MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 46674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011593	CGG	2	6	48	53	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011593	ATT	2	6	115	120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011593	TGT	2	6	171	176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011593	CCA	2	6	205	210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690929
5	NC_011593	GCC	2	6	243	248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690929
6	NC_011593	GTT	2	6	327	332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690929
7	NC_011593	ACA	2	6	373	378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690929
8	NC_011593	CGG	2	6	505	510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690929
9	NC_011593	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690929
10	NC_011593	CGG	2	6	1019	1024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690929
11	NC_011593	TTC	2	6	1047	1052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690929
12	NC_011593	GCC	2	6	1184	1189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690929
13	NC_011593	TTC	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690929
14	NC_011593	CTT	2	6	1394	1399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690929
15	NC_011593	CAC	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690929
16	NC_011593	CAT	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690929
17	NC_011593	CAC	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690929
18	NC_011593	GCA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690929
19	NC_011593	CTT	2	6	1743	1748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011593	TGG	2	6	1796	1801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011593	GTC	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011593	GAC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011593	CGA	2	6	2011	2016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690930
24	NC_011593	CGG	2	6	2098	2103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690930
25	NC_011593	TGT	2	6	2129	2134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690930
26	NC_011593	CGA	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690930
27	NC_011593	TTA	2	6	2311	2316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213690930
28	NC_011593	CAT	2	6	2347	2352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011593	CGA	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011593	CCA	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690931
31	NC_011593	CTG	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690931
32	NC_011593	GTC	2	6	2936	2941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690931
33	NC_011593	ACC	2	6	3014	3019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690931
34	NC_011593	ACT	2	6	3037	3042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690931
35	NC_011593	TGA	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690931
36	NC_011593	GCT	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690931
37	NC_011593	CGG	2	6	3174	3179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690931
38	NC_011593	CGA	2	6	3196	3201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
39	NC_011593	CAA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690931
40	NC_011593	CCG	2	6	3324	3329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690931
41	NC_011593	CGA	2	6	3337	3342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
42	NC_011593	CGA	2	6	3382	3387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
43	NC_011593	AGG	2	6	3420	3425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690931
44	NC_011593	CCG	2	6	3432	3437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690931
45	NC_011593	GAC	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
46	NC_011593	CAG	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
47	NC_011593	CGA	2	6	3517	3522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
48	NC_011593	AAC	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690931
49	NC_011593	TGG	2	6	3714	3719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690932
50	NC_011593	CCA	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690932
51	NC_011593	TGA	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690932
52	NC_011593	GTG	2	6	3870	3875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690932
53	NC_011593	GTC	2	6	3901	3906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690932
54	NC_011593	ATC	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690932
55	NC_011593	CGC	2	6	3995	4000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690932
56	NC_011593	ATG	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690932
57	NC_011593	TTG	2	6	4091	4096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690932
58	NC_011593	AAT	2	6	4118	4123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213690932
59	NC_011593	CGA	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690932
60	NC_011593	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690932
61	NC_011593	TGA	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690932
62	NC_011593	CGC	2	6	4939	4944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690933
63	NC_011593	TGA	2	6	5006	5011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690933
64	NC_011593	CCA	2	6	5012	5017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690933
65	NC_011593	GCG	2	6	5038	5043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690933
66	NC_011593	GTG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690933
67	NC_011593	CGG	3	9	5293	5301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690933
68	NC_011593	TCG	2	6	5346	5351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011593	AGA	2	6	5393	5398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011593	AGC	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
71	NC_011593	GGC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
72	NC_011593	CAA	2	6	5538	5543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690934
73	NC_011593	CAC	2	6	5686	5691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690934
74	NC_011593	TCG	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690934
75	NC_011593	CGA	2	6	5721	5726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
76	NC_011593	GTG	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690934
77	NC_011593	TGA	2	6	5858	5863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690934
78	NC_011593	CGG	2	6	5877	5882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
79	NC_011593	CGG	4	12	5889	5900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
80	NC_011593	CGG	2	6	5913	5918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
81	NC_011593	ACC	2	6	6118	6123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690934
82	NC_011593	CAG	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
83	NC_011593	CGA	2	6	6201	6206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
84	NC_011593	CGA	2	6	6228	6233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
85	NC_011593	CGG	2	6	6248	6253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
86	NC_011593	TCA	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690934
87	NC_011593	CCG	2	6	6404	6409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
88	NC_011593	ACC	2	6	6427	6432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690934
89	NC_011593	CCA	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690934
90	NC_011593	GGC	2	6	6484	6489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
91	NC_011593	GAG	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690934
92	NC_011593	CGA	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
93	NC_011593	CCG	2	6	6611	6616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
94	NC_011593	TGA	2	6	6707	6712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690934
95	NC_011593	CAT	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690934
96	NC_011593	GCC	2	6	6802	6807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
97	NC_011593	CGC	2	6	6829	6834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
98	NC_011593	CCG	2	6	6851	6856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
99	NC_011593	TCC	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690934
100	NC_011593	ATG	2	6	7033	7038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690934
101	NC_011593	CGG	3	9	7074	7082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
102	NC_011593	TCA	3	9	7127	7135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690934
103	NC_011593	TTC	2	6	7189	7194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690934
104	NC_011593	GAT	2	6	7209	7214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690934
105	NC_011593	CCG	2	6	7217	7222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
106	NC_011593	GCC	2	6	7242	7247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
107	NC_011593	GCC	2	6	7340	7345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
108	NC_011593	ACC	2	6	7417	7422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690934
109	NC_011593	CGC	3	9	7467	7475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
110	NC_011593	CGA	2	6	7479	7484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
111	NC_011593	CGC	2	6	7522	7527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
