MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG1

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011564	ATTAC	2	10	384	393	40 %	40 %	0 %	20 %	212550320
2	NC_011564	TCGTA	2	10	396	405	20 %	40 %	20 %	20 %	212550320
3	NC_011564	TTATT	2	10	1676	1685	20 %	80 %	0 %	0 %	212550321
4	NC_011564	AATGC	2	10	3758	3767	40 %	20 %	20 %	20 %	212550323
5	NC_011564	GATGA	2	10	11454	11463	40 %	20 %	40 %	0 %	212550332
6	NC_011564	TGCAT	2	10	11958	11967	20 %	40 %	20 %	20 %	212550332
7	NC_011564	GTGAA	2	10	14578	14587	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011564	CTGTA	2	10	15107	15116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011564	GTTAT	2	10	15605	15614	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011564	AAGTT	2	10	17254	17263	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011564	TTTCT	2	10	17964	17973	0 %	80 %	0 %	20 %	212550337
12	NC_011564	CATTC	2	10	18834	18843	20 %	40 %	0 %	40 %	212550337
13	NC_011564	TCTGA	2	10	20632	20641	20 %	40 %	20 %	20 %	212550339
14	NC_011564	ATGCT	2	10	21831	21840	20 %	40 %	20 %	20 %	212550340
15	NC_011564	TTATA	2	10	21885	21894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011564	TATAG	2	10	23013	23022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011564	AGCTA	2	10	24258	24267	40 %	20 %	20 %	20 %	212550343
18	NC_011564	AGAAA	2	10	32718	32727	80 %	0 %	20 %	0 %	212550353
19	NC_011564	TTTCT	2	10	33212	33221	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011564	TTTAC	2	10	33564	33573	20 %	60 %	0 %	20 %	212550354
21	NC_011564	ATTAA	2	10	33952	33961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011564	TTTCA	2	10	34198	34207	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011564	AATAA	2	10	34850	34859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011564	AAAAC	2	10	35080	35089	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011564	TCTTT	2	10	37226	37235	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.