	2	10	13600	13609	0 %	60 %	20 %	20 %	215276207
14	NC_011603	TAAGA	2	10	17298	17307	60 %	20 %	20 %	0 %	215276210
15	NC_011603	AAACA	2	10	18223	18232	80 %	0 %	0 %	20 %	215276211
16	NC_011603	AAATT	2	10	18750	18759	60 %	40 %	0 %	0 %	215276212
17	NC_011603	GACCA	2	10	36795	36804	40 %	0 %	20 %	40 %	215276221
18	NC_011603	GTGTT	2	10	36853	36862	0 %	60 %	40 %	0 %	215276221
19	NC_011603	CAGGT	2	10	37134	37143	20 %	20 %	40 %	20 %	215276222
20	NC_011603	ACGGC	2	10	37672	37681	20 %	0 %	40 %	40 %	215276222
21	NC_011603	CGCTG	2	10	39002	39011	0 %	20 %	40 %	40 %	215276222
22	NC_011603	AGGTC	2	10	41921	41930	20 %	20 %	40 %	20 %	215276222
23	NC_011603	CAGCA	2	10	44008	44017	40 %	0 %	20 %	40 %	215276225
24	NC_011603	ACCAG	2	10	45572	45581	40 %	0 %	20 %	40 %	215276226
25	NC_011603	CACTG	2	10	47587	47596	20 %	20 %	20 %	40 %	215276228
26	NC_011603	CCCAG	2	10	49188	49197	20 %	0 %	20 %	60 %	215276228
27	NC_011603	AGAAA	2	10	52859	52868	80 %	0 %	20 %	0 %	215276235
28	NC_011603	CAGAC	2	10	54896	54905	40 %	0 %	20 %	40 %	215276238
29	NC_011603	TTCAC	2	10	55216	55225	20 %	40 %	0 %	40 %	215276238
30	NC_011603	GCACT	2	10	55381	55390	20 %	20 %	20 %	40 %	215276238
31	NC_011603	GGACT	2	10	56714	56723	20 %	20 %	40 %	20 %	215276240
32	NC_011603	GCTTC	2	10	57406	57415	0 %	40 %	20 %	40 %	215276240
33	NC_011603	TCAGA	2	10	60354	60363	40 %	20 %	20 %	20 %	215276243
34	NC_011603	AACTG	2	10	61725	61734	40 %	20 %	20 %	20 %	215276245
35	NC_011603	CATTT	2	10	62777	62786	20 %	60 %	0 %	20 %	215276248
36	NC_011603	GCTCT	2	10	63369	63378	0 %	40 %	20 %	40 %	215276249
37	NC_011603	CCGGG	2	10	64204	64213	0 %	0 %	60 %	40 %	215276249
38	NC_011603	TGTCC	2	10	64303	64312	0 %	40 %	20 %	40 %	215276249
39	NC_011603	CACGG	2	10	64720	64729	20 %	0 %	40 %	40 %	215276250
40	NC_011603	CGCTT	2	10	65568	65577	0 %	40 %	20 %	40 %	215276251
41	NC_011603	TGCCA	2	10	68722	68731	20 %	20 %	20 %	40 %	215276257
42	NC_011603	ACAGT	2	10	76801	76810	40 %	20 %	20 %	20 %	215276263
43	NC_011603	ACGGT	2	10	77039	77048	20 %	20 %	40 %	20 %	215276264
44	NC_011603	TATTT	2	10	83977	83986	20 %	80 %	0 %	0 %	215276267
45	NC_011603	TGGCT	2	10	84449	84458	0 %	40 %	40 %	20 %	215276267
46	NC_011603	CATCA	2	10	89147	89156	40 %	20 %	0 %	40 %	215276272
47	NC_011603	GGAAG	2	10	89897	89906	40 %	0 %	60 %	0 %	215276273
48	NC_011603	GATGC	2	10	93559	93568	20 %	20 %	40 %	20 %	215276278
49	NC_011603	GCATG	2	10	94295	94304	20 %	20 %	40 %	20 %	215276278
50	NC_011603	CGTCC	2	10	95853	95862	0 %	20 %	20 %	60 %	215276279
51	NC_011603	CCGCG	2	10	96192	96201	0 %	0 %	40 %	60 %	215276280

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.