MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 chromosome

Total Repeats: 8711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011601	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011601	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011601	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011601	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011601	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011601	AAG	2	6	7915	7920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011601	CGG	2	6	8047	8052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011601	CGT	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011601	ATC	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011601	TCT	2	6	9939	9944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011601	TTC	2	6	9958	9963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011601	ATC	3	9	11961	11969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011601	AAT	2	6	11983	11988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011601	ATA	2	6	12024	12029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011601	TGG	2	6	13252	13257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011601	CTG	2	6	13286	13291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011601	TGA	2	6	13464	13469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011601	TAG	2	6	13489	13494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011601	ATG	2	6	13580	13585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011601	CCG	2	6	16840	16845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011601	GCT	2	6	17155	17160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011601	AAT	2	6	17231	17236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011601	CAG	2	6	17379	17384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011601	TCA	2	6	17397	17402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011601	TCA	2	6	17500	17505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011601	TAA	2	6	17548	17553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011601	AAT	2	6	18394	18399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011601	ATA	2	6	19905	19910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011601	AAT	2	6	21297	21302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011601	TTC	2	6	21303	21308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011601	TCA	2	6	21349	21354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011601	GCC	2	6	21355	21360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_011601	GAT	2	6	21458	21463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011601	ACA	3	9	23730	23738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011601	CTT	2	6	24071	24076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011601	TGC	2	6	28679	28684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011601	AGC	2	6	30146	30151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011601	TAT	2	6	32194	32199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011601	GTT	2	6	32253	32258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011601	TCT	2	6	32317	32322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011601	TGC	2	6	32323	32328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011601	ATA	2	6	32402	32407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011601	GCC	2	6	32457	32462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011601	TCG	2	6	32476	32481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011601	ATT	2	6	32509	32514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011601	CGC	2	6	37708	37713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011601	GAC	2	6	39135	39140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011601	ATT	2	6	39179	39184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011601	GCG	2	6	42101	42106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011601	ATT	3	9	44938	44946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011601	ATT	2	6	45062	45067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011601	TGT	2	6	45086	45091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011601	ACC	2	6	45232	45237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011601	ACG	2	6	45245	45250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011601	ATT	2	6	50047	50052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011601	GCG	2	6	52566	52571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011601	CAG	2	6	52598	52603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011601	CAT	2	6	52623	52628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011601	CGA	2	6	52641	52646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011601	CAA	2	6	58185	58190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011601	CAT	2	6	60565	60570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011601	GCG	2	6	61686	61691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011601	ACC	2	6	65348	65353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011601	GTG	2	6	65375	65380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011601	AAT	2	6	72052	72057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011601	TAA	2	6	72145	72150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011601	TCT	2	6	72234	72239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011601	AAT	2	6	73233	73238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011601	ATA	2	6	73309	73314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011601	TTA	2	6	75535	75540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011601	CGC	2	6	76546	76551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011601	GTT	2	6	78510	78515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011601	ACC	2	6	78643	78648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011601	ACG	2	6	78663	78668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011601	TCA	2	6	78672	78677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011601	CGC	2	6	79547	79552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011601	AAT	2	6	84693	84698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011601	AGG	2	6	84715	84720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011601	GAA	2	6	84817	84822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011601	ACT	2	6	84851	84856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011601	CAT	2	6	84867	84872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011601	CTG	2	6	84918	84923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011601	TGC	2	6	89951	89956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011601	GGT	2	6	89957	89962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011601	CCG	2	6	89992	89997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011601	AAT	2	6	90026	90031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011601	TGA	2	6	90092	90097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011601	ATT	2	6	90149	90154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011601	GAT	2	6	90231	90236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011601	CAA	2	6	90273	90278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011601	ATT	2	6	90290	90295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011601	GTA	2	6	90301	90306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011601	ATT	2	6	90427	90432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011601	TAT	2	6	91579	91584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011601	GGA	2	6	91604	91609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011601	TCC	2	6	91632	91637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011601	TTA	2	6	91647	91652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011601	TAT	2	6	95248	95253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011601	CTG	2	6	95292	95297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011601	AAT	2	6	95306	95311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011601	ATT	2	6	95339	95344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011601	CTG	2	6	95406	95411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011601	AGA	2	6	95453	95458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011601	TGA	2	6	95537	95542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011601	AAC	2	6	95609	95614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011601	TCC	2	6	95682	95687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_011601	AAG	2	6	106861	106866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011601	CGA	2	6	111374	111379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011601	CCG	2	6	112620	112625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_011601	ATA	2	6	112666	112671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011601	TTA	2	6	114357	114362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011601	ATG	2	6	117587	117592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011601	TCA	2	6	119236	119241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011601	TGA	2	6	119284	119289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011601	ATG	2	6	119381	119386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011601	AGC	2	6	123628	123633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011601	GAA	2	6	123689	123694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011601	CAC	2	6	124709	124714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_011601	ATT	2	6	126137	126142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011601	AAT	2	6	127684	127689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011601	ATT	2	6	127807	127812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011601	TAA	2	6	127820	127825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011601	TAA	2	6	127872	127877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011601	GTT	2	6	127953	127958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011601	AGA	2	6	128880	128885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011601	TGT	2	6	128886	128891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011601	TTA	2	6	128991	128996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011601	TTA	2	6	133645	133650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011601	TGT	2	6	133676	133681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011601	CCG	2	6	133765	133770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_011601	CGC	2	6	135265	135270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_011601	CTG	2	6	137428	137433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011601	GAG	2	6	137484	137489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011601	TCT	2	6	141471	141476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011601	CCT	2	6	142355	142360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_011601	ATA	2	6	142391	142396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011601	AGA	2	6	142819	142824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011601	CGA	2	6	142851	142856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011601	ATT	2	6	142859	142864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_011601	GGT	2	6	235385	235390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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