112	NC_011593	TCC	2	6	7581	7586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_011593	AAC	2	6	7636	7641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011593	ACA	2	6	7656	7661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690935
115	NC_011593	CGA	2	6	7666	7671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
116	NC_011593	AGG	2	6	7713	7718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690935
117	NC_011593	ACC	2	6	7724	7729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690935
118	NC_011593	GCG	2	6	7749	7754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690935
119	NC_011593	GCA	2	6	7777	7782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
120	NC_011593	TCG	2	6	7824	7829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
121	NC_011593	ACG	2	6	7896	7901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
122	NC_011593	ACA	2	6	7926	7931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690935
123	NC_011593	ACC	2	6	7968	7973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690935
124	NC_011593	TCG	2	6	8043	8048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
125	NC_011593	GCC	3	9	8087	8095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690935
126	NC_011593	ACG	2	6	8184	8189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
127	NC_011593	TGC	2	6	8211	8216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
128	NC_011593	CCG	2	6	8250	8255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690935
129	NC_011593	CCA	2	6	8274	8279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690935
130	NC_011593	CGC	2	6	8286	8291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690935
131	NC_011593	CTG	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
132	NC_011593	CAT	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690935
133	NC_011593	CCA	2	6	8412	8417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690935
134	NC_011593	TCA	2	6	8466	8471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690935
135	NC_011593	GAG	2	6	8495	8500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690935
136	NC_011593	TGG	2	6	8520	8525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690935
137	NC_011593	CGA	2	6	8623	8628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
138	NC_011593	GGT	2	6	8689	8694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690935
139	NC_011593	AAC	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690935
140	NC_011593	GCA	2	6	8725	8730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
141	NC_011593	ACC	2	6	8814	8819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690935
142	NC_011593	GAG	2	6	8867	8872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690935
143	NC_011593	GCT	2	6	8983	8988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
144	NC_011593	ATC	2	6	9146	9151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690935
145	NC_011593	CGA	2	6	9154	9159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
146	NC_011593	CGA	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
147	NC_011593	CGA	2	6	9187	9192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
148	NC_011593	CGC	2	6	9194	9199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690935
149	NC_011593	GTG	2	6	9260	9265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690935
150	NC_011593	TCA	2	6	9288	9293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690935
151	NC_011593	CGA	2	6	9307	9312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
152	NC_011593	CGG	2	6	9331	9336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690935
153	NC_011593	GAC	2	6	9368	9373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
154	NC_011593	GTG	2	6	9374	9379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690935
155	NC_011593	CTT	2	6	9385	9390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690935
156	NC_011593	GCT	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
157	NC_011593	TTC	2	6	9419	9424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690935
158	NC_011593	CAA	2	6	9427	9432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690935
159	NC_011593	CTG	2	6	9509	9514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
160	NC_011593	AAG	2	6	9611	9616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690935
161	NC_011593	CGA	2	6	9679	9684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
162	NC_011593	CGA	2	6	9700	9705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
163	NC_011593	GAC	2	6	9737	9742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
164	NC_011593	ATC	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690935
165	NC_011593	CGA	3	9	9787	9795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
166	NC_011593	CCG	2	6	9822	9827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690935
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168	NC_011593	CTG	2	6	9863	9868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
169	NC_011593	GTG	2	6	9911	9916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690935
170	NC_011593	TGG	2	6	10023	10028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690935
171	NC_011593	GTG	2	6	10037	10042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690935
172	NC_011593	CAT	2	6	10066	10071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690935
173	NC_011593	GAG	2	6	10193	10198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690935
174	NC_011593	CGG	2	6	10219	10224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690935
175	NC_011593	AAC	2	6	10274	10279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690935
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177	NC_011593	ACA	2	6	10326	10331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_011593	GGA	2	6	10498	10503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690936
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182	NC_011593	ATT	2	6	10655	10660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213690936
183	NC_011593	TGC	2	6	10689	10694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690936
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194	NC_011593	GAT	2	6	11001	11006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_011593	CGT	2	6	11042	11047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_011593	GAC	2	6	11123	11128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_011593	CGT	2	6	11145	11150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_011593	ATT	2	6	11213	11218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_011593	CGT	2	6	11248	11253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_011593	GCC	2	6	11275	11280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
201	NC_011593	CCA	2	6	11364	11369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
202	NC_011593	TGT	2	6	11412	11417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
203	NC_011593	TCC	2	6	11468	11473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
204	NC_011593	CAA	2	6	11485	11490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
205	NC_011593	TTA	2	6	11491	11496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_011593	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_011593	TGG	2	6	11643	11648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690937
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236	NC_011593	GTG	2	6	13304	13309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
237	NC_011593	TTG	2	6	13339	13344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
238	NC_011593	CCT	2	6	13374	13379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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248	NC_011593	CTC	2	6	14018	14023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690939
249	NC_011593	GCG	2	6	14034	14039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690939
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252	NC_011593	GTA	2	6	14126	14131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690939
253	NC_011593	CGG	2	6	14281	14286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690939
254	NC_011593	GCC	2	6	14390	14395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690939
255	NC_011593	GCC	3	9	14399	14407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690939
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257	NC_011593	TGA	2	6	14461	14466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690939
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273	NC_011593	CCG	2	6	16044	16049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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385	NC_011593	TCG	2	6	23099	23104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690948
386	NC_011593	GCT	3	9	23154	23162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690948
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488	NC_011593	TTG	2	6	28153	28158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
489	NC_011593	CCG	2	6	28160	28165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
490	NC_011593	CGT	2	6	28197	28202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690953
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499	NC_011593	CGC	2	6	28694	28699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690953
500	NC_011593	GCT	2	6	28709	28714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690953

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