MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 292

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	ATTC	2	8	536	543	25 %	50 %	0 %	25 %	215276193
2	NC_011603	CAGT	2	8	622	629	25 %	25 %	25 %	25 %	215276193
3	NC_011603	CTCA	2	8	661	668	25 %	25 %	0 %	50 %	215276193
4	NC_011603	CATT	2	8	1081	1088	25 %	50 %	0 %	25 %	215276193
5	NC_011603	GCCA	2	8	1144	1151	25 %	0 %	25 %	50 %	215276193
6	NC_011603	TACT	2	8	1285	1292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011603	CTTC	2	8	1377	1384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011603	TCAC	2	8	1504	1511	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011603	GCAC	2	8	2245	2252	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011603	GTCT	2	8	2683	2690	0 %	50 %	25 %	25 %	215276194
11	NC_011603	TTGA	2	8	2691	2698	25 %	50 %	25 %	0 %	215276194
12	NC_011603	AACC	2	8	2933	2940	50 %	0 %	0 %	50 %	215276194
13	NC_011603	ACAG	2	8	3859	3866	50 %	0 %	25 %	25 %	215276196
14	NC_011603	ATTC	2	8	6046	6053	25 %	50 %	0 %	25 %	215276197
15	NC_011603	CCGT	2	8	6369	6376	0 %	25 %	25 %	50 %	215276197
16	NC_011603	TTCT	2	8	6448	6455	0 %	75 %	0 %	25 %	215276197
17	NC_011603	AAAT	2	8	6654	6661	75 %	25 %	0 %	0 %	215276198
18	NC_011603	GTGA	2	8	6934	6941	25 %	25 %	50 %	0 %	215276198
19	NC_011603	AACG	2	8	7944	7951	50 %	0 %	25 %	25 %	215276199
20	NC_011603	TCGA	2	8	8138	8145	25 %	25 %	25 %	25 %	215276199
21	NC_011603	GGTT	2	8	8429	8436	0 %	50 %	50 %	0 %	215276199
22	NC_011603	GCAT	2	8	8505	8512	25 %	25 %	25 %	25 %	215276199
23	NC_011603	TAAA	2	8	8555	8562	75 %	25 %	0 %	0 %	215276199
24	NC_011603	GGGT	2	8	8866	8873	0 %	25 %	75 %	0 %	215276200
25	NC_011603	ATGA	2	8	8953	8960	50 %	25 %	25 %	0 %	215276200
26	NC_011603	CCTG	2	8	9081	9088	0 %	25 %	25 %	50 %	215276200
27	NC_011603	GCAG	2	8	9106	9113	25 %	0 %	50 %	25 %	215276200
28	NC_011603	TAGT	2	8	10071	10078	25 %	50 %	25 %	0 %	215276201
29	NC_011603	GATG	2	8	10231	10238	25 %	25 %	50 %	0 %	215276201
30	NC_011603	TGAT	2	8	11061	11068	25 %	50 %	25 %	0 %	215276202
31	NC_011603	ATTA	2	8	11427	11434	50 %	50 %	0 %	0 %	215276202
32	NC_011603	CATG	2	8	11590	11597	25 %	25 %	25 %	25 %	215276203
33	NC_011603	CAAT	2	8	11833	11840	50 %	25 %	0 %	25 %	215276203
34	NC_011603	GTAA	2	8	11856	11863	50 %	25 %	25 %	0 %	215276203
35	NC_011603	TCAG	2	8	11975	11982	25 %	25 %	25 %	25 %	215276204
36	NC_011603	TTGT	2	8	12097	12104	0 %	75 %	25 %	0 %	215276204
37	NC_011603	ATGT	2	8	12710	12717	25 %	50 %	25 %	0 %	215276205
38	NC_011603	TTCC	2	8	12918	12925	0 %	50 %	0 %	50 %	215276205
39	NC_011603	TATT	2	8	13036	13043	25 %	75 %	0 %	0 %	215276206
40	NC_011603	CAAA	2	8	14011	14018	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011603	ATTG	2	8	14711	14718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011603	CAGA	2	8	14756	14763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011603	AGAC	2	8	14883	14890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011603	GCAG	2	8	14944	14951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011603	CAGC	2	8	15919	15926	25 %	0 %	25 %	50 %	215276208
46	NC_011603	CAGG	2	8	16017	16024	25 %	0 %	50 %	25 %	215276208
47	NC_011603	CTGA	2	8	16664	16671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011603	AAAC	2	8	17151	17158	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011603	AAGA	2	8	17311	17318	75 %	0 %	25 %	0 %	215276210
50	NC_011603	ATTA	2	8	17442	17449	50 %	50 %	0 %	0 %	215276210
51	NC_011603	TATT	2	8	17602	17609	25 %	75 %	0 %	0 %	215276210
52	NC_011603	TTGG	2	8	17887	17894	0 %	50 %	50 %	0 %	215276210
53	NC_011603	AGAA	2	8	18070	18077	75 %	0 %	25 %	0 %	215276211
