MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011566	TGATC	2	10	121	130	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011566	GATCA	2	10	223	232	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011566	TCAAC	2	10	947	956	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011566	AGTTA	2	10	27562	27571	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011566	ATGGG	2	10	30944	30953	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011566	GCTAA	2	10	56807	56816	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011566	GTTAG	2	10	60143	60152	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011566	TACGA	2	10	76113	76122	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011566	AGTCG	2	10	77282	77291	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011566	CAGGG	2	10	77507	77516	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011566	AGGCT	2	10	77611	77620	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011566	TGGAG	2	10	78327	78336	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011566	ATTGA	2	10	86087	86096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011566	ATGGC	2	10	100296	100305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011566	GTTCT	2	10	100663	100672	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011566	GTTGA	2	10	110770	110779	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011566	AGCGT	2	10	111415	111424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011566	TTTAA	2	10	111711	111720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011566	TGTGC	2	10	116516	116525	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011566	GCGAT	2	10	122255	122264	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011566	AACGG	2	10	130661	130670	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011566	AAGTG	2	10	130765	130774	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011566	AGCAA	2	10	138125	138134	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011566	TAAAA	2	10	143823	143832	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011566	TAGCC	2	10	145352	145361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011566	AATTG	2	10	160629	160638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011566	TTCAA	2	10	162108	162117	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011566	TTCAA	2	10	181127	181136	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011566	TGGGC	2	10	188770	188779	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011566	CTACT	2	10	193933	193942	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011566	TTTTG	2	10	194592	194601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011566	CTTTA	2	10	194620	194629	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011566	ATAAA	2	10	216114	216123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011566	TACGA	2	10	223229	223238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011566	AGTCG	2	10	224396	224405	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011566	CAGGG	2	10	224621	224630	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011566	AGGCT	2	10	224725	224734	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011566	ATTCA	2	10	227064	227073	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011566	TTATT	2	10	237792	237801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011566	TAAAA	2	10	250950	250959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011566	CTAAG	2	10	258893	258902	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011566	GCGTA	2	10	265390	265399	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011566	TCTTA	2	10	281007	281016	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011566	TGTTT	2	10	281040	281049	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011566	AACAA	2	10	288163	288172	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011566	AAGCG	2	10	288522	288531	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011566	TAAGG	2	10	312503	312512	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011566	AATGG	2	10	322097	322106	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011566	TGGGT	2	10	344021	344030	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011566	ATTTT	2	10	350203	350212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011566	TTGAA	2	10	366622	366631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011566	TAGTG	2	10	382039	382048	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011566	ATTCA	2	10	425744	425753	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011566	AATAT	2	10	430957	430966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011566	AAGGG	2	10	433786	433795	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011566	TTGAA	2	10	442214	442223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011566	TTTGT	2	10	444952	444961	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011566	TAATT	2	10	449614	449623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011566	TATAT	2	10	459385	459394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011566	TAAAA	2	10	462674	462683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011566	GAAAA	2	10	475093	475102	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011566	TAACT	2	10	475267	475276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011566	TTGAA	2	10	475948	475957	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011566	GAAGA	2	10	488701	488710	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011566	GGAGG	2	10	490353	490362	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011566	TTTCA	2	10	493764	493773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011566	TTGAT	2	10	502915	502924	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011566	AATTT	2	10	505410	505419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011566	AATTT	2	10	529199	529208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011566	CAATT	2	10	541001	541010	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011566	CCTAA	2	10	544338	544347	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_011566	TTCAA	2	10	553736	553745	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011566	AAGGC	2	10	555191	555200	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011566	TAAAC	2	10	572719	572728	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011566	TTGAA	2	10	592105	592114	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011566	GAATT	2	10	606330	606339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011566	TTGGT	2	10	623806	623815	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011566	ATTTA	2	10	623939	623948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011566	AATAA	2	10	626090	626099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011566	TTGAA	2	10	629875	629884	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011566	TCTCC	2	10	629998	630007	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_011566	TTCAA	2	10	637219	637228	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011566	TGTAA	2	10	640094	640103	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011566	TTTCA	2	10	653571	653580	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011566	TAAAG	2	10	660616	660625	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011566	TTTAA	2	10	714441	714450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011566	TAATT	2	10	714461	714470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011566	CTGCT	2	