MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anoxybacillus flavithermus WK1 chromosome

Total Repeats: 1073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011567	AAATTA	2	12	2937	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212637851
2	NC_011567	GCAAGC	2	12	7772	7783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212637855
3	NC_011567	ATTTTT	2	12	8348	8359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212637855
4	NC_011567	TTAATG	2	12	8799	8810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	212637855
5	NC_011567	TTTCTC	2	12	16294	16305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212637857
6	NC_011567	AACTGG	2	12	18974	18985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212637859
7	NC_011567	ATGTTG	2	12	36206	36217	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212637874
8	NC_011567	ATTTTT	2	12	40150	40161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212637879
9	NC_011567	TTCCTG	2	12	42053	42064	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212637881
10	NC_011567	CTTCCG	2	12	42250	42261	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212637881
11	NC_011567	TCGAAA	2	12	42310	42321	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212637881
12	NC_011567	ACGTGC	2	12	43547	43558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212637882
13	NC_011567	GCCAAA	2	12	46858	46869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	212637885
14	NC_011567	AAAAGA	2	12	47303	47314	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212637886
15	NC_011567	AATTGA	2	12	50795	50806	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212637890
16	NC_011567	TGCGTA	2	12	58196	58207	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212637897
17	NC_011567	TACAAT	2	12	61266	61277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	212637900
18	NC_011567	TGCGGA	2	12	72896	72907	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212637911
19	NC_011567	CAGGAG	2	12	75865	75876	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212637914
20	NC_011567	AGGAAA	2	12	76157	76168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212637914
21	NC_011567	AGCAGG	2	12	77633	77644	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212637915
22	NC_011567	GGGAAA	2	12	82216	82227	50 %	0 %	50 %	0 %	212637922
23	NC_011567	CAAATT	2	12	82261	82272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	212637922
24	NC_011567	GGTGGC	2	12	89122	89133	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	212637923
25	NC_011567	GAGAAG	2	12	91384	91395	50 %	0 %	50 %	0 %	212637926
26	NC_011567	TACGTT	2	12	92248	92259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212637926
27	NC_011567	AAACAG	2	12	92521	92532	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212637926
28	NC_011567	GAAGAG	2	12	95478	95489	50 %	0 %	50 %	0 %	212637928
29	NC_011567	CATACG	2	12	103757	103768	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212637938
30	NC_011567	GATTTT	2	12	104483	104494	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212637940
31	NC_011567	CATTTA	2	12	105001	105012	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212637941
32	NC_011567	TCTGGT	2	12	105066	105077	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212637941
33	NC_011567	AGAAGC	2	12	105591	105602	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	212637942
34	NC_011567	GTTGCT	2	12	106021	106032	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212637942
35	NC_011567	CGTGAA	2	12	113492	113503	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212637947
36	NC_011567	GAAGTT	2	12	114429	114440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212637947
37	NC_011567	AATTAC	2	12	117022	117033	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	212637951
38	NC_011567	AAACAG	2	12	117186	117197	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212637951
39	NC_011567	AAGCTG	2	12	119856	119867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212637952
40	NC_011567	CTTAAT	2	12	121393	121404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212637954
41	NC_011567	CAGCTA	2	12	121783	121794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212637955
42	NC_011567	ATCGTT	2	12	126795	126806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212637966
43	NC_011567	GTTACA	2	12	127599	127610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212637969
44	NC_011567	TGTCGG	2	12	127823	127834	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212637969
45	NC_011567	TGGTGA	2	12	129564	129575	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	212637973
46	NC_011567	GAAATT	2	12	131695	131706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212637976
47	NC_011567	AAAAAG	2	12	134580	134591	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212637981
48	NC_011567	CCTTTT	2	12	142248	142259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212637992
49	NC_011567	ATTTTC	2	12	152838	152849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	212637997
50	NC_011567	GAAGAG	2	12	153493	153504	50 %	0 %	50 %	0 %	212637998
51	NC_011567	GATACA	2	12	157339	157350	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212638001
52	NC_011567	GCTTTT	2	12	157422	157433	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	212638001
53	NC_011567	ATTTTT	2	12	164328	164339	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212638007
54	NC_011567	TTTTTC	2	12	171831	171842	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	212638012
55	NC_011567	ATATGC	2	12	179140	179151	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638018
56	NC_011567	AATCGA	2	12	192556	192567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212638031
57	NC_011567	CGCTTC	2	12	200640	200651	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212638039
58	NC_011567	TTACGA	2	12	202916	202927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638041
59	NC_011567	TTGGTA	2	12	206242	206253	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212638044
60	NC_011567	CATTGA	2	12	210489	210500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638049
61	NC_011567	TTTTAG	2	12	221882	221893	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212638055
62	NC_011567	AGCGAG	2	12	223094	223105	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212638056
63	NC_011567	AACAGA	2	12	227960	227971	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212638061
64	NC_011567	ACTTGT	2	12	232311	232322	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212638065
65	NC_011567	CTGGTA	2	12	235373	235384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638067
66	NC_011567	GTCAAA	2	12	236993	237004	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212638068
67	NC_011567	GCATTT	2	12	240346	240357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212638071
68	NC_011567	GCCTCT	2	12	241902	241913	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212638073
69	NC_011567	CCAGGA	2	12	243536	243547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212638074
70	NC_011567	ACAGCG	2	12	244382	244393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212638075
71	NC_011567	TTGCGC	2	12	244446	244457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212638075
72	NC_011567	GCTTTT	2	12	259373	259384	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	212638084
73	NC_011567	AACAGA	2	12	259393	259404	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212638084