54	NC_011603	GATG	2	8	18087	18094	25 %	25 %	50 %	0 %	215276211
55	NC_011603	GCAA	2	8	18360	18367	50 %	0 %	25 %	25 %	215276211
56	NC_011603	TTCT	2	8	18409	18416	0 %	75 %	0 %	25 %	215276211
57	NC_011603	ATAC	2	8	18457	18464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011603	GCCA	2	8	19087	19094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011603	GCCA	2	8	19178	19185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011603	TTCT	2	8	19198	19205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011603	ACTG	2	8	19710	19717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011603	AAAG	2	8	20340	20347	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011603	ATTT	2	8	20798	20805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011603	GATC	2	8	21521	21528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011603	GGCT	2	8	21641	21648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011603	CTGG	2	8	22842	22849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011603	GAAG	2	8	23364	23371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011603	ACAT	2	8	23401	23408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011603	GTGC	2	8	23805	23812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011603	ATCA	2	8	23985	23992	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011603	GCAC	2	8	24222	24229	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011603	TAGT	2	8	25708	25715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011603	AAAG	2	8	26247	26254	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011603	CTCA	2	8	26418	26425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011603	GATG	2	8	26816	26823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011603	GTCT	2	8	27072	27079	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011603	TTTG	2	8	27207	27214	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011603	GGCT	2	8	27269	27276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011603	CCAG	2	8	27356	27363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011603	CTGA	2	8	27570	27577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011603	GCCA	2	8	27617	27624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011603	TCGC	2	8	28386	28393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011603	GCTG	2	8	28922	28929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011603	TTAT	2	8	29594	29601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011603	ATAA	2	8	29894	29901	75 %	25 %	0 %	0 %	215276213
86	NC_011603	ACTG	2	8	30069	30076	25 %	25 %	25 %	25 %	215276214
87	NC_011603	CAGA	2	8	30122	30129	50 %	0 %	25 %	25 %	215276214
88	NC_011603	TGAT	2	8	30346	30353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011603	CCAG	2	8	30522	30529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011603	TCTG	2	8	30748	30755	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011603	AATG	2	8	30790	30797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011603	CTGT	2	8	31429	31436	0 %	50 %	25 %	25 %	215276215
93	NC_011603	GTCG	2	8	31525	31532	0 %	25 %	50 %	25 %	215276215
94	NC_011603	GGTA	2	8	31569	31576	25 %	25 %	50 %	0 %	215276215
95	NC_011603	AGAA	2	8	32004	32011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011603	GCCA	2	8	32196	32203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011603	TCTG	2	8	32514	32521	0 %	50 %	25 %	25 %	215276216
98	NC_011603	CGGG	2	8	32717	32724	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011603	CCCG	2	8	32798	32805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_011603	TGTC	2	8	33023	33030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011603	TCCT	2	8	33067	33074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011603	AAAG	2	8	33641	33648	75 %	0 %	25 %	0 %	215276218
