MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 chromosome

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011601	GAAAAT	2	12	12067	12078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011601	AAGGGA	2	12	90448	90459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011601	TCGGTA	2	12	156153	156164	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011601	GATAAA	2	12	174201	174212	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011601	GTAGTG	2	12	210386	210397	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011601	TGCGCC	2	12	257086	257097	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011601	TTTTCT	2	12	299916	299927	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011601	CTATTT	2	12	300953	300964	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011601	TGTCTG	2	12	311442	311453	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011601	TGAGGT	2	12	311635	311646	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011601	AAATCG	2	12	322524	322535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011601	TTTATT	2	12	323685	323696	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011601	CTACGG	2	12	352332	352343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011601	AACAAT	2	12	366423	366434	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011601	TATTGA	2	12	369266	369277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011601	TTTTCA	2	12	431395	431406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011601	TTTTCT	2	12	440375	440386	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011601	CAGGCG	2	12	451798	451809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011601	TGGAAA	2	12	475304	475315	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011601	GTTTTC	2	12	515718	515729	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011601	CAAATA	2	12	543722	543733	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011601	CTGGAT	2	12	549594	549605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011601	GAAAAA	2	12	549972	549983	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011601	ATTTTT	2	12	638698	638709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011601	TTTTCT	2	12	708532	708543	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011601	TCGCTG	2	12	739150	739161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011601	TTGTAC	2	12	740027	740038	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011601	CAGAAA	2	12	798262	798273	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011601	CAGAAG	2	12	862563	862574	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011601	TTCATT	2	12	913263	913274	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011601	TAACCG	2	12	921163	921174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011601	AAATAA	2	12	949819	949830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011601	CTGGAA	2	12	959383	959394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011601	AAAGAT	2	12	982157	982168	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011601	TAAGGA	2	12	1018058	1018069	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011601	ATAATG	2	12	1019473	1019484	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011601	GTGATG	2	12	1060106	1060117	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011601	CATTAT	2	12	1060723	1060734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011601	GAGCAG	2	12	1078469	1078480	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011601	GACGCT	2	12	1079764	1079775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011601	TGGTAA	2	12	1097045	1097056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011601	TATAGG	2	12	1126341	1126352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011601	CAGGTA	2	12	1127497	1127508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011601	AAAGCA	2	12	1127706	1127717	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011601	AGTTCC	2	12	1129651	1129662	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011601	AAGCGT	2	12	1150097	1150108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011601	TTTCAT	2	12	1162809	1162820	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011601	GGTCAC	2	12	1169212	1169223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011601	GCACAG	2	12	1169488	1169499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011601	CAAAAA	2	12	1204735	1204746	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011601	TCAATA	2	12	1278782	1278793	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011601	GTTTTT	2	12	1282771	1282782	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011601	ATACTT	2	12	1290893	1290904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011601	GCAGAA	2	12	1308277	1308288	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011601	GGTGAA	2	12	1330992	1331003	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011601	AGGGGG	2	12	1331412	1331423	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011601	CTTATT	2	12	1406257	1406268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011601	CAAAAG	2	12	1413288	1413299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011601	CTGATC	2	12	1423766	1423777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011601	CTTTTT	2	12	1459132	1459143	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011601	TGTCTC	2	12	1479458	1479469	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011601	ACTATA	2	12	1509946	1509957	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011601	TATAAC	2	12	1533340	1533351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011601	TTCTGT	2	12	1574045	1574056	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011601	TAAATT	2	12	1580729	1580740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011601	TACAGC	2	12	1642600	1642611	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011601	GATGTT	2	12	1643970	1643981	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011601	AAAAAC	2	12	1665700	1665711	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011601	CGTTGT	2	12	1667087	1667098	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011601	CCGTTA	2	12	1673272	1673283	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011601	TGGTTA	2	12	1682101	1682112	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011601	AGCAAA	2	12	1700890	1700901	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011601	CAAAAA	2	12	1724863	1724874	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011601	AAAATA	2	12	1826215	1826226	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011601	TGTTTT	2	12	1826848	1826859	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011601	AAGACT	2	12	1827108	1827119	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011601	CGTTTT	2	12	1893697	1893708	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011601	GAACAG	2	12	1911347	1911358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011601	TATTAC	2	12	1976446	1976457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011601	TTTCTT	2	12	1988899	1988910	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011601	ACTGTC	2	12	2036498	2036509	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011601	AATTCA	2	12	2084153	2084164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011601	TCTTAT	2	12	2097971	2097982	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011601	ATTTTT	2	12	2147217	2147228	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011601	GTTGAC	2	12	2161661	2161672	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011601	TTATTG	2	12	2169573	2169584	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011601	TTGAAG	2	12	2171577	2171588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011601	TTTTGT	2	12	2243091	2243102	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011601	GTTTAG	2	12	2263739	2263750	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011601	TGGGAG	2	12	2266562	2266573	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011601	