MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	TC	3	6	446	451	0 %	50 %	0 %	50 %	215276193
2	NC_011603	CA	3	6	733	738	50 %	0 %	0 %	50 %	215276193
3	NC_011603	AG	3	6	904	909	50 %	0 %	50 %	0 %	215276193
4	NC_011603	TA	3	6	1339	1344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011603	TA	3	6	1549	1554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011603	AT	3	6	2056	2061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011603	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011603	AT	3	6	2527	2532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011603	TA	3	6	3871	3876	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
10	NC_011603	CT	3	6	3985	3990	0 %	50 %	0 %	50 %	215276196
11	NC_011603	GC	3	6	4193	4198	0 %	0 %	50 %	50 %	215276196
12	NC_011603	AT	3	6	4566	4571	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
13	NC_011603	AT	3	6	5021	5026	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
14	NC_011603	TA	3	6	5893	5898	50 %	50 %	0 %	0 %	215276197
15	NC_011603	AT	3	6	6154	6159	50 %	50 %	0 %	0 %	215276197
16	NC_011603	TC	3	6	7303	7308	0 %	50 %	0 %	50 %	215276199
17	NC_011603	TA	3	6	7438	7443	50 %	50 %	0 %	0 %	215276199
18	NC_011603	TA	3	6	7514	7519	50 %	50 %	0 %	0 %	215276199
19	NC_011603	AT	3	6	8262	8267	50 %	50 %	0 %	0 %	215276199
20	NC_011603	AT	3	6	9041	9046	50 %	50 %	0 %	0 %	215276200
21	NC_011603	GA	4	8	9419	9426	50 %	0 %	50 %	0 %	215276200
22	NC_011603	TA	3	6	9571	9576	50 %	50 %	0 %	0 %	215276200
23	NC_011603	AT	3	6	10297	10302	50 %	50 %	0 %	0 %	215276201
24	NC_011603	TA	3	6	10714	10719	50 %	50 %	0 %	0 %	215276202
25	NC_011603	AG	3	6	11072	11077	50 %	0 %	50 %	0 %	215276202
26	NC_011603	CT	3	6	11341	11346	0 %	50 %	0 %	50 %	215276202
27	NC_011603	AT	3	6	11787	11792	50 %	50 %	0 %	0 %	215276203
28	NC_011603	TA	3	6	12501	12506	50 %	50 %	0 %	0 %	215276205
29	NC_011603	GA	3	6	13411	13416	50 %	0 %	50 %	0 %	215276206
30	NC_011603	AT	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	215276207
31	NC_011603	GT	3	6	14150	14155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011603	CA	3	6	15154	15159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011603	AT	3	6	17052	17057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011603	AT	3	6	17705	17710	50 %	50 %	0 %	0 %	215276210
35	NC_011603	GA	3	6	18062	18067	50 %	0 %	50 %	0 %	215276211
36	NC_011603	TA	3	6	18278	18283	50 %	50 %	0 %	0 %	215276211
37	NC_011603	GA	3	6	18592	18597	50 %	0 %	50 %	0 %	215276212
38	NC_011603	TC	3	6	18801	18806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011603	CA	3	6	19093	19098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011603	CG	3	6	19539	19544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011603	GT	3	6	19651	19656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011603	TG	3	6	20025	20030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011603	AT	3	6	20315	20320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011603	CA	3	6	21368	21373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011603	AT	4	8	21797	21804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011603	TG	3	6	21951	21956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011603	AT	3	6	22341	22346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011603	GC	3	6	23024	23029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011603	CA	3	6	23173	23178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011603	CA	3	6	23456	23461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011603	TG	3	6	23813	23818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011603	AG	3	6	23924	23929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011603	GA	3	6	24118	24123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011603	AT	3	6	24788	24793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011603	AT	4	8	25498	25505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011603	AT	3	6	25545	25550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011603	AT	3	6	26153	26158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011603	TA	3	6	26213	26218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011603	AT	4	8	26353	26360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011603	TC	3	6	26478	26483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011603	CG	3	6	26677	26682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011603	CA	3	6	26935	26940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011603	TG	3	6	27024	27029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011603	CT	3	6	27098	27103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011603	CT	3	6	27279	27284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011603	CA	3	6	27722	27727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011603	CG	3	6	28649	28654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011603	TC	3	6	28763	28768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011603	TC	3	6	29447	29452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011603	TC	3	6	29617	29622	0 %	50 %	0 %	50 %	215276213