10	720594	720603	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011566	TTTCA	2	10	727191	727200	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011566	TAAAG	2	10	727236	727245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011566	GTTTA	2	10	736531	736540	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011566	GGCAC	2	10	736554	736563	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_011566	TTAAA	2	10	737442	737451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011566	ATGAA	2	10	757918	757927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011566	CAGAT	2	10	758944	758953	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011566	AAATA	2	10	760413	760422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011566	TTTGT	2	10	764006	764015	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011566	TAAAA	2	10	782497	782506	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011566	TAAAA	2	10	782654	782663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011566	AGTTC	2	10	783855	783864	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011566	AGCTT	2	10	804331	804340	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011566	TTCAA	2	10	819535	819544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011566	TAAGG	2	10	826648	826657	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011566	ACTGC	2	10	829891	829900	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_011566	TTCAA	2	10	831712	831721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011566	GGATA	2	10	843807	843816	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011566	AGCGA	2	10	844335	844344	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011566	TTTTA	2	10	849338	849347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011566	TAAAA	2	10	862593	862602	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011566	TAAAA	2	10	873502	873511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011566	CACTA	2	10	890870	890879	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_011566	AAGTA	2	10	893520	893529	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011566	GCTAT	2	10	895203	895212	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011566	CTTTC	2	10	901468	901477	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_011566	CGAGC	2	10	908707	908716	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011566	AAGCA	2	10	912825	912834	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011566	ATTAT	2	10	920970	920979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011566	TTTAA	2	10	920981	920990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011566	GTTAA	2	10	944003	944012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011566	GTTTT	2	10	944204	944213	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011566	TCGAC	2	10	944944	944953	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_011566	ATTTA	2	10	947002	947011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011566	TTCAA	2	10	951600	951609	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011566	ATAAA	2	10	969006	969015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011566	GTTAG	2	10	969773	969782	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011566	CAATT	2	10	1011214	1011223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011566	TAGTG	2	10	1030514	1030523	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011566	AAAAG	2	10	1033772	1033781	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011566	CAAAT	2	10	1034009	1034018	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011566	GTGCA	2	10	1034210	1034219	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011566	AGCTA	2	10	1034577	1034586	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011566	CTGTG	2	10	1040824	1040833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011566	TTATT	2	10	1043867	1043876	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011566	ATATT	2	10	1046643	1046652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011566	TTCAA	2	10	1061998	1062007	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011566	AAATG	2	10	1064944	1064953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011566	TTTAA	2	10	1090311	1090320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011566	TTTTA	2	10	1101714	1101723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011566	TGAGT	2	10	1102010	1102019	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011566	TTCAA	2	10	1105324	1105333	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011566	TCAAA	2	10	1105876	1105885	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_011566	CAAAA	2	10	1105944	1105953	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011566	AGGTA	2	10	1108217	1108226	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011566	ATAAA	2	10	1108450	1108459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011566	ATTGC	2	10	1109958	1109967	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011566	TTGAA	2	10	1112975	1112984	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_011566	TTTGC	2	10	1387497	1387506	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_011566	TTGAA	2	10	2000133	2000142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
285	NC_011566	AGCTT	2	10	2000224	2000233	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_011566	AGATG	2	10	2000641	2000650	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
287	NC_011566	TGCCT	2	10	2005313	2005322	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_011566	ATTGA	2	10	2016695	2016704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_011566	TTCAA	2	10	2022377	2022386	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_011566	TTGAA	2	10	2040011	2040020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011566	TATAA	2	10	2040066	2040075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_011566	GTTTG	2	10	2060212	2060221	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_011566	AGTCG	2	10	2118184	2118193	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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359	NC_011566	GCTTT	2	10	2608168	2608177	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_011566	TTGAA	2	10	2867388	2867397	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_011566	TTGAA	2	10	2879325	2879334	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
404	NC_011566	TTGAA	2	10	2879405	2879414	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_011566	AAATT	2	10	2914032	2914041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_011566	CTATT	2	10	2920077	2920086	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
410	NC_011566	AACTA	2	10	2927669	2927678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_011566	TTGAA	2	10	2953947	2953956	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_011566	CTTTC	2	10	3000665	3000674	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
417	NC_011566	ACAAA	2	10	3011211	3011220	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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419	NC_011566	GAAAG	2	10	3018384	3018393	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
420	NC_011566	AACCT	2	10	3021491	3021500	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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487	NC_011566	AGAGT	2	10	3574632	3574641	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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