TAATTT	2	12	2321749	2321760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011601	TCTTCC	2	12	2394619	2394630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011601	TAAATG	2	12	2528440	2528451	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011601	TGTCAC	2	12	2542074	2542085	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011601	AGCGGA	2	12	2545222	2545233	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011601	AGAAAA	2	12	2552365	2552376	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011601	GCATTA	2	12	2627902	2627913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011601	GTTAAC	2	12	2632608	2632619	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011601	GTTAAC	2	12	2632672	2632683	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011601	CTGATG	2	12	2651413	2651424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011601	GTTATG	2	12	2669254	2669265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011601	TCGATA	2	12	2679894	2679905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_011601	CAAGTG	2	12	2686236	2686247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_011601	CCATCC	2	12	2713203	2713214	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011601	ACGCGG	2	12	2751871	2751882	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011601	TCACCG	2	12	2753551	2753562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011601	CAGCCA	2	12	2860882	2860893	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011601	TCCTTC	2	12	2874717	2874728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011601	TGAGCG	2	12	2909194	2909205	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011601	TGGACA	2	12	2919203	2919214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011601	CAGTTT	2	12	2933809	2933820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011601	CCGGGT	17	102	2955934	2956035	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011601	AGTTCA	2	12	3002859	3002870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_011601	GTGCAT	2	12	3014080	3014091	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_011601	TGATAT	2	12	3050078	3050089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011601	TGATAT	2	12	3050218	3050229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011601	TGATAT	2	12	3050358	3050369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011601	TCAGAT	2	12	3066117	3066128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011601	GGTTTT	2	12	3149979	3149990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011601	ACAAGA	2	12	3154309	3154320	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011601	TTTGTT	2	12	3179082	3179093	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011601	TAAACG	2	12	3182499	3182510	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_011601	TGAGCA	2	12	3183001	3183012	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011601	TGCCGA	2	12	3251080	3251091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011601	ATCGCG	2	12	3269801	3269812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011601	GTAAGG	2	12	3284476	3284487	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011601	TGGCAT	2	12	3289578	3289589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011601	GTCGCC	2	12	3300200	3300211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011601	ATGCTG	2	12	3352425	3352436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_011601	ATGAAG	2	12	3352849	3352860	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011601	TTTTCG	2	12	3393699	3393710	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_011601	ATTTAA	2	12	3406893	3406904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011601	ATAAAA	2	12	3458496	3458507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011601	ATTTAA	2	12	3469237	3469248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011601	AGTTGT	2	12	3495084	3495095	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011601	CTTTTT	2	12	3500351	3500362	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_011601	AATGAT	2	12	3501186	3501197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011601	TCTCCC	2	12	3523690	3523701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011601	GTAACC	2	12	3551015	3551026	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011601	TTTTAT	2	12	3560786	3560797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011601	AAGCGA	2	12	3566190	3566201	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_011601	CTTTCT	2	12	3589458	3589469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011601	ACAGAA	2	12	3612992	3613003	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_011601	AGCGTT	2	12	3687763	3687774	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_011601	CAGGCA	2	12	3783374	3783385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011601	AATTTA	2	12	3795962	3795973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011601	AAGATA	2	12	3875631	3875642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011601	AGATGC	2	12	3891100	3891111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_011601	ATAATC	2	12	3895531	3895542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_011601	TGAAAA	2	12	3914987	3914998	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011601	GCCAGC	2	12	3956601	3956612	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_011601	CATACT	2	12	3966716	3966727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011601	AAATCC	2	12	3968294	3968305	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_011601	TTTATC	2	12	4018952	4018963	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_011601	GCAATT	2	12	4020923	4020934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_011601	TGGTTC	2	12	4024044	4024055	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_011601	AAAAAG	2	12	4066929	4066940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011601	TCACTG	2	12	4070687	4070698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_011601	TTTATT	2	12	4127490	4127501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011601	CCTTAT	2	12	4133968	4133979	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_011601	CTTTTT	2	12	4237958	4237969	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_011601	AAATGG	2	12	4367256	4367267	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011601	GGGAGT	2	12	4396360	4396371	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011601	ATTCTG	2	12	4397343	4397354	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_011601	ATAAAA	2	12	4416672	4416683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011601	ATTTTT	2	12	4483538	4483549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_011601	TCATTT	2	12	4550567	4550578	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_011601	ATTTAT	2	12	4616111	4616122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011601	GTCTTT	2	12	4624921	4624932	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_011601	AATATC	2	12	4654848	4654859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
171	NC_011601	CTGATA	2	12	4690485	4690496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_011601	TTTTTA	2	12	4740290	4740301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_011601	TTTAAT	2	12	4772135	4772146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_011601	TTTGAG	2	12	4774837	4774848	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_011601	TTTCAC	2	12	4828914	4828925	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_011601	GGGTTA	2	12	4850066	4850077	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_011601	GACACT	2	12	4852036	4852047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_011601	AACAGG	2	12	4882920	4882931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
179	NC_011601	CAAAGC	2	12	4905481	4905492	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_011601	TTATCA	2	12	4930416	4930427	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.