MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011566	ATCAAG	2	12	7699	7710	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011566	CCTTAT	2	12	75384	75395	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011566	TGAAGG	2	12	77387	77398	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011566	GTTTTA	2	12	85444	85455	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011566	GCTTGA	2	12	92287	92298	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011566	TTTATT	2	12	130190	130201	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011566	ATAAGC	2	12	142218	142229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011566	GCTTAT	2	12	142248	142259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011566	ACCGCC	2	12	142405	142416	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011566	CTTCGG	2	12	157688	157699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011566	CAATAA	2	12	199069	199080	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011566	GCGCTT	2	12	220876	220887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011566	CCTTAT	2	12	222500	222511	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011566	TGAAGG	2	12	224501	224512	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011566	TTTTAT	2	12	236293	236304	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011566	TAGATC	2	12	253696	253707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011566	GTCATT	2	12	286580	286591	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011566	GAGTTG	2	12	343967	343978	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011566	CCATAT	2	12	346138	346149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011566	CGAAAG	2	12	362945	362956	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011566	TTTCTC	2	12	375715	375726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011566	AACATT	2	12	387801	387812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011566	TGTTTT	2	12	445014	445025	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011566	TCCTAT	2	12	456034	456045	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011566	TTAAAT	2	12	490688	490699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011566	ACTAGG	2	12	491570	491581	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011566	GAAGTA	2	12	493627	493638	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011566	TGGAAC	2	12	516729	516740	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011566	AGTATA	2	12	524242	524253	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011566	TTCAAA	2	12	547195	547206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011566	ATAAAA	2	12	551518	551529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011566	GCATTG	2	12	553315	553326	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011566	TAAAAA	2	12	605668	605679	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011566	TTTTTG	2	12	625938	625949	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011566	ATTTTT	2	12	626326	626337	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011566	AGCTTA	2	12	703077	703088	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_011566	TTACTT	2	12	727089	727100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011566	GTTATT	2	12	729532	729543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011566	AAATAC	2	12	798748	798759	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011566	TTTTTA	2	12	865618	865629	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011566	CTGCAT	2	12	889252	889263	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011566	AACCGC	2	12	899183	899194	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011566	ACTTAA	2	12	903379	903390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011566	TATGAG	2	12	925935	925946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011566	TTAGAG	2	12	930938	930949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011566	CTCAGA	2	12	934226	934237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011566	GCAATA	2	12	941848	941859	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011566	ATCATT	2	12	956580	956591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011566	ATTTAA	2	12	965630	965641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011566	GAAAGA	2	12	968953	968964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011566	ATTTTT	2	12	1004031	1004042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011566	TTATTT	2	12	1015162	1015173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011566	AAGTAA	2	12	1081124	1081135	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011566	TGATAA	2	12	1107482	1107493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011566	ATTGTC	2	12	1131281	1131292	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011566	GTTTTT	2	12	1137962	1137973	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011566	TGGTTA	2	12	1144520	1144531	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011566	TATTAG	2	12	1145808	1145819	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011566	TTTTAG	2	12	1157711	1157722	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011566	TTTTTA	2	12	1181653	1181664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011566	TAAAAA	2	12	1184588	1184599	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011566	GTGTTT	2	12	1188708	1188719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011566	ATCTAA	2	12	1241181	1241192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011566	CTTAGG	2	12	1242832	1242843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011566	AAATTT	2	12	1243889	1243900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011566	AGAGTT	2	12	1247020	1247031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011566	TATCCT	2	12	1265462	1265473	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011566	TGGTGC	2	12	1302806	1302817	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011566	ATATTT	2	12	1322482	1322493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011566	CAGTGG	2	12	1336380	1336391	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_011566	AAAAGG	2	12	1363191	1363202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011566	TTTTAT	2	12	1402278	1402289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011566	TAGGGA	2	12	1432849	1432860	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011566	GTTTGT	2	12	1467568	1467579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011566	AGTTTT	2	12	1467585	1467596	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011566	TGATTA	2	12	1473776	1473787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011566	AGTTTA	2	12	1505312	1505323	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011566	AAGATT	2	12	1603846	1603857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011566	AATGTT	2	12	1617293	1617304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011566	ATGCTT	2	12	1646322	1646333	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011566	TTGTGT	2	12	1693752	1693763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011566	TTTTAA	2	12	1712485	1712496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011566	GTACAA	2	12	1716652	1716663	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011566	GGGGCG	2	12	1725191	1725202	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011566	TTAAAG	2	12	1789971	1789982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011566	TTTAGG	2	12	1801471	1801482	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011566	CAAATG	2	12	1804965	1804976	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_011566	TAAAAT	2	12	1851711	1851722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011566	GTTTAT	2	12	1854004	1854015	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011566	TTATTT	2	12	1861809	1861820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011566	CGGGTA	2	12	1869171	1869182	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011566	ACTATT	2	12	1887348	1887359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011566	GTTTTT	2	12	1909893	1909904	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011566	ACTTCC	2	12	1923419	1923430	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011566	TTACAT	2	12	1933956	1933967	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011566	GAATGA	2	12	1943663	1943674	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011566	AGCCAG	2	12	1959311	1959322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011566	AGCGAT	2	12	2034212	2034223	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011566	CTGTAT	2	12	2041704	2041715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011566	TTTCTA	2	12	2043909	2043920	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011566	CCTTAT	2	12	2062070	2062081	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011566	TGAAGG	2	12	2064071	2064082	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011566	CCTTAT	2	12	2116288	2116299	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011566	TGAAGG	2	12	2118289	2118300	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011566	ATTATC	2	12	2167807	2167818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011566	CTTATT	2	12	2202512	2202523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_011566	ATGGCT	2	12	2219076	2219087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011566	CATATT	2	12	2224706	2224717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_011566	TAAAGG	2	12	2264522	2264533	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011566	ATTTTA	2	12	2275017	2275028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011566	GCGCTT	2	12	2334543	2334554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011566	CCTTAT	2	12	2336168	2336179	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011566	TGAAGG	2	12	2338169	2338180	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011566	ATTGCT	2	12	2340631	2340642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_011566	TATAAA	2	12	2385120	2385131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011566	GCTTAA	2	12	2413070	2413081	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011566	AGAACC	2	12	2455632	2455643	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011566	TTGTGT	2	12	2466812	2466823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011566	TGAACT	2	12	2508512	2508523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_011566	ATTATA	2	12	2552612	2552623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011566	TAGAAA	2	12	2576874	2576885	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011566	ATAGTA	2	12	2612248	2612259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011566	TTGTTA	2	12	2639391	2639402	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011566	CATTTT	2	12	2663771	2663782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_011566	AATTAA	2	12	2666085	2666096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011566	ATAGTC	2	12	2695696	2695707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011566	AATAAA	2	12	2768624	2768635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011566	ATGAGA	2	12	2791877	2791888	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011566	TATAAA	2	12	2794041	2794052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011566	AAATAA	2	12	2871518	2871529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011566	TTGTTA	2	12	2913875	2913886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_011566	ATAAGG	2	12	5361984	5361995	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.