MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 4240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011565	GTT	2	6	1401	1406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011565	AGT	3	9	1507	1515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011565	CAA	2	6	1633	1638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011565	AAT	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011565	AAT	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011565	ATA	2	6	5297	5302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011565	TAA	2	6	5391	5396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011565	ACA	2	6	14889	14894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011565	ATC	2	6	14903	14908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011565	ATA	2	6	14928	14933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011565	ACA	2	6	15011	15016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011565	ACA	2	6	17344	17349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011565	TCC	2	6	17395	17400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_011565	TAT	2	6	18327	18332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011565	ATG	2	6	18481	18486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011565	TAA	2	6	18487	18492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011565	ATT	2	6	19776	19781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011565	AAG	2	6	19863	19868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011565	TTC	2	6	19903	19908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011565	GAA	2	6	19913	19918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011565	AAT	2	6	20011	20016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011565	GTA	2	6	20178	20183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011565	GTA	2	6	20196	20201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011565	GAA	3	9	20240	20248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011565	TCC	2	6	20272	20277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011565	TCC	2	6	20288	20293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011565	CTT	2	6	20368	20373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011565	GAT	2	6	20521	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011565	TTC	2	6	20579	20584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011565	GAA	2	6	20645	20650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011565	CGT	2	6	20697	20702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011565	ACA	2	6	20741	20746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011565	TAT	2	6	23988	23993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011565	TTG	2	6	24174	24179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011565	CAC	2	6	24245	24250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011565	CTA	2	6	24329	24334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011565	AGC	2	6	24347	24352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011565	ATC	2	6	24387	24392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011565	AAC	2	6	24409	24414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011565	AGC	2	6	24550	24555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011565	AGA	2	6	24577	24582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011565	AAG	2	6	24584	24589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011565	TCT	2	6	24595	24600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011565	CTA	2	6	25785	25790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011565	TAC	2	6	27485	27490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011565	TAG	2	6	27495	27500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011565	ATG	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011565	TTC	2	6	27662	27667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011565	TCA	2	6	27699	27704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011565	TAA	2	6	28114	28119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011565	GAT	2	6	28775	28780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011565	AAT	2	6	28781	28786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011565	ACT	2	6	28804	28809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011565	AAT	2	6	28820	28825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011565	TAA	2	6	29610	29615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011565	TGT	2	6	29624	29629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011565	AAG	2	6	30985	30990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011565	TAT	2	6	34217	34222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011565	AAT	2	6	34338	34343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011565	AGA	2	6	34649	34654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011565	TCT	2	6	34690	34695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011565	TTG	2	6	34765	34770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011565	TAC	2	6	34861	34866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011565	ACA	2	6	35022	35027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011565	GGT	2	6	35176	35181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011565	CAA	2	6	35249	35254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011565	TAA	2	6	35270	35275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011565	TGT	2	6	35308	35313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011565	ACT	2	6	35380	35385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011565	TTG	2	6	35441	35446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011565	TTC	2	6	35485	35490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011565	TAA	2	6	38076	38081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011565	TCT	2	6	38197	38202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011565	GAG	2	6	38219	38224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011565	ATA	3	9	38233	38241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011565	TTA	2	6	38351	38356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011565	ATT	2	6	38388	38393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011565	ATA	2	6	38578	38583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011565	TTA	2	6	38914	38919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011565	AGA	2	6	38935	38940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011565	TAT	2	6	39061	39066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011565	TTA	2	6	39079	39084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011565	ACG	2	6	39116	39121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011565	GTG	2	6	39448	39453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011565	ATA	2	6	39508	39513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011565	CAT	2	6	39623	39628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011565	GAA	2	6	39661	39666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011565	AGA	2	6	39669	39674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011565	GTA	2	6	39692	39697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011565	CTA	2	6	39700	39705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011565	TAT	2	6	39759	39764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011565	AAT	2	6	39824	39829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011565	ATC	2	6	40720	40725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011565	ATT	3	9	44245	44253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011565	TCT	2	6	44280	44285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011565	TAA	2	6	44939	44944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011565	TAA	2	6	48680	48685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011565	AGC	2	6	48847	48852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011565	TCC	2	6	48938	48943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011565	TTC	2	6	48949	48954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011565	ATC	2	6	48960	48965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011565	CAC	2	6	49131	49136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011565	ATC	2	6	49298	49303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011565	ATT	2	6	49369	49374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011565	ACA	2	6	49429	49434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011565	TAC	2	6	49595	49600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011565	TAA	2	6	49679	49684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011565	ATT	2	6	49722	49727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011565	ATA	2	6	50542	50547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011565	TAT	2	6	50618	50623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011565	ATT	2	6	50680	50685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011565	ATT	3	9	50711	50719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011565	CTT	2	6	50724	50729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011565	ATA	2	6	51996	52001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011565	TCT	2	6	52013	52018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011565	TAG	2	6	55277	55282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011565	CTT	2	6	55419	55424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011565	TAC	2	6	56307	56312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011565	AAT	2	6	60765	60770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011565	ATT	2	6	61585	61590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011565	ATT	2	6	61636	61641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011565	GTA	2	6	61671	61676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011565	AAT	2	6	61701	61706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011565	AGA	2	6	61790	61795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011565	GAC	2	6	61874	61879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011565	AAT	2	6	61956	61961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011565	TTC	2	6	61981	61986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011565	AAT	2	6	61994	61999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011565	CGA	2	6	62058	62063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011565	GCA	2	6	62132	62137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011565	TAT	2	6	62199	62204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011565	CTT	2	6	62215	62220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011565	CAG	2	6	62295	62300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011565	GGT	2	6	62360	62365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011565	TAA	2	6	62367	62372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011565	GTG	2	6	62377	62382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011565	GAA	2	6	62487	62492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011565	GGA	2	6	62714	62719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011565	ATA	2	6	62737	62742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011565	TGC	2	6	62821	62826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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