MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 1279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011565	CAAA	2	8	5303	5310	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011565	CAAA	2	8	14988	14995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011565	ATTT	2	8	15451	15458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011565	CTCA	2	8	17253	17260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011565	ACAA	2	8	17265	17272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011565	TTTA	2	8	18004	18011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011565	GTAC	2	8	18038	18045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011565	CATA	2	8	18334	18341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011565	ATAC	2	8	18342	18349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011565	ATTT	2	8	19710	19717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011565	CAAT	2	8	20026	20033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011565	ATAA	2	8	20068	20075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011565	ACAA	2	8	24624	24631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011565	AAGC	2	8	25834	25841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011565	CTCA	2	8	25892	25899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011565	TGAT	2	8	25909	25916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011565	ATAC	2	8	25977	25984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011565	AATC	2	8	27571	27578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011565	CCAC	2	8	27586	27593	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_011565	TTCA	2	8	27596	27603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011565	ATAA	2	8	30973	30980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011565	CATC	2	8	32076	32083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011565	TAAT	2	8	34422	34429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011565	ATAA	2	8	34808	34815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011565	AATA	2	8	34822	34829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011565	CAAA	2	8	35109	35116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011565	AGAA	2	8	35208	35215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011565	GTAT	2	8	35299	35306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011565	TCGT	2	8	35322	35329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011565	TTAT	2	8	35451	35458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011565	TAAA	2	8	35500	35507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011565	TAAA	2	8	38057	38064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011565	TTTA	2	8	38127	38134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011565	TCTT	2	8	38163	38170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011565	TAAA	2	8	38206	38213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011565	GACC	2	8	38331	38338	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011565	ACTC	2	8	38642	38649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011565	ATTT	2	8	38769	38776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011565	TAGA	2	8	38949	38956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011565	ATAA	2	8	39193	39200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011565	GTTA	4	16	39478	39493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011565	GTCA	2	8	39494	39501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011565	CAAA	2	8	39531	39538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011565	AAAG	2	8	39730	39737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011565	AATA	2	8	39807	39814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011565	TTCA	2	8	48735	48742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011565	AAAT	2	8	48789	48796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011565	CCTC	2	8	49083	49090	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_011565	TGAT	2	8	49318	49325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011565	CATA	2	8	49690	49697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011565	ATCA	2	8	50634	50641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011565	TCTT	2	8	55442	55449	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011565	AATA	2	8	61594	61601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011565	TTTC	2	8	61691	61698	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011565	GAAG	2	8	62187	62194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011565	TAGC	2	8	62796	62803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011565	AGGA	2	8	62949	62956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011565	AAGG	2	8	63480	63487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011565	AAAG	2	8	64032	64039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011565	ATGA	2	8	64308	64315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011565	TAAA	2	8	64702	64709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011565	TAAA	2	8	67951	67958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011565	ATTA	2	8	68105	68112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011565	CTAT	2	8	74940	74947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011565	ACTA	2	8	74999	75006	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011565	AAAT	2	8	75124	75131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011565	TGAT	2	8	75718	75725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011565	AAAG	2	8	75829	75836	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011565	ATCA	2	8	75910	75917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011565	CTAT	2	8	79406	79413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011565	ACTT	2	8	80240	80247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011565	TACC	2	8	80308	80315	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011565	ATAA	2	8	80335	80342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011565	AACA	2	8	80453	80460	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011565	TTAA	2	8	83133	83140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011565	AATC	2	8	83711	83718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011565	AAGA	2	8	83740	83747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011565	CACC	2	8	83834	83841	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_011565	GAAT	2	8	85758	85765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011565	ACAA	2	8	85806	85813	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011565	CTAA	2	8	85927	85934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011565	TATT	2	8	91650	91657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011565	ATAC	2	8	94750	94757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011565	TGAT	2	8	94804	94811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011565	ATTC	2	8	102251	102258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011565	ATTA	4	16	106724	106739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011565	TATC	2	8	107254	107261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011565	TCTT	2	8	107267	107274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011565	ATAA	2	8	107461	107468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011565	TTCA	2	8	110302	110309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011565	AATA	2	8	114699	114706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011565	TTCA	2	8	116389	116396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011565	TTAT	2	8	116909	116916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011565	TAAT	2	8	117809	117816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011565	TCTT	2	8	117838	117845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011565	ACAT	2	8	117874	117881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011565	TTAT	2	8	118066	118073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011565	ATAA	2	8	118300	118307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011565	TCCA	2	8	118376	118383	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011565	GAAA	2	8	118841	118848	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011565	CCTT	2	8	118969	118976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011565	TATT	2	8	119257	119264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011565	ATAG	2	8	119284	119291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011565	AAAG	2	8	119669	119676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011565	TTTA	2	8	119691	119698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011565	TATG	2	8	119727	119734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011565	GATC	2	8	120280	120287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011565	CAAA	2	8	120484	120491	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011565	TAAA	2	8	123205	123212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011565	TACA	2	8	127589	127596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011565	TTTC	2	8	143093	143100	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011565	AAGA	2	8	143138	143145	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011565	ATCA	2	8	143201	143208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011565	ACCA	2	8	143216	143223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011565	ATAA	2	8	145224	145231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011565	TAAT	2	8	145400	145407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011565	TAAA	2	8	148005	148012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011565	TCTA	2	8	148017	148024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011565	TATT	2	8	148049	148056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011565	ACAA	2	8	149064	149071	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011565	TAAA	2	8	149339	149346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011565	AAGA	2	8	151428	151435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011565	ACAA	2	8	151528	151535	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011565	CTAT	2	8	151620	151627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011565	ATCT	2	8	153152	153159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011565	CTTT	2	8	153280	153287	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011565	CCCA	2	8	153320	153327	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_011565	AATA	2	8	157059	157066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011565	ATAC	2	8	158919	158926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011565	TTTA	2	8	158970	158977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011565	GTAA	2	8	159000	159007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011565	CTTA	2	8	159017	159024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011565	ATCC	2	8	159062	159069	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011565	TCTA	2	8	162682	162689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011565	AAAT	2	8	162727	162734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011565	GTAT	2	8	164222	164229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011565	TTTA	2	8	166421	166428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011565	TTCT	2	8	166823	166830	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011565	TTCT	2	8	167083	167090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011565	AAAT	2	8	167099	167106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011565	AGGA	2	8	167167	167174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011565	TAAT	2	8	167188	167195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011565	GATT	2	8	172551	172558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011565	AAGA	2	8	174034	174041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011565	AGAA	2	8	174525	174532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011565	AATA	2	8	174565	174572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011565	CTGC	2	8	176228	176235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011565	AAAT	2	8	176327	176334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011565	TAAT	2	8	177251	177258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011565	AATA	2	8	181704	181711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011565	TTAA	2	8	181838	181845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_011565	TCAA	2	8	182972	182979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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