MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 1197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011593	ACCA	2	8	57	64	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011593	TGTT	2	8	95	102	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011593	GACT	2	8	1750	1757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011593	CGTA	2	8	2379	2386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011593	CAAA	2	8	5314	5321	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011593	CCTC	2	8	7589	7596	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_011593	TGGC	2	8	11384	11391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011593	GGAA	2	8	11458	11465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011593	CGTT	2	8	13345	13352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011593	AGAT	2	8	14798	14805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011593	TCCT	2	8	15728	15735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011593	TTTC	2	8	15871	15878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011593	CCCG	2	8	16131	16138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_011593	TCGC	2	8	16488	16495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011593	TTGT	2	8	18096	18103	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011593	CTTT	2	8	18833	18840	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011593	GCCG	2	8	26639	26646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011593	TTCG	2	8	29044	29051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011593	ACCA	2	8	29198	29205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011593	CCAG	2	8	29208	29215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011593	GACC	2	8	29224	29231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011593	TATG	2	8	30775	30782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011593	GCTG	2	8	32816	32823	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011593	CATT	2	8	34169	34176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011593	AATG	2	8	34289	34296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011593	TCGC	2	8	34917	34924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011593	GGTT	2	8	35200	35207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011593	CTGA	2	8	35523	35530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011593	CTGA	2	8	36205	36212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011593	CGAT	2	8	39143	39150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011593	CGGA	2	8	41407	41414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011593	CGGT	2	8	45854	45861	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011593	CGAT	2	8	46559	46566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011593	GTTT	2	8	46749	46756	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011593	CGGA	2	8	48047	48054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011593	AAGT	2	8	48084	48091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011593	ATCA	2	8	49627	49634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011593	CGGT	2	8	52853	52860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011593	CCAA	2	8	54005	54012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011593	CGGC	2	8	55998	56005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011593	AAGT	2	8	58591	58598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011593	AGAT	2	8	58796	58803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011593	CCTG	2	8	58808	58815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011593	CGTG	2	8	58876	58883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011593	CTAT	2	8	59116	59123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011593	GCAT	2	8	61087	61094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011593	CGCT	2	8	66436	66443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011593	TCGG	2	8	66452	66459	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011593	GACT	2	8	73570	73577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011593	GCAG	2	8	74749	74756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011593	AGGG	2	8	80512	80519	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011593	CATC	2	8	85081	85088	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011593	GGCC	2	8	86801	86808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011593	GATA	2	8	86878	86885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011593	GGCA	2	8	88270	88277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011593	AACT	2	8	108283	108290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011593	GTTC	2	8	110575	110582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011593	TTGC	2	8	110613	110620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011593	GCTC	2	8	111613	111620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011593	TTGA	2	8	114655	114662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011593	CATG	2	8	115812	115819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011593	CCCT	2	8	116415	116422	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_011593	GGCT	2	8	116425	116432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011593	ATCC	2	8	117278	117285	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011593	GGAT	2	8	117322	117329	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011593	GCCT	2	8	117634	117641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011593	GCTG	2	8	117722	117729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011593	TCAA	2	8	119613	119620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011593	GCCG	2	8	124382	124389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011593	ATCC	2	8	124533	124540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011593	CGGG	2	8	129832	129839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011593	CCCG	2	8	129869	129876	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_011593	ATGG	2	8	129959	129966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011593	GCCC	2	8	133675	133682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_011593	CCGT	2	8	134389	134396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011593	GAAA	2	8	135265	135272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011593	CCGG	2	8	136941	136948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011593	CCGT	2	8	138496	138503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011593	ACGG	2	8	148569	148576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011593	GAAA	2	8	148591	148598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011593	AATG	2	8	148758	148765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011593	CCGC	2	8	151735	151742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_011593	AAAG	2	8	151843	151850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011593	CGCC	2	8	153934	153941	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_011593	AAAT	2	8	155542	155549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011593	GGAG	2	8	156666	156673	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011593	CAAG	2	8	156701	156708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011593	TTGC	2	8	158744	158751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011593	TTGG	2	8	158832	158839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011593	CTTG	2	8	166215	166222	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011593	TTCG	2	8	166477	166484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011593	CGCC	2	8	168961	168968	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_011593	TGAG	2	8	169053	169060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011593	ACCG	2	8	169198	169205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011593	GAAC	2	8	169227	169234	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011593	GCCG	2	8	169298	169305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011593	TGTT	2	8	173636	173643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011593	AAAG	2	8	187368	187375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011593	AGGT	2	8	187504	187511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011593	CGGC	2	8	192098	192105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011593	ACTT	2	8	192295	