71	NC_011603	CA	3	6	30009	30014	50 %	0 %	0 %	50 %	215276214
72	NC_011603	GA	3	6	30408	30413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011603	CA	3	6	32347	32352	50 %	0 %	0 %	50 %	215276216
74	NC_011603	TG	3	6	32406	32411	0 %	50 %	50 %	0 %	215276216
75	NC_011603	TG	3	6	32704	32709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011603	CT	3	6	32971	32976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011603	TC	3	6	33248	33253	0 %	50 %	0 %	50 %	215276218
78	NC_011603	CG	3	6	33498	33503	0 %	0 %	50 %	50 %	215276218
79	NC_011603	TG	3	6	34151	34156	0 %	50 %	50 %	0 %	215276218
80	NC_011603	GC	3	6	34618	34623	0 %	0 %	50 %	50 %	215276219
81	NC_011603	TG	3	6	34646	34651	0 %	50 %	50 %	0 %	215276219
82	NC_011603	GA	3	6	34764	34769	50 %	0 %	50 %	0 %	215276219
83	NC_011603	CT	3	6	35429	35434	0 %	50 %	0 %	50 %	215276220
84	NC_011603	CA	3	6	36135	36140	50 %	0 %	0 %	50 %	215276221
85	NC_011603	CT	3	6	37426	37431	0 %	50 %	0 %	50 %	215276222
86	NC_011603	GA	3	6	38338	38343	50 %	0 %	50 %	0 %	215276222
87	NC_011603	TG	3	6	39169	39174	0 %	50 %	50 %	0 %	215276222
88	NC_011603	CT	3	6	39290	39295	0 %	50 %	0 %	50 %	215276222
89	NC_011603	TG	3	6	39790	39795	0 %	50 %	50 %	0 %	215276222
90	NC_011603	CT	3	6	40381	40386	0 %	50 %	0 %	50 %	215276222
91	NC_011603	TG	4	8	41695	41702	0 %	50 %	50 %	0 %	215276222
92	NC_011603	GA	3	6	42382	42387	50 %	0 %	50 %	0 %	215276223
93	NC_011603	AT	3	6	42608	42613	50 %	50 %	0 %	0 %	215276224
94	NC_011603	CA	4	8	42709	42716	50 %	0 %	0 %	50 %	215276224
95	NC_011603	CA	3	6	43778	43783	50 %	0 %	0 %	50 %	215276225
96	NC_011603	GT	3	6	44118	44123	0 %	50 %	50 %	0 %	215276225
97	NC_011603	AT	3	6	44738	44743	50 %	50 %	0 %	0 %	215276225
98	NC_011603	GA	3	6	46086	46091	50 %	0 %	50 %	0 %	215276227
99	NC_011603	AT	3	6	46351	46356	50 %	50 %	0 %	0 %	215276227
100	NC_011603	AG	3	6	46490	46495	50 %	0 %	50 %	0 %	215276227
101	NC_011603	TG	3	6	47876	47881	0 %	50 %	50 %	0 %	215276228
102	NC_011603	AC	3	6	48060	48065	50 %	0 %	0 %	50 %	215276228
103	NC_011603	TG	3	6	48692	48697	0 %	50 %	50 %	0 %	215276228
104	NC_011603	GT	3	6	49850	49855	0 %	50 %	50 %	0 %	215276229
105	NC_011603	TG	3	6	50608	50613	0 %	50 %	50 %	0 %	215276229
106	NC_011603	TC	3	6	51111	51116	0 %	50 %	0 %	50 %	215276230
107	NC_011603	AT	3	6	51174	51179	50 %	50 %	0 %	0 %	215276231
108	NC_011603	GA	3	6	51913	51918	50 %	0 %	50 %	0 %	215276232
109	NC_011603	TG	3	6	52248	52253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011603	AG	3	6	52324	52329	50 %	0 %	50 %	0 %	215276234
111	NC_011603	AT	3	6	52363	52368	50 %	50 %	0 %	0 %	215276234
112	NC_011603	CG	3	6	58810	58815	0 %	0 %	50 %	50 %	215276243
113	NC_011603	TG	3	6	58859	58864	0 %	50 %	50 %	0 %	215276243
114	NC_011603	CA	3	6	59484	59489	50 %	0 %	0 %	50 %	215276243
115	NC_011603	CT	3	6	59747	59752	0 %	50 %	0 %	50 %	215276243
116	NC_011603	GC	3	6	59753	59758	0 %	0 %	50 %	50 %	215276243
117	NC_011603	AC	3	6	60341	60346	50 %	0 %	0 %	50 %	215276243
118	NC_011603	TG	3	6	60461	60466	0 %	50 %	50 %	0 %	215276243
119	NC_011603	CG	3	6	60777	60782	0 %	0 %	50 %	50 %	215276243
120	NC_011603	AG	3	6	62607	62612	50 %	0 %	50 %	0 %	215276247
121	NC_011603	CG	3	6	62920	62925	0 %	0 %	50 %	50 %	215276248
122	NC_011603	GC	3	6	63615	63620	0 %	0 %	50 %	50 %	215276249
123	NC_011603	GC	3	6	64678	64683	0 %	0 %	50 %	50 %	215276250
124	NC_011603	AT	3	6	65622	65627	50 %	50 %	0 %	0 %	215276251
125	NC_011603	AG	3	6	65834	65839	50 %	0 %	50 %	0 %	215276251
126	NC_011603	CT	3	6	66692	66697	0 %	50 %	0 %	50 %	215276254
127	NC_011603	TA	3	6	67475	67480	50 %	50 %	0 %	0 %	215276255
128	NC_011603	CT	3	6	67482	67487	0 %	50 %	0 %	50 %	215276255
129	NC_011603	CA	3	6	67669	67674	50 %	0 %	0 %	50 %	215276255
130	NC_011603	TC	3	6	67915	67920	0 %	50 %	0 %	50 %	215276256
131	NC_011603	GA	3	6	67979	67984	50 %	0 %	50 %	0 %	215276256
132	NC_011603	AT	3	6	68389	68394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011603	CA	4	8	69236	69243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011603	TA	4	8	69304	69311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011603	CT	4	8	70717	70724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011603	GC	3	6	71345	71350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011603	CA	3	6	71937	71942	50 %	0 %	0 %	50 %	215276259
138	NC_011603	CG	3	6	72590	72595	0 %	0 %	50 %	50 %	215276259
139	NC_011603	GA	3	6	72840	72845	50 %	0 %	50 %	0 %	215276259
140	NC_011603	CA	3	6	73296	73301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011603	GC	3	6	73487	73492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011603	TC	3	6	74695	74700	0 %	50 %	0 %	50 %	215276260
143	NC_011603	CG	3	6	74870	74875	0 %	0 %	50 %	50 %	215276260
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145	NC_011603	CG	3	6	76165	76170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011603	CA	3	6	77659	77664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011603	CT	3	6	77758	77763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011603	AG	3	6	79382	79387	50 %	0 %	50 %	0 %	215276265
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.