MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG1

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011564	TCA	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550320
2	NC_011564	TGA	2	6	59	64	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550320
3	NC_011564	ACA	2	6	94	99	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550320
4	NC_011564	TTC	2	6	213	218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550320
5	NC_011564	CTT	2	6	526	531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550320
6	NC_011564	GAG	2	6	700	705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550320
7	NC_011564	ACA	2	6	714	719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550320
8	NC_011564	AGC	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550320
9	NC_011564	AAG	2	6	988	993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550320
10	NC_011564	AGA	2	6	1047	1052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550320
11	NC_011564	CAG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550320
12	NC_011564	TCA	2	6	1113	1118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550320
13	NC_011564	ATT	2	6	1151	1156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550320
14	NC_011564	GAA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550320
15	NC_011564	TAA	2	6	1248	1253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550320
16	NC_011564	GCT	2	6	1336	1341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550320
17	NC_011564	ACT	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550320
18	NC_011564	AGG	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550320
19	NC_011564	GGA	2	6	1422	1427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550320
20	NC_011564	GTC	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550320
21	NC_011564	AAG	2	6	1576	1581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550320
22	NC_011564	TGA	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550321
23	NC_011564	CTA	2	6	1752	1757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550321
24	NC_011564	TGG	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550321
25	NC_011564	TGG	2	6	1872	1877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550321
26	NC_011564	GAA	3	9	1908	1916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550321
27	NC_011564	AAG	2	6	1947	1952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550321
28	NC_011564	AGA	2	6	2028	2033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550321
29	NC_011564	TGA	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550321
30	NC_011564	ACA	2	6	2132	2137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550322
31	NC_011564	ATT	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550322
32	NC_011564	TGA	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550322
33	NC_011564	AGA	2	6	2362	2367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550322
34	NC_011564	GAA	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550322
35	NC_011564	AGA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550322
36	NC_011564	AAT	2	6	2546	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550322
37	NC_011564	ATA	2	6	2613	2618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550322
38	NC_011564	TAA	2	6	2662	2667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550322
39	NC_011564	CCA	2	6	2727	2732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550322
40	NC_011564	CAC	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550323
41	NC_011564	AGC	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550323
42	NC_011564	TAA	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550323
43	NC_011564	TTC	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550323
44	NC_011564	TCT	2	6	3372	3377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550323
45	NC_011564	AGA	2	6	3511	3516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550323
46	NC_011564	GAA	2	6	3632	3637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550323
47	NC_011564	CAA	2	6	3798	3803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550323
48	NC_011564	AAG	2	6	3879	3884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550323
49	NC_011564	GAA	3	9	3911	3919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550323
50	NC_011564	CAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550324
51	NC_011564	TCA	2	6	4851	4856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550324
52	NC_011564	AAT	2	6	4907	4912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550324
53	NC_011564	GAA	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550325
54	NC_011564	AAT	2	6	5119	5124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550325
55	NC_011564	AGA	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550326
56	NC_011564	TTC	2	6	5908	5913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550326
57	NC_011564	TTC	2	6	5918	5923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550326
58	NC_011564	TGA	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550326
59	NC_011564	CAT	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550326
60	NC_011564	TTA	2	6	6043	6048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550326
61	NC_011564	TGT	2	6	6305	6310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550326
62	NC_011564	AGG	2	6	6398	6403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550326
63	NC_011564	GAA	2	6	6407	6412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550326
64	NC_011564	GTT	2	6	6495	6500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550326
65	NC_011564	AGC	2	6	6526	6531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550326
66	NC_011564	AAG	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550326
67	NC_011564	AGA	2	6	6725	6730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550326
68	NC_011564	CAG	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550326
69	NC_011564	TCA	2	6	6791	6796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550326
70	NC_011564	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550326
71	NC_011564	GAA	2	6	6849	6854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550326
72	NC_011564	TAA	2	6	6926	6931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550326
73	NC_011564	GCT	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550326
74	NC_011564	ACT	2	6	7026	7031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550326
75	NC_011564	AGG	2	6	7084	7089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550326
76	NC_011564	GGA	2	6	7100	7105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550326
77	NC_011564	TAG	2	6	7193	7198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550326
78	NC_011564	AAC	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550327
79	NC_011564	AGA	2	6	7938	7943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550327
80	NC_011564	TCA	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550327
81	NC_011564	ATT	2	6	8348	8353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550327
82	NC_011564	GAA	2	6	8380	8385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550327