103	NC_011603	CTGT	2	8	33717	33724	0 %	50 %	25 %	25 %	215276218
104	NC_011603	GGCG	2	8	33896	33903	0 %	0 %	75 %	25 %	215276218
105	NC_011603	GCAG	2	8	34009	34016	25 %	0 %	50 %	25 %	215276218
106	NC_011603	GCTG	2	8	34104	34111	0 %	25 %	50 %	25 %	215276218
107	NC_011603	GGAA	2	8	34330	34337	50 %	0 %	50 %	0 %	215276218
108	NC_011603	TCTG	2	8	34596	34603	0 %	50 %	25 %	25 %	215276219
109	NC_011603	GGCA	2	8	34686	34693	25 %	0 %	50 %	25 %	215276219
110	NC_011603	TTCA	2	8	35641	35648	25 %	50 %	0 %	25 %	215276220
111	NC_011603	GCTG	2	8	35688	35695	0 %	25 %	50 %	25 %	215276220
112	NC_011603	ACCC	2	8	35745	35752	25 %	0 %	0 %	75 %	215276220
113	NC_011603	ATAC	2	8	35789	35796	50 %	25 %	0 %	25 %	215276220
114	NC_011603	TTCC	2	8	36012	36019	0 %	50 %	0 %	50 %	215276220
115	NC_011603	GGCC	2	8	36265	36272	0 %	0 %	50 %	50 %	215276221
116	NC_011603	CAGC	2	8	36316	36323	25 %	0 %	25 %	50 %	215276221
117	NC_011603	AGGC	2	8	36324	36331	25 %	0 %	50 %	25 %	215276221
118	NC_011603	CAGC	2	8	37415	37422	25 %	0 %	25 %	50 %	215276222
119	NC_011603	CCTG	2	8	37657	37664	0 %	25 %	25 %	50 %	215276222
120	NC_011603	TCCG	2	8	38040	38047	0 %	25 %	25 %	50 %	215276222
121	NC_011603	ACCG	2	8	39078	39085	25 %	0 %	25 %	50 %	215276222
122	NC_011603	CAGG	2	8	39893	39900	25 %	0 %	50 %	25 %	215276222
123	NC_011603	GCCC	2	8	39913	39920	0 %	0 %	25 %	75 %	215276222
124	NC_011603	TCGC	2	8	40020	40027	0 %	25 %	25 %	50 %	215276222
125	NC_011603	CCGG	2	8	40049	40056	0 %	0 %	50 %	50 %	215276222
126	NC_011603	CCAG	2	8	40253	40260	25 %	0 %	25 %	50 %	215276222
127	NC_011603	GCGA	2	8	40754	40761	25 %	0 %	50 %	25 %	215276222
128	NC_011603	TGCG	2	8	41260	41267	0 %	25 %	50 %	25 %	215276222
129	NC_011603	ACCA	2	8	41514	41521	50 %	0 %	0 %	50 %	215276222
130	NC_011603	GTCC	2	8	41783	41790	0 %	25 %	25 %	50 %	215276222
131	NC_011603	TCCG	2	8	41982	41989	0 %	25 %	25 %	50 %	215276222
132	NC_011603	CAGC	2	8	43894	43901	25 %	0 %	25 %	50 %	215276225
133	NC_011603	GGAT	2	8	44019	44026	25 %	25 %	50 %	0 %	215276225
134	NC_011603	CAGA	2	8	44470	44477	50 %	0 %	25 %	25 %	215276225
135	NC_011603	GTCA	2	8	44578	44585	25 %	25 %	25 %	25 %	215276225
136	NC_011603	CTGA	2	8	44968	44975	25 %	25 %	25 %	25 %	215276225
137	NC_011603	ATTT	2	8	45175	45182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011603	ATTT	2	8	45206	45213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011603	TTTC	2	8	45216	45223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011603	GTCA	2	8	45252	45259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011603	GATT	2	8	45307	45314	25 %	50 %	25 %	0 %	215276226
142	NC_011603	TAAC	2	8	46038	46045	50 %	25 %	0 %	25 %	215276227
143	NC_011603	ATAA	2	8	46115	46122	75 %	25 %	0 %	0 %	215276227
144	NC_011603	CATA	2	8	46234	46241	50 %	25 %	0 %	25 %	215276227
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146	NC_011603	ATCA	2	8	46576	46583	50 %	25 %	0 %	25 %	215276228
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287	NC_011603	CCAT	2	8	95773	95780	25 %	25 %	0 %	50 %	215276279
288	NC_011603	TTAC	2	8	96083	96090	25 %	50 %	0 %	25 %	215276280
289	NC_011603	GACT	2	8	96356	96363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
290	NC_011603	CAGC	2	8	96450	96457	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
291	NC_011603	GAAG	2	8	97788	97795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011603	CATT	2	8	97878	97885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.