MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011565	CTTTC	2	10	3569	3578	0 %	60 %	0 %	40 %	212550360
2	NC_011565	TTGTA	2	10	3941	3950	20 %	60 %	20 %	0 %	212550360
3	NC_011565	TAAAT	2	10	4340	4349	60 %	40 %	0 %	0 %	212550360
4	NC_011565	ATTTT	2	10	5776	5785	20 %	80 %	0 %	0 %	212550361
5	NC_011565	TCTTG	2	10	6229	6238	0 %	60 %	20 %	20 %	212550361
6	NC_011565	AAAGT	2	10	6326	6335	60 %	20 %	20 %	0 %	212550361
7	NC_011565	ACTAC	2	10	8145	8154	40 %	20 %	0 %	40 %	212550362
8	NC_011565	AAATA	2	10	8674	8683	80 %	20 %	0 %	0 %	212550362
9	NC_011565	ATCAC	2	10	9156	9165	40 %	20 %	0 %	40 %	212550362
10	NC_011565	TATTT	2	10	10631	10640	20 %	80 %	0 %	0 %	212550362
11	NC_011565	TCCAC	2	10	10731	10740	20 %	20 %	0 %	60 %	212550362
12	NC_011565	TTTTC	2	10	10968	10977	0 %	80 %	0 %	20 %	212550362
13	NC_011565	CTCAT	2	10	11104	11113	20 %	40 %	0 %	40 %	212550363
14	NC_011565	TTCTT	2	10	11835	11844	0 %	80 %	0 %	20 %	212550363
15	NC_011565	GATTT	2	10	12134	12143	20 %	60 %	20 %	0 %	212550363
16	NC_011565	AATCA	2	10	13524	13533	60 %	20 %	0 %	20 %	212550363
17	NC_011565	TACAT	2	10	14317	14326	40 %	40 %	0 %	20 %	212550363
18	NC_011565	CGCTC	2	10	14464	14473	0 %	20 %	20 %	60 %	212550363
19	NC_011565	AAGTA	2	10	16142	16151	60 %	20 %	20 %	0 %	212550366
20	NC_011565	CTTTA	2	10	18788	18797	20 %	60 %	0 %	20 %	212550370
21	NC_011565	CTTCA	2	10	18842	18851	20 %	40 %	0 %	40 %	212550370
22	NC_011565	ATTTC	2	10	22286	22295	20 %	60 %	0 %	20 %	212550372
23	NC_011565	GAAAA	2	10	22685	22694	80 %	0 %	20 %	0 %	212550372
24	NC_011565	ATTTC	2	10	23254	23263	20 %	60 %	0 %	20 %	212550373
25	NC_011565	ATTTA	2	10	23453	23462	40 %	60 %	0 %	0 %	212550373
26	NC_011565	TTTCC	2	10	23974	23983	0 %	60 %	0 %	40 %	212550373
27	NC_011565	AACAA	2	10	25736	25745	80 %	0 %	0 %	20 %	212550376
28	NC_011565	AATAC	2	10	26186	26195	60 %	20 %	0 %	20 %	212550377
29	NC_011565	ACGAA	2	10	26688	26697	60 %	0 %	20 %	20 %	212550377
30	NC_011565	TCATT	2	10	26999	27008	20 %	60 %	0 %	20 %	212550377
31	NC_011565	TTTTC	2	10	27080	27089	0 %	80 %	0 %	20 %	212550377
32	NC_011565	TAGAA	2	10	29458	29467	60 %	20 %	20 %	0 %	212550380
33	NC_011565	GTATT	2	10	29544	29553	20 %	60 %	20 %	0 %	212550380
34	NC_011565	GAAGC	2	10	30307	30316	40 %	0 %	40 %	20 %	212550381
35	NC_011565	TTGTT	2	10	30658	30667	0 %	80 %	20 %	0 %	212550381
36	NC_011565	TCCAT	2	10	30716	30725	20 %	40 %	0 %	40 %	212550381
37	NC_011565	GTTAT	2	10	31265	31274	20 %	60 %	20 %	0 %	212550382
38	NC_011565	CAAAG	2	10	31902	31911	60 %	0 %	20 %	20 %	212550382
39	NC_011565	TAAAT	2	10	36659	36668	60 %	40 %	0 %	0 %	212550385
40	NC_011565	ATGGA	2	10	36980	36989	40 %	20 %	40 %	0 %	212550385
41	NC_011565	AAAAC	2	10	44414	44423	80 %	0 %	0 %	20 %	212550391
42	NC_011565	GCAAT	2	10	46151	46160	40 %	20 %	20 %	20 %	212550393
43	NC_011565	GATTA	2	10	51742	51751	40 %	40 %	20 %	0 %	212550398
44	NC_011565	AGCAA	2	10	51782	51791	60 %	0 %	20 %	20 %	212550398
45	NC_011565	AAACA	2	10	52028	52037	80 %	0 %	0 %	20 %	212550399
46	NC_011565	TTTTC	2	10	56030	56039	0 %	80 %	0 %	20 %	212550401