83	NC_011564	GAT	2	6	8461	8466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550327
84	NC_011564	TTG	2	6	8592	8597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550327
85	NC_011564	ATG	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550328
86	NC_011564	TTC	2	6	9414	9419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550328
87	NC_011564	TTC	2	6	9504	9509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550328
88	NC_011564	TGG	2	6	9585	9590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550328
89	NC_011564	GAA	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550328
90	NC_011564	TCT	2	6	9690	9695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550328
91	NC_011564	AGA	2	6	9701	9706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550328
92	NC_011564	TCT	2	6	10075	10080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550329
93	NC_011564	TTG	2	6	10209	10214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550329
94	NC_011564	TCC	2	6	10401	10406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550330
95	NC_011564	ATA	2	6	10436	10441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550330
96	NC_011564	ATC	2	6	10452	10457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550330
97	NC_011564	ATA	2	6	10570	10575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550330
98	NC_011564	GTA	2	6	10580	10585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550330
99	NC_011564	TTA	2	6	10606	10611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550330
100	NC_011564	TGT	2	6	10636	10641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550330
101	NC_011564	CAT	2	6	10642	10647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550330
102	NC_011564	GTA	2	6	10688	10693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550331
103	NC_011564	TCT	8	24	10985	11008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550331
104	NC_011564	CAA	2	6	11351	11356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550332
105	NC_011564	ACT	3	9	11395	11403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550332
106	NC_011564	GAA	2	6	11433	11438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550332
107	NC_011564	CAT	2	6	11478	11483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550332
108	NC_011564	GGA	2	6	11497	11502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550332
109	NC_011564	ATG	2	6	11551	11556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550332
110	NC_011564	CTA	2	6	11638	11643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550332
111	NC_011564	GAG	2	6	11649	11654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550332
112	NC_011564	CTT	2	6	11909	11914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550332
113	NC_011564	ACC	2	6	12285	12290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550333
114	NC_011564	GAA	2	6	12486	12491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550333
115	NC_011564	ACT	2	6	12517	12522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550333
116	NC_011564	TAA	2	6	12673	12678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550334
117	NC_011564	TGC	2	6	12690	12695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550334
118	NC_011564	ACA	2	6	12727	12732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550334
119	NC_011564	ATA	2	6	12733	12738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550334
120	NC_011564	ATA	2	6	12748	12753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550334
121	NC_011564	CTG	2	6	12891	12896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550334
122	NC_011564	ATA	2	6	12910	12915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550334
123	NC_011564	CCA	2	6	13965	13970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550335
124	NC_011564	CCT	2	6	16588	16593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550336
125	NC_011564	TTC	2	6	16605	16610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550336
126	NC_011564	TTC	3	9	16623	16631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550336
127	NC_011564	TTC	2	6	16681	16686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550336
128	NC_011564	TAA	2	6	16694	16699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550336
129	NC_011564	TTA	2	6	16732	16737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550336
130	NC_011564	ATT	2	6	16929	16934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550336
131	NC_011564	ATC	2	6	16995	17000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550336
132	NC_011564	TTC	2	6	17055	17060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550336
133	NC_011564	ACT	2	6	17074	17079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550336
134	NC_011564	GAT	2	6	17370	17375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550337
135	NC_011564	TCT	2	6	17444	17449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
136	NC_011564	CCA	2	6	17526	17531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550337
137	NC_011564	TTA	2	6	17564	17569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550337
138	NC_011564	ATC	2	6	17572	17577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550337
139	NC_011564	TCA	2	6	17594	17599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550337
140	NC_011564	TAT	2	6	17649	17654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550337
141	NC_011564	ATA	2	6	17748	17753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550337
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145	NC_011564	TTC	2	6	17878	17883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
146	NC_011564	TCA	2	6	17903	17908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550337
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150	NC_011564	ATT	2	6	18061	18066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550337
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152	NC_011564	TTC	2	6	18349	18354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
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155	NC_011564	CTT	2	6	18432	18437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
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159	NC_011564	TTA	2	6	18590	18595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550337
160	NC_011564	CTT	2	6	18676	18681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
161	NC_011564	AAT	2	6	18755	18760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550337
162	NC_011564	ATT	2	6	18799	18804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550337
163	NC_011564	TTC	2	6	18820	18825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
164	NC_011564	TAT	2	6	18855	18860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550337
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168	NC_011564	CTT	2	6	19143	19148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550337
169	NC_011564	ATC	2	6	19357	19362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550337
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174	NC_011564	AGA	2	6	19671	19676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550337
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.