MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pE2348-2

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011602	TCA	2	6	154	159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274579
2	NC_011602	CGC	2	6	305	310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274579
3	NC_011602	GTG	2	6	433	438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215274579
4	NC_011602	ATC	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274579
5	NC_011602	TCG	2	6	514	519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215274579
6	NC_011602	CAT	2	6	575	580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274579
7	NC_011602	GCG	2	6	591	596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274579
8	NC_011602	GCT	2	6	687	692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215274579
9	NC_011602	GCC	3	9	849	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274579
10	NC_011602	GGC	2	6	923	928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274579
11	NC_011602	GTG	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215274580
12	NC_011602	CGC	2	6	1146	1151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274580
13	NC_011602	TCA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274580
14	NC_011602	AGG	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215274580
15	NC_011602	AGG	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215274580
16	NC_011602	CGG	2	6	1282	1287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274580
17	NC_011602	GCA	2	6	1334	1339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274580
18	NC_011602	CTT	2	6	1451	1456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215274580
19	NC_011602	CGC	2	6	1477	1482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274580
20	NC_011602	GTT	2	6	1551	1556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215274580
21	NC_011602	TGG	2	6	1588	1593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215274580
22	NC_011602	GGC	2	6	1633	1638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274580
23	NC_011602	CAG	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274580
24	NC_011602	GCC	2	6	1828	1833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274581
25	NC_011602	AGA	2	6	1957	1962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215274581
26	NC_011602	TGA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215274581
27	NC_011602	GAT	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215274581
28	NC_011602	ATG	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215274581
29	NC_011602	CAT	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274581
30	NC_011602	CAT	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274581
31	NC_011602	GCC	2	6	2420	2425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274581
32	NC_011602	GAC	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274581
33	NC_011602	GTT	2	6	2813	2818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215274582
34	NC_011602	TCA	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274582
35	NC_011602	GGC	2	6	2844	2849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274582
36	NC_011602	CCG	2	6	2862	2867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274582
37	NC_011602	GCC	2	6	2969	2974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274582
38	NC_011602	TTC	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215274582
39	NC_011602	GCC	2	6	3151	3156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215274582
40	NC_011602	ATG	2	6	3337	3342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215274583
41	NC_011602	TTA	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215274583
42	NC_011602	CAG	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274583
43	NC_011602	TTC	2	6	3386	3391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215274583
44	NC_011602	TGA	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215274583
45	NC_011602	ACT	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274583
46	NC_011602	CCA	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215274583
47	NC_011602	ACC	3	9	3481	3489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215274583
48	NC_011602	CAT	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274583
49	NC_011602	ACC	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215274583
50	NC_011602	CTG	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215274584
51	NC_011602	AGG	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215274584
52	NC_011602	CAG	2	6	4064	4069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274584
53	NC_011602	GCA	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274584
54	NC_011602	GAG	2	6	4151	4156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215274584
55	NC_011602	AAC	2	6	4161	4166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215274584
56	NC_011602	CAA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215274585
57	NC_011602	ACC	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215274585
58	NC_011602	TTC	2	6	4478	4483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215274585
59	NC_011602	GTT	2	6	5075	5080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215274586
60	NC_011602	CAT	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215274586
61	NC_011602	GCA	2	6	5250	5255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274587
62	NC_011602	CAG	2	6	5265	5270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215274587
63	NC_011602	GCG	2	6	5336	5341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215274587
64	NC_011602	AGA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215274587
65	NC_011602	GTG	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215274587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.