MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011564	AAAG	2	8	340	347	75 %	0 %	25 %	0 %	212550320
2	NC_011564	AAAT	2	8	594	601	75 %	25 %	0 %	0 %	212550320
3	NC_011564	AGTA	2	8	895	902	50 %	25 %	25 %	0 %	212550320
4	NC_011564	GAAA	2	8	1319	1326	75 %	0 %	25 %	0 %	212550320
5	NC_011564	AAGA	2	8	1975	1982	75 %	0 %	25 %	0 %	212550321
6	NC_011564	GATA	2	8	1983	1990	50 %	25 %	25 %	0 %	212550321
7	NC_011564	AATT	2	8	2058	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	212550321
8	NC_011564	TAGT	2	8	2577	2584	25 %	50 %	25 %	0 %	212550322
9	NC_011564	TATT	2	8	2984	2991	25 %	75 %	0 %	0 %	212550322
10	NC_011564	GGAA	2	8	3165	3172	50 %	0 %	50 %	0 %	212550323
11	NC_011564	GACA	2	8	3269	3276	50 %	0 %	25 %	25 %	212550323
12	NC_011564	GATG	2	8	3343	3350	25 %	25 %	50 %	0 %	212550323
13	NC_011564	AGAT	2	8	3720	3727	50 %	25 %	25 %	0 %	212550323
14	NC_011564	CTAC	2	8	3746	3753	25 %	25 %	0 %	50 %	212550323
15	NC_011564	AGGA	2	8	3786	3793	50 %	0 %	50 %	0 %	212550323
16	NC_011564	AAAT	2	8	3920	3927	75 %	25 %	0 %	0 %	212550323
17	NC_011564	TCAT	2	8	4661	4668	25 %	50 %	0 %	25 %	212550324
18	NC_011564	TCAA	2	8	4822	4829	50 %	25 %	0 %	25 %	212550324
19	NC_011564	AACA	2	8	5072	5079	75 %	0 %	0 %	25 %	212550325
20	NC_011564	ATTA	2	8	5152	5159	50 %	50 %	0 %	0 %	212550325
21	NC_011564	TCAA	2	8	5871	5878	50 %	25 %	0 %	25 %	212550326
22	NC_011564	AAAT	2	8	6269	6276	75 %	25 %	0 %	0 %	212550326
23	NC_011564	AGTA	2	8	6573	6580	50 %	25 %	25 %	0 %	212550326
24	NC_011564	GAAA	2	8	6997	7004	75 %	0 %	25 %	0 %	212550326
25	NC_011564	ATCC	2	8	7602	7609	25 %	25 %	0 %	50 %	212550327
26	NC_011564	TTCT	2	8	8022	8029	0 %	75 %	0 %	25 %	212550327
27	NC_011564	CAGT	2	8	8213	8220	25 %	25 %	25 %	25 %	212550327
28	NC_011564	CTAC	2	8	9960	9967	25 %	25 %	0 %	50 %	212550329
29	NC_011564	ATCT	2	8	10056	10063	25 %	50 %	0 %	25 %	212550329
30	NC_011564	TTTC	2	8	10178	10185	0 %	75 %	0 %	25 %	212550329
31	NC_011564	TTTC	2	8	10304	10311	0 %	75 %	0 %	25 %	212550329
32	NC_011564	TGCA	2	8	10503	10510	25 %	25 %	25 %	25 %	212550330
33	NC_011564	AATG	2	8	10826	10833	50 %	25 %	25 %	0 %	212550331
34	NC_011564	TATC	2	8	11052	11059	25 %	50 %	0 %	25 %	212550331
35	NC_011564	ACGT	2	8	11686	11693	25 %	25 %	25 %	25 %	212550332
36	NC_011564	GATG	2	8	11816	11823	25 %	25 %	50 %	0 %	212550332
37	NC_011564	AGAA	2	8	11824	11831	75 %	0 %	25 %	0 %	212550332
38	NC_011564	CATG	2	8	14086	14093	25 %	25 %	25 %	25 %	212550335
39	NC_011564	AGTC	2	8	17490	17497	25 %	25 %	25 %	25 %	212550337
40	NC_011564	CCAT	2	8	17761	17768	25 %	25 %	0 %	50 %	212550337
