MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011564	TTCG	2	8	4043	4050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011564	TGCG	2	8	4317	4324	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011564	TAAT	2	8	4615	4622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011564	TTTA	2	8	9890	9897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011564	AAAC	2	8	10369	10376	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011564	TCGT	2	8	13001	13008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011564	CATG	2	8	13285	13292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011564	CATG	2	8	13307	13314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011564	ATTG	2	8	13634	13641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011564	TGCA	2	8	13660	13667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011564	GAGT	2	8	13750	13757	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011564	TTTG	2	8	14338	14345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011564	AGGC	2	8	14476	14483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011564	GGGA	2	8	14570	14577	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011564	GCGG	2	8	14700	14707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011564	GCTG	2	8	14847	14854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011564	CAAA	2	8	14882	14889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011564	TAGA	2	8	15466	15473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011564	GTTT	2	8	15863	15870	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011564	AGTT	2	8	16378	16385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011564	TTTA	2	8	16525	16532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011564	TATT	2	8	17220	17227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011564	CATT	2	8	17336	17343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011564	ATAG	2	8	20147	20154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011564	TTTC	2	8	20225	20232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011564	CAGC	2	8	20344	20351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011564	TTAT	2	8	20396	20403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011564	AATG	2	8	20463	20470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011564	GACA	2	8	20511	20518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011564	ATTC	2	8	20530	20537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011564	GATA	2	8	20539	20546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011564	CGAA	2	8	21363	21370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011564	TATT	2	8	21991	21998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011564	TCTA	2	8	22083	22090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011564	TGTA	2	8	22217	22224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011564	TTTC	2	8	22445	22452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011564	ATTC	2	8	22662	22669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011564	TCTT	2	8	22867	22874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011564	GTTT	2	8	24970	24977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011564	GTAT	2	8	25224	25231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011564	TAAT	2	8	25242	25249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011564	CTTA	2	8	26703	26710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011564	TAAG	2	8	26760	26767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011564	ATTT	2	8	26978	26985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011564	TGTT	2	8	27037	27044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011564	ATTC	2	8	27155	27162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011564	TTCA	2	8	29503	29510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011564	AATA	2	8	29523	29530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011564	ATAG	2	8	29589	29596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011564	TAAA	2	8	29726	29733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011564	AATG	2	8	30174	30181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011564	AGAT	2	8	30610	30617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011564	TTTA	2	8	32766	32773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011564	ATCT	2	8	32863	32870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011564	TCGT	2	8	32954	32961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011564	TTCT	2	8	33241	33248	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011564	TAAC	2	8	33991	33998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011564	AAGA	2	8	34709	34716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011564	TGGT	2	8	34970	34977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011564	TTTA	2	8	35190	35197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011564	TCTA	2	8	35318	35325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011564	TTAC	2	8	35849	35856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011564	TCTA	2	8	35863	35870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011564	GATA	2	8	35961	35968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011564	ATTT	2	8	37551	37558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.