47	NC_011565	CCTCC	2	10	59120	59129	0 %	20 %	0 %	80 %	212550405
48	NC_011565	CCAAT	2	10	59528	59537	40 %	20 %	0 %	40 %	212550405
49	NC_011565	TATCT	2	10	65042	65051	20 %	60 %	0 %	20 %	212550407
50	NC_011565	AAAAT	2	10	65632	65641	80 %	20 %	0 %	0 %	212550407
51	NC_011565	CACCT	2	10	66232	66241	20 %	20 %	0 %	60 %	212550408
52	NC_011565	TCAAA	2	10	68216	68225	60 %	20 %	0 %	20 %	212550409
53	NC_011565	AAGGG	2	10	71221	71230	40 %	0 %	60 %	0 %	212550410
54	NC_011565	ACAAA	2	10	72148	72157	80 %	0 %	0 %	20 %	212550410
55	NC_011565	CGAAT	2	10	73406	73415	40 %	20 %	20 %	20 %	212550411
56	NC_011565	TACAA	2	10	76966	76975	60 %	20 %	0 %	20 %	212550414
57	NC_011565	AAAAC	2	10	78836	78845	80 %	0 %	0 %	20 %	212550415
58	NC_011565	CCCAA	2	10	79842	79851	40 %	0 %	0 %	60 %	212550416
59	NC_011565	TCATT	2	10	81821	81830	20 %	60 %	0 %	20 %	212550417
60	NC_011565	ATCCC	2	10	83368	83377	20 %	20 %	0 %	60 %	212550418
61	NC_011565	TGACA	2	10	85322	85331	40 %	20 %	20 %	20 %	212550419
62	NC_011565	AGTTT	2	10	87900	87909	20 %	60 %	20 %	0 %	212550422
63	NC_011565	CAATT	2	10	88461	88470	40 %	40 %	0 %	20 %	212550422
64	NC_011565	AAAAG	2	10	88863	88872	80 %	0 %	20 %	0 %	212550423
65	NC_011565	ATATT	2	10	90132	90141	40 %	60 %	0 %	0 %	212550424
66	NC_011565	ATTCT	2	10	91353	91362	20 %	60 %	0 %	20 %	212550424
67	NC_011565	TACTT	2	10	91559	91568	20 %	60 %	0 %	20 %	212550424
68	NC_011565	GAAAT	2	10	94849	94858	60 %	20 %	20 %	0 %	212550430
69	NC_011565	AATAA	2	10	96587	96596	80 %	20 %	0 %	0 %	212550432
70	NC_011565	CTCTA	2	10	98903	98912	20 %	40 %	0 %	40 %	212550436
71	NC_011565	TACCC	2	10	99099	99108	20 %	20 %	0 %	60 %	212550436
72	NC_011565	TTTTC	2	10	99199	99208	0 %	80 %	0 %	20 %	212550436
73	NC_011565	CTTTC	2	10	103968	103977	0 %	60 %	0 %	40 %	212550446
74	NC_011565	ACTTC	2	10	109995	110004	20 %	40 %	0 %	40 %	212550454
75	NC_011565	ATTTC	2	10	110310	110319	20 %	60 %	0 %	20 %	212550455
76	NC_011565	CTTCC	2	10	110695	110704	0 %	40 %	0 %	60 %	212550455
77	NC_011565	CAAAC	2	10	113478	113487	60 %	0 %	0 %	40 %	212550457
78	NC_011565	GGGTA	2	10	113704	113713	20 %	20 %	60 %	0 %	212550457
79	NC_011565	ATTTT	2	10	121714	121723	20 %	80 %	0 %	0 %	212550461
80	NC_011565	TTTTC	2	10	122728	122737	0 %	80 %	0 %	20 %	212550461
81	NC_011565	AACAT	2	10	123682	123691	60 %	20 %	0 %	20 %	212550462
82	NC_011565	AATTA	2	10	124302	124311	60 %	40 %	0 %	0 %	212550462
83	NC_011565	TGAAT	2	10	124769	124778	40 %	40 %	20 %	0 %	212550462
84	NC_011565	AAACA	2	10	125003	125012	80 %	0 %	0 %	20 %	212550462
85	NC_011565	AACAA	2	10	125164	125173	80 %	0 %	0 %	20 %	212550463
86	NC_011565	GCTTT	2	10	126761	126770	0 %	60 %	20 %	20 %	212550465
87	NC_011565	GAATA	2	10	129350	129359	60 %	20 %	20 %	0 %	212550467
88	NC_011565	GATAG	2	10	129978	129987	40 %	20 %	40 %	0 %	212550467
89	NC_011565	AATAT	2	10	132669	132678	60 %	40 %	0 %	0 %	212550469
90	NC_011565	GATTC	2	10	133044	133053	20 %	40 %	20 %	20 %	212550469
91	NC_011565	ATAGA	2	10	134692	134701	60 %	20 %	20 %	0 %	212550472
92	NC_011565	CGATT	2	10	135491	135500	20 %	40 %	20 %	20 %	212550473