41	NC_011564	AGTC	2	8	17922	17929	25 %	25 %	25 %	25 %	212550337
42	NC_011564	ATCT	2	8	18379	18386	25 %	50 %	0 %	25 %	212550337
43	NC_011564	CAGT	2	8	18596	18603	25 %	25 %	25 %	25 %	212550337
44	NC_011564	CTAC	2	8	18986	18993	25 %	25 %	0 %	50 %	212550337
45	NC_011564	CAAT	2	8	19328	19335	50 %	25 %	0 %	25 %	212550337
46	NC_011564	ATGG	2	8	20016	20023	25 %	25 %	50 %	0 %	212550338
47	NC_011564	TAGA	2	8	21760	21767	50 %	25 %	25 %	0 %	212550340
48	NC_011564	ATCC	2	8	24032	24039	25 %	25 %	0 %	50 %	212550343
49	NC_011564	TATT	2	8	24634	24641	25 %	75 %	0 %	0 %	212550344
50	NC_011564	TACA	2	8	25505	25512	50 %	25 %	0 %	25 %	212550345
51	NC_011564	CGTT	2	8	25573	25580	0 %	50 %	25 %	25 %	212550345
52	NC_011564	CTAT	2	8	25582	25589	25 %	50 %	0 %	25 %	212550345
53	NC_011564	TAAT	2	8	25931	25938	50 %	50 %	0 %	0 %	212550346
54	NC_011564	AATG	2	8	26025	26032	50 %	25 %	25 %	0 %	212550346
55	NC_011564	CTTT	2	8	26300	26307	0 %	75 %	0 %	25 %	212550347
56	NC_011564	GGAT	2	8	26498	26505	25 %	25 %	50 %	0 %	212550347
57	NC_011564	AAAG	2	8	27861	27868	75 %	0 %	25 %	0 %	212550349
58	NC_011564	TCCT	2	8	28011	28018	0 %	50 %	0 %	50 %	212550349
59	NC_011564	AATG	2	8	28025	28032	50 %	25 %	25 %	0 %	212550349
60	NC_011564	AAAG	2	8	28095	28102	75 %	0 %	25 %	0 %	212550349
61	NC_011564	GTCA	2	8	28470	28477	25 %	25 %	25 %	25 %	212550350
62	NC_011564	AGAT	2	8	28969	28976	50 %	25 %	25 %	0 %	212550350
63	NC_011564	TCGT	2	8	29394	29401	0 %	50 %	25 %	25 %	212550350
64	NC_011564	AGTA	2	8	30869	30876	50 %	25 %	25 %	0 %	212550351
65	NC_011564	TTTG	2	8	31290	31297	0 %	75 %	25 %	0 %	212550351
66	NC_011564	TAAT	2	8	31330	31337	50 %	50 %	0 %	0 %	212550351
67	NC_011564	TATC	2	8	31341	31348	25 %	50 %	0 %	25 %	212550351
68	NC_011564	CAGA	2	8	31364	31371	50 %	0 %	25 %	25 %	212550351
69	NC_011564	GTTA	2	8	31468	31475	25 %	50 %	25 %	0 %	212550351
70	NC_011564	ACTT	2	8	31684	31691	25 %	50 %	0 %	25 %	212550352
71	NC_011564	CTGT	2	8	31767	31774	0 %	50 %	25 %	25 %	212550352
72	NC_011564	CAAT	2	8	32591	32598	50 %	25 %	0 %	25 %	212550353
73	NC_011564	AGAC	2	8	32682	32689	50 %	0 %	25 %	25 %	212550353
74	NC_011564	ACAA	2	8	32696	32703	75 %	0 %	0 %	25 %	212550353
75	NC_011564	TTTC	2	8	33823	33830	0 %	75 %	0 %	25 %	212550354
76	NC_011564	AATC	2	8	35611	35618	50 %	25 %	0 %	25 %	212550355
77	NC_011564	AGAA	2	8	36268	36275	75 %	0 %	25 %	0 %	212550356
78	NC_011564	ATTT	2	8	36408	36415	25 %	75 %	0 %	0 %	212550356
79	NC_011564	ACGA	2	8	36439	36446	50 %	0 %	25 %	25 %	212550356
80	NC_011564	AAAG	2	8	36690	36697	75 %	0 %	25 %	0 %	212550356

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.