74	NC_011567	GAAAAA	2	12	260748	260759	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212638085
75	NC_011567	ACGATG	2	12	262479	262490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212638087
76	NC_011567	AGAATA	2	12	264734	264745	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	212638089
77	NC_011567	CTTTCT	2	12	264855	264866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212638090
78	NC_011567	TTCGAT	2	12	266416	266427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212638091
79	NC_011567	TGCGGT	2	12	267149	267160	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212638092
80	NC_011567	GAAACA	2	12	268168	268179	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212638093
81	NC_011567	TTTAAA	2	12	274138	274149	50 %	50 %	0 %	0 %	212638097
82	NC_011567	GCAGAT	2	12	274903	274914	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212638098
83	NC_011567	CATGGT	2	12	277359	277370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638100
84	NC_011567	ACAAAC	2	12	277576	277587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212638101
85	NC_011567	TCTGCT	2	12	279439	279450	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212638103
86	NC_011567	ACCAAC	2	12	281349	281360	50 %	0 %	0 %	50 %	212638106
87	NC_011567	GCGTAT	2	12	285486	285497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638109
88	NC_011567	CGGATT	2	12	289061	289072	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638112
89	NC_011567	CGAGTG	2	12	294045	294056	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212638115
90	NC_011567	TATCGG	2	12	294544	294555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638116
91	NC_011567	GAAAGT	2	12	295869	295880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212638116
92	NC_011567	ACGCGA	2	12	296080	296091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212638117
93	NC_011567	GCGATG	2	12	300927	300938	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212638118
94	NC_011567	TGATGG	2	12	308227	308238	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	212638125
95	NC_011567	AAAATA	2	12	308712	308723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	212638125
96	NC_011567	TGGACG	2	12	308826	308837	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212638125
97	NC_011567	TGCTTC	2	12	310534	310545	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212638127
98	NC_011567	CCCATT	2	12	311433	311444	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	212638128
99	NC_011567	GTCGAT	2	12	314677	314688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638131
100	NC_011567	TGAAGA	2	12	316270	316281	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212638133
101	NC_011567	TCATTT	2	12	317738	317749	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	212638134
102	NC_011567	CCAAAA	2	12	319098	319109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212638136
103	NC_011567	GGCTAC	2	12	320756	320767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212638138
104	NC_011567	AAACAT	2	12	320888	320899	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	212638138
105	NC_011567	AAGCGA	2	12	331472	331483	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	212638148
106	NC_011567	CATTGA	2	12	334625	334636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638152
107	NC_011567	GACAAT	2	12	336935	336946	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212638152
108	NC_011567	ATACGT	2	12	337173	337184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638153
109	NC_011567	AAAGGA	2	12	339698	339709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212638155
110	NC_011567	CGATGA	2	12	352200	352211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212638173
111	NC_011567	CATTTG	2	12	353654	353665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212638174
112	NC_011567	TAATGT	2	12	354146	354157	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	212638175
113	NC_011567	AGCGAG	2	12	361569	361580	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212638182
114	NC_011567	GTATGT	2	12	363270	363281	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212638182
115	NC_011567	TTTTTC	2	12	375680	375691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	212638196
116	NC_011567	TTTTAA	2	12	378914	378925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212638200
117	NC_011567	AAAGTA	2	12	381328	381339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	212638204
118	NC_011567	GCGATG	2	12	382031	382042	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212638205
119	NC_011567	ATTGCG	2	12	386706	386717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638209
120	NC_011567	TTGCGA	2	12	386884	386895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638209
121	NC_011567	ATTGTG	2	12	387367	387378	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212638210
122	NC_011567	ACGAAG	2	12	387941	387952	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	212638210
123	NC_011567	TCGCGG	2	12	391299	391310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	212638211
124	NC_011567	AACGCC	2	12	392639	392650	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	212638211
125	NC_011567	GGTGTT	2	12	394111	394122	0 %	50 %	50 %	0 %	212638212
126	NC_011567	CGTTTG	2	12	396931	396942	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212638215
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129	NC_011567	ATGATC	2	12	410422	410433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212638222
130	NC_011567	TTGGAC	2	12	418922	418933	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212638229
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136	NC_011567	GTACGA	2	12	429278	429289	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212638239
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139	NC_011567	TGCTCA	2	12	437222	437233	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212638245
140	NC_011567	GAAACA	2	12	437788	437799	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212638246
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146	NC_011567	TTTATT	2	12	465561	465572	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212638277
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346	NC_011567	ATGGCA	2	12	965243	965254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212638798
347	NC_011567	AAGAAA	2	12	965936	965947	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212638798
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349	NC_011567	CAAAAG	2	12	970598	970609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212638802
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449	NC_011567	TTTCGT	2	12	1202333	1202344	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	212639043
450	NC_011567	TTGCGC	2	12	1210378	1210389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212639050
451	NC_011567	CGGATT	2	12	1212198	1212209	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212639051
452	NC_011567	AAACAA	2	12	1219023	1219034	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	212639055
453	NC_011567	GCTTGT	2	12	1219361	1219372	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212639055
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455	NC_011567	CTTTGA	2	12	1225069	1225080	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212639058
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