MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 1723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011593	ACGTC	2	10	883	892	20 %	20 %	20 %	40 %	213690929
2	NC_011593	AAGCA	2	10	1692	1701	60 %	0 %	20 %	20 %	213690929
3	NC_011593	GGTGT	2	10	4187	4196	0 %	40 %	60 %	0 %	213690932
4	NC_011593	CATCG	2	10	4685	4694	20 %	20 %	20 %	40 %	213690932
5	NC_011593	CCGGC	2	10	5258	5267	0 %	0 %	40 %	60 %	213690933
6	NC_011593	CCGCG	2	10	6507	6516	0 %	0 %	40 %	60 %	213690934
7	NC_011593	AAGGC	2	10	7325	7334	40 %	0 %	40 %	20 %	213690934
8	NC_011593	TCGTC	2	10	8557	8566	0 %	40 %	20 %	40 %	213690935
9	NC_011593	AGCTG	2	10	13214	13223	20 %	20 %	40 %	20 %	213690938
10	NC_011593	GCCAC	2	10	13647	13656	20 %	0 %	20 %	60 %	213690939
11	NC_011593	GGCCG	2	10	13673	13682	0 %	0 %	60 %	40 %	213690939
12	NC_011593	GCACG	2	10	13835	13844	20 %	0 %	40 %	40 %	213690939
13	NC_011593	TTCGC	2	10	15510	15519	0 %	40 %	20 %	40 %	213690941
14	NC_011593	TCGCC	2	10	22708	22717	0 %	20 %	20 %	60 %	213690947
15	NC_011593	GGTCG	2	10	24059	24068	0 %	20 %	60 %	20 %	213690949
16	NC_011593	TGCGC	2	10	25571	25580	0 %	20 %	40 %	40 %	213690950
17	NC_011593	GCGCC	2	10	26919	26928	0 %	0 %	40 %	60 %	213690952
18	NC_011593	GGCCA	2	10	28600	28609	20 %	0 %	40 %	40 %	213690953
19	NC_011593	AATCC	2	10	33372	33381	40 %	20 %	0 %	40 %	213690957
20	NC_011593	AAGGG	2	10	33435	33444	40 %	0 %	60 %	0 %	213690957
21	NC_011593	CCGAC	2	10	36715	36724	20 %	0 %	20 %	60 %	213690959
22	NC_011593	ATGGC	2	10	36766	36775	20 %	20 %	40 %	20 %	213690959
23	NC_011593	GCGCG	2	10	42025	42034	0 %	0 %	60 %	40 %	213690963
24	NC_011593	ACTGG	2	10	42751	42760	20 %	20 %	40 %	20 %	213690963
25	NC_011593	CAAAA	2	10	42917	42926	80 %	0 %	0 %	20 %	213690964
26	NC_011593	CGTCA	2	10	44059	44068	20 %	20 %	20 %	40 %	213690964
27	NC_011593	GAAAA	2	10	48013	48022	80 %	0 %	20 %	0 %	213690966
28	NC_011593	TCGGC	2	10	53697	53706	0 %	20 %	40 %	40 %	213690971
29	NC_011593	CGCTG	2	10	53818	53827	0 %	20 %	40 %	40 %	213690971
30	NC_011593	TTGCG	2	10	54992	55001	0 %	40 %	40 %	20 %	213690972
31	NC_011593	CCATT	2	10	60918	60927	20 %	40 %	0 %	40 %	213690975
32	NC_011593	TTCCG	2	10	61807	61816	0 %	40 %	20 %	40 %	213690976
33	NC_011593	GGAAT	2	10	64060	64069	40 %	20 %	40 %	0 %	213690978
34	NC_011593	CGAAT	2	10	65376	65385	40 %	20 %	20 %	20 %	213690979
35	NC_011593	CAGAT	2	10	67935	67944	40 %	20 %	20 %	20 %	213690981
36	NC_011593	GGCGT	2	10	71131	71140	0 %	20 %	60 %	20 %	213690982
37	NC_011593	GGCCT	2	10	71818	71827	0 %	20 %	40 %	40 %	213690983
