MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anoxybacillus flavithermus WK1 chromosome

Total Repeats: 388

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011567	CCCTC	2	10	6479	6488	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_011567	ATTTT	2	10	10128	10137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011567	TCGTG	2	10	11335	11344	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011567	AGTTA	2	10	12507	12516	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011567	GGGAG	2	10	13040	13049	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011567	CTGTT	2	10	15709	15718	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011567	TAAAA	2	10	19660	19669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011567	CGGGA	2	10	21573	21582	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011567	TCGTG	2	10	30037	30046	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011567	AGTTA	2	10	31188	31197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011567	GGGAG	2	10	31721	31730	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011567	CTGTT	2	10	34137	34146	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011567	TTTTA	2	10	34636	34645	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011567	AAAGA	2	10	44282	44291	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011567	TATGA	2	10	73527	73536	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011567	TCGTG	2	10	84839	84848	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011567	AGTTA	2	10	85657	85666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011567	GGGAG	2	10	86190	86199	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011567	CTGTT	2	10	88606	88615	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011567	TTTGA	2	10	108064	108073	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011567	AGAAA	2	10	120333	120342	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011567	ATGAT	2	10	144060	144069	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011567	TCGTG	2	10	145359	145368	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011567	AAAGC	2	10	145976	145985	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011567	AAAGC	2	10	146093	146102	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011567	AGTTA	2	10	146297	146306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011567	GGGAG	2	10	146830	146839	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011567	TTTAG	2	10	161450	161459	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011567	GAAAA	2	10	161736	161745	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011567	CTTTT	2	10	162289	162298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011567	ATTTT	2	10	164835	164844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011567	TAAAT	2	10	167623	167632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011567	TTACA	2	10	169437	169446	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011567	TAATT	2	10	169645	169654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011567	ACCTT	2	10	171283	171292	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011567	AAAAG	2	10	173192	173201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011567	ATGAA	2	10	175688	175697	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011567	TAATT	2	10	175984	175993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011567	TTAAG	2	10	176850	176859	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011567	TAGTT	2	10	209073	209082	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011567	TTATG	2	10	212090	212099	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011567	ATAAA	2	10	212653	212662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011567	ATATA	2	10	212693	212702	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011567	TGATT	2	10	212714	212723	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011567	TGATA	2	10	213602	213611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011567	TCGTG	2	10	215032	215041	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011567	AGTTA	2	10	215836	215845	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011567	GGGAG	2	10	216369	216378	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011567	CGAAA	2	10	219085	219094	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011567	TTTGT	2	10	219232	219241	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011567	GAAAG	2	10	226297	226306	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011567	TAATA	2	10	226378	226387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011567	ATATA	2	10	234464	234473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011567	TTTAA	2	10	234529	234538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011567	TCGTG	2	10	246985	246994	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011567	AGTTA	2	10	247803	247812	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011567	GGGAG	2	10	248336	248345	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011567	CGAAA	2	10	251052	251061	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011567	TGCCT	2	10	254991	255000	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_011567	AGGGA	2	10	266923	266932	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011567	ATGAG	2	10	268343	268352	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011567	ATATA	2	10	276119	276128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011567	ATTTT	2	10	282873	282882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011567	ATAGG	2	10	288659	288668	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011567	CAAAA	2	10	292454	292463	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011567	TTAAG	2	10	313789	313798	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011567	AAAGG	2	10	321982	321991	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011567	TCCTT	2	10	321997	322006	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011567	TATAA	2	10	322092	322101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011567	TGTTT	2	10	337886	337895	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011567	AAATG	2	10	354892	354901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011567	GGGAA	2	10	355231	355240	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011567	AGTTT	2	10	368465	368474	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011567	TGTAG	2	10	380470	380479	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011567	TCGTG	2	10	401298	401307	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011567	AGTTA	2	10	402119	402128	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011567	GGGAG	2	10	402652	402661	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011567	