192302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011593	GGAT	2	8	193083	193090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011593	CAAA	2	8	193232	193239	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011593	GTAA	2	8	194057	194064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011593	TACT	2	8	200934	200941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011593	GCAC	2	8	203479	203486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011593	ATGA	2	8	203697	203704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011593	AAGC	2	8	210852	210859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011593	GTCT	2	8	211233	211240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011593	ACTG	2	8	213925	213932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011593	CTGA	2	8	217580	217587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011593	CGAA	2	8	220359	220366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011593	CGTA	2	8	220389	220396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011593	GTCG	2	8	230494	230501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011593	GGCG	2	8	232057	232064	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011593	GGAA	2	8	232171	232178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011593	CAGG	2	8	238615	238622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011593	GCTG	2	8	243336	243343	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011593	TGAT	2	8	248287	248294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011593	CTGG	2	8	248658	248665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011593	GCCG	2	8	248709	248716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011593	CGTG	2	8	250125	250132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011593	ATGA	2	8	257372	257379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011593	AATA	2	8	265095	265102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011593	AAAG	2	8	265536	265543	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011593	GCCG	2	8	267266	267273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011593	GTAA	2	8	281267	281274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011593	CAAT	2	8	281974	281981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011593	GCCG	2	8	283217	283224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011593	GCGA	2	8	290387	290394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011593	AACC	2	8	290397	290404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011593	GTCA	2	8	290640	290647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011593	AGAA	2	8	290878	290885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011593	CAAC	2	8	292169	292176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011593	TCCG	2	8	293744	293751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011593	CTTC	2	8	293837	293844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011593	TTGA	2	8	295026	295033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011593	CATG	2	8	295036	295043	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011593	TTCC	2	8	297777	297784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011593	TCTG	2	8	302802	302809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011593	TGGG	2	8	302902	302909	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011593	TTGG	2	8	303090	303097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011593	GGAA	2	8	305198	305205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011593	TGAG	2	8	314585	314592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011593	CGAA	2	8	314601	314608	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011593	TATT	2	8	317514	317521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011593	GTGG	2	8	319743	319750	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011593	GCCC	2	8	320201	320208	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_011593	ACAA	2	8	321682	321689	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011593	CCGG	2	8	321711	321718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_011593	ACGA	2	8	329315	329322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011593	CCGT	2	8	329359	329366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_011593	GGGA	2	8	341025	341032	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011593	TCCC	2	8	341223	341230	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
155	NC_011593	TGTT	2	8	343359	343366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011593	TTCT	2	8	344896	344903	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_011593	AGCC	2	8	344950	344957	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
158	NC_011593	GAAG	2	8	345180	345187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011593	ATTG	2	8	345350	345357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_011593	GCGG	2	8	347049	347056	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
162	NC_011593	ATTG	2	8	347274	347281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011593	AGTG	2	8	348089	348096	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011593	GATT	2	8	348710	348717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_011593	GCTC	2	8	352063	352070	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_011593	CCGC	2	8	353224	353231	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
169	NC_011593	CGGA	2	8	353232	353239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_011593	TGCC	2	8	354551	354558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
171	NC_011593	GACC	2	8	355467	355474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_011593	TATG	2	8	361650	361657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_011593	GCCG	2	8	368059	368066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_011593	CGGA	2	8	372206	372213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
178	NC_011593	GCCA	2	8	383223	383230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
179	NC_011593	CAGT	2	8	383943	383950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_011593	TGAT	2	8	388077	388084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011593	GATG	2	8	395102	395109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_011593	CCGC	2	8	408228	408235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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191	NC_011593	CCCG	2	8	419116	419123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
192	NC_011593	GCCG	2	8	419181	419188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
193	NC_011593	CCGC	2	8	421728	421735	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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196	NC_011593	CATG	2	8	429398	429405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
197	NC_011593	GAAG	2	8	429710	429717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
198	NC_011593	CGGC	2	8	429802	429809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
199	NC_011593	TCAG	2	8	430090	430097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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201	NC_011593	TTCG	2	8	431125	431132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
202	NC_011593	GATT	2	8	431737	431744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_011593	CTGT	2	8	470518	470525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
221	NC_011593	TGCG	2	8	471099	471106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
222	NC_011593	GGAT	2	8	472166	472173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_011593	GACC	2	8	532957	532964	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
262	NC_011593	TCCT	2	8	538198	538205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_011593	GCCC	2	8	1127266	1127273	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
482	NC_011593	GCCG	2	8	1127294	1127301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_011593	TCGT	2	8	1146295	1146302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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488	NC_011593	GAGG	2	8	1152770	1152777	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_011593	AACC	2	8	1163370	1163377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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