38	NC_011593	GCGCC	2	10	75225	75234	0 %	0 %	40 %	60 %	213690985
39	NC_011593	CGGCG	2	10	76960	76969	0 %	0 %	60 %	40 %	213690986
40	NC_011593	TTGCG	2	10	79435	79444	0 %	40 %	40 %	20 %	213690989
41	NC_011593	GCCCG	2	10	82159	82168	0 %	0 %	40 %	60 %	213690991
42	NC_011593	CACCG	2	10	82582	82591	20 %	0 %	20 %	60 %	213690992
43	NC_011593	CTCGC	2	10	82976	82985	0 %	20 %	20 %	60 %	213690992
44	NC_011593	GTGGC	3	15	86078	86092	0 %	20 %	60 %	20 %	213690994
45	NC_011593	CCATC	2	10	86910	86919	20 %	20 %	0 %	60 %	213690995
46	NC_011593	CAAGG	2	10	87740	87749	40 %	0 %	40 %	20 %	213690996
47	NC_011593	CCCGG	2	10	89718	89727	0 %	0 %	40 %	60 %	213690998
48	NC_011593	ACCGA	2	10	91169	91178	40 %	0 %	20 %	40 %	213690999
49	NC_011593	ATGCG	2	10	91871	91880	20 %	20 %	40 %	20 %	213690999
50	NC_011593	GCGTG	2	10	92334	92343	0 %	20 %	60 %	20 %	213691000
51	NC_011593	TGACA	2	10	92499	92508	40 %	20 %	20 %	20 %	213691000
52	NC_011593	CTTCA	2	10	92784	92793	20 %	40 %	0 %	40 %	213691000
53	NC_011593	AGCGC	2	10	93101	93110	20 %	0 %	40 %	40 %	213691000
54	NC_011593	TCAGT	2	10	98463	98472	20 %	40 %	20 %	20 %	213691004
55	NC_011593	GTCTT	2	10	98740	98749	0 %	60 %	20 %	20 %	213691005
56	NC_011593	CGGCA	2	10	98820	98829	20 %	0 %	40 %	40 %	213691005
57	NC_011593	GAGGT	2	10	98848	98857	20 %	20 %	60 %	0 %	213691005
58	NC_011593	CTGGT	2	10	102162	102171	0 %	40 %	40 %	20 %	213691007
59	NC_011593	GCTCG	2	10	103183	103192	0 %	20 %	40 %	40 %	213691008
60	NC_011593	ACGCC	2	10	103839	103848	20 %	0 %	20 %	60 %	213691008
61	NC_011593	TCGGT	2	10	104592	104601	0 %	40 %	40 %	20 %	213691009
62	NC_011593	CTGGC	2	10	106849	106858	0 %	20 %	40 %	40 %	213691010
63	NC_011593	GCCGG	2	10	106950	106959	0 %	0 %	60 %	40 %	213691010
64	NC_011593	CCGCG	2	10	109955	109964	0 %	0 %	40 %	60 %	213691012
65	NC_011593	CCACG	2	10	112685	112694	20 %	0 %	20 %	60 %	213691014
66	NC_011593	GCACA	2	10	113893	113902	40 %	0 %	20 %	40 %	213691016
67	NC_011593	CTTGG	2	10	114154	114163	0 %	40 %	40 %	20 %	213691016
68	NC_011593	CCGTG	2	10	114280	114289	0 %	20 %	40 %	40 %	213691016
69	NC_011593	GCAGG	2	10	115574	115583	20 %	0 %	60 %	20 %	213691018
70	NC_011593	CTTGC	2	10	116246	116255	0 %	40 %	20 %	40 %	213691019
71	NC_011593	AACCA	2	10	116550	116559	60 %	0 %	0 %	40 %	213691020
72	NC_011593	GCCGA	2	10	119827	119836	20 %	0 %	40 %	40 %	213691023
73	NC_011593	CAGAC	2	10	120056	120065	40 %	0 %	20 %	40 %	213691023
74	NC_011593	GCCCA	2	10	120169	120178	20 %	0 %	20 %	60 %	213691023
75	NC_011593	TCGAT	2	10	122717	122726	20 %	40 %	20 %	20 %	213691024
76	NC_011593	CGGCG	2	10	123320	123329	0 %	0 %	60 %	40 %	213691024