GTAGT	2	10	405508	405517	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011567	ATGTT	2	10	407302	407311	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011567	TTTGA	2	10	436641	436650	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011567	TTTCG	2	10	453743	453752	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011567	TGGGA	2	10	459796	459805	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011567	TAAAA	2	10	481342	481351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011567	ATGCT	2	10	483574	483583	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011567	TATAA	2	10	495742	495751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011567	GAAAA	2	10	506283	506292	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011567	TTTAT	2	10	514736	514745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011567	TAAAA	2	10	516522	516531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011567	TATAA	2	10	525702	525711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011567	ATAAC	2	10	548343	548352	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011567	ACAAA	2	10	561704	561713	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011567	ATTTT	2	10	571237	571246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011567	AAACA	2	10	576598	576607	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011567	TTCGC	2	10	584992	585001	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_011567	CGCTG	2	10	586779	586788	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_011567	ATGCT	2	10	587278	587287	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011567	TTCGC	2	10	587604	587613	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011567	TTGAT	2	10	589377	589386	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011567	TAAAA	2	10	610804	610813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011567	CTTTT	2	10	614051	614060	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011567	TTGAT	2	10	629619	629628	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011567	CTATA	2	10	631634	631643	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011567	TTTTA	2	10	633793	633802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011567	AATGA	2	10	652693	652702	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011567	ATCAA	2	10	685371	685380	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011567	TCACA	2	10	691201	691210	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011567	AGAAA	2	10	700741	700750	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011567	GTCTT	2	10	715195	715204	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011567	ACGTC	2	10	736680	736689	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_011567	TTTGT	2	10	749453	749462	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011567	AGGAA	2	10	751815	751824	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011567	TAAAA	2	10	755705	755714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011567	TCAAC	2	10	772670	772679	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_011567	TTTTG	2	10	782531	782540	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011567	CATAG	2	10	786123	786132	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011567	GAAGG	2	10	789208	789217	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011567	ATACT	2	10	790764	790773	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011567	TAAAA	2	10	794591	794600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011567	TTTGT	2	10	795002	795011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011567	TTTTC	2	10	795906	795915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011567	AGATC	2	10	804531	804540	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011567	TTCGC	2	10	807452	807461	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011567	GGAAA	2	10	807704	807713	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011567	AGAAA	2	10	809039	809048	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011567	AGTTT	2	10	809126	809135	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011567	GTAAA	2	10	809221	809230	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011567	CCCCT	2	10	809921	809930	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_011567	AAAAC	2	10	811041	811050	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011567	CAAAG	2	10	811450	811459	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011567	GTTTT	2	10	813242	813251	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011567	GTAAA	2	10	813795	813804	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011567	GCATC	2	10	814292	814301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_011567	ATTTC	2	10	818083	818092	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011567	GATCG	2	10	818109	818118	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011567	TTTGT	2	10	834715	834724	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011567	CTTTT	2	10	854275	854284	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011567	TTATA	2	10	865344	865353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011567	TAAAA	2	10	871579	871588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011567	AATCA	2	10	890644	890653	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011567	TTGGC	2	10	931903	931912	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011567	AGAGG	2	10	933396	933405	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011567	AAAGA	2	10	935171	935180	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011567	TGAAG	2	10	935710	935719	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011567	CTTAT	2	10	936258	936267	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011567	GATTT	2	10	943767	943776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011567	AAAAC	2	10	964357	964366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_011567	GAAAA	2	10	993496	993505	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011567	ATTTT	2	10	1000196	1000205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_011567	AAAGG	2	10	2256597	2256606	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011567	TTATA	2	10	2270587	2270596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011567	TTTTA	2	10	2274865	2274874	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011567	AAAGC	2	10	2276604	2276613	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
293	NC_011567	ATACA	2	10	2276643	2276652	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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298	NC_011567	TAAAA	2	10	2279034	2279043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.