93	NC_011565	TGGTA	2	10	135985	135994	20 %	40 %	40 %	0 %	212550473
94	NC_011565	TTCTT	2	10	137339	137348	0 %	80 %	0 %	20 %	212550474
95	NC_011565	AAAAG	2	10	137349	137358	80 %	0 %	20 %	0 %	212550474
96	NC_011565	GTATT	2	10	139463	139472	20 %	60 %	20 %	0 %	212550476
97	NC_011565	AGCAA	2	10	141417	141426	60 %	0 %	20 %	20 %	212550478
98	NC_011565	TGGAT	2	10	142684	142693	20 %	40 %	40 %	0 %	212550479
99	NC_011565	AGTAT	2	10	143038	143047	40 %	40 %	20 %	0 %	212550479
100	NC_011565	TGATT	2	10	145589	145598	20 %	60 %	20 %	0 %	212550484
101	NC_011565	ATAAG	2	10	145638	145647	60 %	20 %	20 %	0 %	212550484
102	NC_011565	ACAAT	2	10	146270	146279	60 %	20 %	0 %	20 %	212550484
103	NC_011565	CAAAA	2	10	146332	146341	80 %	0 %	0 %	20 %	212550484
104	NC_011565	CAAAA	2	10	147419	147428	80 %	0 %	0 %	20 %	212550485
105	NC_011565	AAACA	2	10	149868	149877	80 %	0 %	0 %	20 %	212550487
106	NC_011565	AAACC	2	10	150295	150304	60 %	0 %	0 %	40 %	212550487
107	NC_011565	TTGTA	2	10	157863	157872	20 %	60 %	20 %	0 %	212550495
108	NC_011565	ACAAT	2	10	157882	157891	60 %	20 %	0 %	20 %	212550495
109	NC_011565	AACAA	2	10	159224	159233	80 %	0 %	0 %	20 %	212550496
110	NC_011565	CTATC	2	10	160350	160359	20 %	40 %	0 %	40 %	212550496
111	NC_011565	ATGAG	2	10	160361	160370	40 %	20 %	40 %	0 %	212550496
112	NC_011565	TTTTA	2	10	162270	162279	20 %	80 %	0 %	0 %	212550497
113	NC_011565	AGAAA	2	10	163011	163020	80 %	0 %	20 %	0 %	212550498
114	NC_011565	ATTTT	2	10	169364	169373	20 %	80 %	0 %	0 %	212550501
115	NC_011565	TATCA	2	10	170339	170348	40 %	40 %	0 %	20 %	212550502
116	NC_011565	ATTTA	2	10	170456	170465	40 %	60 %	0 %	0 %	212550502
117	NC_011565	TTCAA	2	10	170499	170508	40 %	40 %	0 %	20 %	212550502
118	NC_011565	AAGAT	2	10	173903	173912	60 %	20 %	20 %	0 %	212550504
119	NC_011565	GAATA	2	10	173948	173957	60 %	20 %	20 %	0 %	212550504
120	NC_011565	TAAAA	2	10	175397	175406	80 %	20 %	0 %	0 %	212550505
121	NC_011565	GACTT	2	10	177559	177568	20 %	40 %	20 %	20 %	212550506
122	NC_011565	GATTT	2	10	177642	177651	20 %	60 %	20 %	0 %	212550506
123	NC_011565	TTCAT	2	10	178934	178943	20 %	60 %	0 %	20 %	212550506
124	NC_011565	GTATT	2	10	178972	178981	20 %	60 %	20 %	0 %	212550506
125	NC_011565	TTATT	2	10	183256	183265	20 %	80 %	0 %	0 %	212550510
126	NC_011565	AATGG	2	10	184598	184607	40 %	20 %	40 %	0 %	212550511
127	NC_011565	TGGAT	2	10	188903	188912	20 %	40 %	40 %	0 %	212550513
128	NC_011565	AATTC	2	10	193691	193700	40 %	40 %	0 %	20 %	212550515
129	NC_011565	AAATC	2	10	195085	195094	60 %	20 %	0 %	20 %	212550516
130	NC_011565	CCATA	2	10	200116	200125	40 %	20 %	0 %	40 %	212550518
131	NC_011565	AAAGA	2	10	204260	204269	80 %	0 %	20 %	0 %	212550522
132	NC_011565	TACAA	2	10	207628	207637	60 %	20 %	0 %	20 %	212550524
133	NC_011565	AAAAC	2	10	208082	208091	80 %	0 %	0 %	20 %	212550524
134	NC_011565	GGATA	2	10	209984	209993	40 %	20 %	40 %	0 %	212550525
135	NC_011565	ACAAA	2	10	210197	210206	80 %	0 %	0 %	20 %	212550525
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