77	NC_011593	CGGAA	2	10	123701	123710	40 %	0 %	40 %	20 %	213691024
78	NC_011593	ATTCG	2	10	127980	127989	20 %	40 %	20 %	20 %	213691027
79	NC_011593	GGAGG	2	10	128558	128567	20 %	0 %	80 %	0 %	213691028
80	NC_011593	TCGCG	2	10	129318	129327	0 %	20 %	40 %	40 %	213691029
81	NC_011593	TTCAT	2	10	132264	132273	20 %	60 %	0 %	20 %	213691032
82	NC_011593	GCAGG	2	10	135079	135088	20 %	0 %	60 %	20 %	213691034
83	NC_011593	TGAGC	2	10	135230	135239	20 %	20 %	40 %	20 %	213691034
84	NC_011593	GGCGA	2	10	136200	136209	20 %	0 %	60 %	20 %	213691036
85	NC_011593	GACGA	2	10	136428	136437	40 %	0 %	40 %	20 %	213691036
86	NC_011593	GCCGG	2	10	137065	137074	0 %	0 %	60 %	40 %	213691037
87	NC_011593	CCTCG	2	10	139304	139313	0 %	20 %	20 %	60 %	213691038
88	NC_011593	CGCTC	2	10	140710	140719	0 %	20 %	20 %	60 %	213691039
89	NC_011593	GCTGG	2	10	141160	141169	0 %	20 %	60 %	20 %	213691040
90	NC_011593	GGTCG	2	10	142051	142060	0 %	20 %	60 %	20 %	213691041
91	NC_011593	GCTCG	2	10	142903	142912	0 %	20 %	40 %	40 %	213691041
92	NC_011593	TGCCG	2	10	143907	143916	0 %	20 %	40 %	40 %	213691043
93	NC_011593	AAGGC	2	10	144087	144096	40 %	0 %	40 %	20 %	213691044
94	NC_011593	GACCA	2	10	144587	144596	40 %	0 %	20 %	40 %	213691044
95	NC_011593	CCGAC	2	10	148133	148142	20 %	0 %	20 %	60 %	213691046
96	NC_011593	TCGAG	2	10	152818	152827	20 %	20 %	40 %	20 %	213691050
97	NC_011593	GGAAC	2	10	153098	153107	40 %	0 %	40 %	20 %	213691050
98	NC_011593	CGGCA	2	10	153194	153203	20 %	0 %	40 %	40 %	213691050
99	NC_011593	ACCCG	2	10	153296	153305	20 %	0 %	20 %	60 %	213691050
100	NC_011593	CGTGG	2	10	157420	157429	0 %	20 %	60 %	20 %	213691054
101	NC_011593	CATTC	2	10	158482	158491	20 %	40 %	0 %	40 %	213691055
102	NC_011593	ATCGC	2	10	159094	159103	20 %	20 %	20 %	40 %	213691056
103	NC_011593	GGCCG	2	10	162172	162181	0 %	0 %	60 %	40 %	213691058
104	NC_011593	TACGT	2	10	164639	164648	20 %	40 %	20 %	20 %	213691060
105	NC_011593	CGGCG	2	10	166979	166988	0 %	0 %	60 %	40 %	213691061
106	NC_011593	TCGCT	2	10	174164	174173	0 %	40 %	20 %	40 %	213691066
107	NC_011593	TGATG	2	10	175263	175272	20 %	40 %	40 %	0 %	213691067
108	NC_011593	TGAGA	2	10	177433	177442	40 %	20 %	40 %	0 %	213691068
109	NC_011593	CATCC	2	10	179137	179146	20 %	20 %	0 %	60 %	213691070
110	NC_011593	CCTGA	2	10	186525	186534	20 %	20 %	20 %	40 %	213691079
111	NC_011593	TCCGT	2	10	188041	188050	0 %	40 %	20 %	40 %	213691081
112	NC_011593	TGCCT	2	10	189120	189129	0 %	40 %	20 %	40 %	213691081
113	NC_011593	GGCGA	2	10	190160	190169	20 %	0 %	60 %	20 %	213691081
114	NC_011593	GTTGC	2	10	191846	191855	0 %	40 %	40 %	20 %	213691083
115	NC_011593	GACCG	2	10	193617	193626	20 %	0 %	40 %	40 %	213691085
116	NC_011593	CTGCG	2	10	193904	193913	0 %	20 %	40 %	40 %	213691085
117	NC_011593	ATCGT	2	10	196099	196108	20 %	40 %	20 %	20 %	213691088
118	NC_011593	TCGCC	2	10	197113	197122	0 %	20 %	20 %	60 %	213691089
119	NC_011593	CTGTG	2	10	204356	204365	0 %	40 %	40 %	20 %	213691093
120	NC_011593	CAGCC	2	10	205086	205095	20 %	0 %	20 %	60 %	213691094
121	NC_011593	AGCTC	2	10	207958	207967	20 %	20 %	20 %	40 %	213691094
122	NC_011593	GCCGA	2	10	208861	208870	20 %	0 %	40 %	40 %	213691095
123	NC_011593	GCGCG	2	10	209861	209870	0 %	0 %	60 %	40 %	213691096
124	NC_011593	GCCGC	2	10	211092	211101	0 %	0 %	40 %	60 %	213691098
125	NC_011593	GCTCG	2	10	212831	212840	0 %	20 %	40 %	40 %	213691099
126	NC_011593	GATTC	2	10	213492	213501	20 %	40 %	20 %	20 %	213691100
127	NC_011593	ACGCC	2	10	215175	215184	20 %	0 %	20 %	60 %	213691101
128	NC_011593	CTGGC	2	10	216735	216744	0 %	20 %	40 %	40 %	213691102
129	NC_011593	GTCCC	2	10	216831	216840	0 %	20 %	20 %	60 %	213691102
130	NC_011593	TACGA	2	10	223197	223206	40 %	20 %	20 %	20 %	213691108
131	NC_011593	ATGCG	2	10	223418	223427	20 %	20 %	40 %	20 %	213691108
132	NC_011593	GACAG	2	10	224022	224031	40 %	0 %	40 %	20 %	213691109
133	NC_011593	TGTGG	2	10	224037	224046	0 %	40 %	60 %	0 %	213691109
134	NC_011593	CTGGT	2	10	224432	224441	0 %	40 %	40 %	20 %	213691109
135	NC_011593	AGGGC	2	10	225213	225222	20 %	0 %	60 %	20 %	213691110
136	NC_011593	CGCCT	2	10	228134	228143	0 %	20 %	20 %	60 %	213691112
137	NC_011593	GATGT	2	10	230432	230441	20 %	40 %	40 %	0 %	213691114
138	NC_011593	CGCAC	2	10	233593	233602	20 %	0 %	20 %	60 %	213691116
139	NC_011593	GATGC	2	10	235155	235164	20 %	20 %	40 %	20 %	213691117
140	NC_011593	GCATG	2	10	235967	235976	20 %	20 %	40 %	20 %	213691117
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142	NC_011593	GGCCA	2	10	236952	236961	20 %	0 %	40 %	40 %	213691118
143	NC_011593	CGACC	2	10	238879	238888	20 %	0 %	20 %	60 %	213691120
144	NC_011593	ACAAT	2	10	242943	242952	60 %	20 %	0 %	20 %	213691124
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148	NC_011593	CGATG	2	10	249043	249052	20 %	20 %	40 %	20 %	213691127
149	NC_011593	GGCGT	2	10	249791	249800	0 %	20 %	60 %	20 %	213691127
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152	NC_011593	TTGGG	2	10	254052	254061	0 %	40 %	60 %	0 %	213691131
153	NC_011593	GGCAT	2	10	258146	258155	20 %	20 %	40 %	20 %	213691135
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156	NC_011593	CATGG	2	10	263664	263673	20 %	20 %	40 %	20 %	213691140
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167	NC_011593	GCATT	2	10	294093	294102	20 %	40 %	20 %	20 %	213691169
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193	NC_011593	ATGGG	2	10	352120	352129	20 %	20 %	60 %	0 %	213691216
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244	NC_011593	CCACA	2	10	456097	456106	40 %	0 %	0 %	60 %	213691307
245	NC_011593	GTCCT	2	10	459397	459406	0 %	40 %	20 %	40 %	213691309
246	NC_011593	AATCG	2	10	464338	464347	40 %	20 %	20 %	20 %	213691315
247	NC_011593	CTTCG	2	10	465104	465113	0 %	40 %	20 %	40 %	213691316
248	NC_011593	ATCGG	2	10	465649	465658	20 %	20 %	40 %	20 %	213691317
249	NC_011593	CGCGC	2	10	474381	474390	0 %	0 %	40 %	60 %	213691326
250	NC_011593	CGTGG	2	10	476737	476746	0 %	20 %	60 %	20 %	213691327
251	NC_011593	GAAAA	2	10	479021	479030	80 %	0 %	20 %	0 %	213691329
252	NC_011593	GGCGT	2	10	482537	482546	0 %	20 %	60 %	20 %	213691331
253	NC_011593	AAATC	2	10	483789	483798	60 %	20 %	0 %	20 %	213691332
254	NC_011593	AGCGC	2	10	485055	485064	20 %	0 %	40 %	40 %	213691332
255	NC_011593	GCGCC	2	10	486323	486332	0 %	0 %	40 %	60 %	213691333
256	NC_011593	ACTTG	2	10	487530	487539	20 %	40 %	20 %	20 %	213691335
257	NC_011593	AGGCC	2	10	487806	487815	20 %	0 %	40 %	40 %	213691335
258	NC_011593	ACCTG	2	10	488345	488354	20 %	20 %	20 %	40 %	213691335
259	NC_011593	CAAGC	2	10	488496	488505	40 %	0 %	20 %	40 %	213691336
260	NC_011593	CGGCA	2	10	490390	490399	20 %	0 %	40 %	40 %	213691337
261	NC_011593	GGCAG	2	10	494562	494571	20 %	0 %	60 %	20 %	213691339
262	NC_011593	CATAC	2	10	503754	503763	40 %	20 %	0 %	40 %	213691344
263	NC_011593	CGCTG	2	10	504702	504711	0 %	20 %	40 %	40 %	213691344
264	NC_011593	ACTGG	2	10	505375	505384	20 %	20 %	40 %	20 %	213691345
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381	NC_011593	ACACC	2	10	695471	695480	40 %	0 %	0 %	60 %	213691512
382	NC_011593	ACTCC	2	10	696142	696151	20 %	20 %	0 %	60 %	213691512
383	NC_011593	CCCGT	2	10	703224	703233	0 %	20 %	20 %	60 %	213691515
384	NC_011593	CCGAC	2	10	703486	703495	20 %	0 %	20 %	60 %	213691515
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387	NC_011593	CGGGC	2	10	708127	708136	0 %	0 %	60 %	40 %	213691520
388	NC_011593	GCGCG	2	10	710105	710114	0 %	0 %	60 %	40 %	213691521
389	NC_011593	ACTGG	2	10	710831	710840	20 %	20 %	40 %	20 %	213691521
390	NC_011593	GGCGA	2	10	712710	712719	20 %	0 %	60 %	20 %	213691524
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