MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG1

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011564	A	7	7	730	736	100 %	0 %	0 %	0 %	212550320
2	NC_011564	A	6	6	1283	1288	100 %	0 %	0 %	0 %	212550320
3	NC_011564	A	6	6	1660	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	212550321
4	NC_011564	A	6	6	1998	2003	100 %	0 %	0 %	0 %	212550321
5	NC_011564	T	6	6	2191	2196	0 %	100 %	0 %	0 %	212550322
6	NC_011564	A	6	6	3890	3895	100 %	0 %	0 %	0 %	212550323
7	NC_011564	T	6	6	3930	3935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011564	T	7	7	4553	4559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011564	A	7	7	4646	4652	100 %	0 %	0 %	0 %	212550324
10	NC_011564	T	6	6	4757	4762	0 %	100 %	0 %	0 %	212550324
11	NC_011564	T	6	6	4765	4770	0 %	100 %	0 %	0 %	212550324
12	NC_011564	A	6	6	4871	4876	100 %	0 %	0 %	0 %	212550324
13	NC_011564	A	8	8	4957	4964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011564	A	7	7	5005	5011	100 %	0 %	0 %	0 %	212550325
15	NC_011564	A	6	6	5323	5328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011564	T	6	6	5360	5365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011564	T	6	6	5441	5446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011564	A	9	9	5524	5532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011564	T	7	7	5639	5645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011564	A	7	7	5994	6000	100 %	0 %	0 %	0 %	212550326
21	NC_011564	A	6	6	6961	6966	100 %	0 %	0 %	0 %	212550326
22	NC_011564	A	6	6	7718	7723	100 %	0 %	0 %	0 %	212550327
23	NC_011564	T	6	6	8330	8335	0 %	100 %	0 %	0 %	212550327
24	NC_011564	A	6	6	8533	8538	100 %	0 %	0 %	0 %	212550327
25	NC_011564	A	7	7	8888	8894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011564	T	6	6	8959	8964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011564	A	6	6	9063	9068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011564	T	7	7	9472	9478	0 %	100 %	0 %	0 %	212550328
29	NC_011564	T	6	6	9876	9881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011564	T	8	8	10493	10500	0 %	100 %	0 %	0 %	212550330
31	NC_011564	T	6	6	10795	10800	0 %	100 %	0 %	0 %	212550331
32	NC_011564	T	6	6	10861	10866	0 %	100 %	0 %	0 %	212550331
33	NC_011564	T	6	6	11876	11881	0 %	100 %	0 %	0 %	212550332
34	NC_011564	T	7	7	12150	12156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011564	T	6	6	13511	13516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011564	A	7	7	15127	15133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011564	C	9	9	15144	15152	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_011564	T	6	6	15537	15542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011564	A	6	6	15986	15991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011564	T	6	6	16117	16122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011564	T	6	6	16309	16314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011564	T	7	7	17091	17097	0 %	100 %	0 %	0 %	212550336
43	NC_011564	T	6	6	17413	17418	0 %	100 %	0 %	0 %	212550337
44	NC_011564	T	6	6	17656	17661	0 %	100 %	0 %	0 %	212550337
45	NC_011564	T	6	6	18280	18285	0 %	100 %	0 %	0 %	212550337
46	NC_011564	T	7	7	18951	18957	0 %	100 %	0 %	0 %	212550337
47	NC_011564	T	6	6	19225	19230	0 %	100 %	0 %	0 %	212550337
48	NC_011564	T	6	6	19519	19524	0 %	100 %	0 %	0 %	212550337
49	NC_011564	T	6	6	19541	19546	0 %	100 %	0 %	0 %	212550337
50	NC_011564	T	7	7	20196	20202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011564	T	6	6	20267	20272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011564	T	9	9	20919	20927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011564	T	6	6	21176	21181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011564	T	6	6	21868	21873	0 %	100 %	0 %	0 %	212550340
55	NC_011564	T	6	6	22321	22326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011564	T	6	6	22887	22892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011564	T	7	7	23115	23121	0 %	100 %	0 %	0 %	212550341
58	NC_011564	T	6	6	23425	23430	0 %	100 %	0 %	0 %	212550341
59	NC_011564	A	7	7	24111	24117	100 %	0 %	0 %	0 %	212550343
60	NC_011564	T	7	7	24455	24461	0 %	100 %	0 %	0 %	212550343
61	NC_011564	T	6	6	25670	25675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011564	A	6	6	25684	25689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011564	A	7	7	26248	26254	100 %	0 %	0 %	0 %	212550347
64	NC_011564	T	6	6	26584	26589	0 %	100 %	0 %	0 %	212550347
65	NC_011564	T	6	6	26983	26988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011564	A	7	7	27118	27124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011564	A	6	6	27140	27145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011564	T	6	6	27174	27179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011564	A	6	6	27313	27318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011564	T	12	12	27734	27745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011564	T	9	9	27778	27786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011564	A	6	6	28872	28877	100 %	0 %	0 %	0 %	212550350
73	NC_011564	T	9	9	29434	29442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011564	A	8	8	29614	29621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011564	C	6	6	29766	29771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_011564	T	6	6	29946	29951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011564	T	8	8	30427	30434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011564	A	7	7	30578	30584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011564	T	7	7	30617	30623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011564	T	7	7	30648	30654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011564	T	9	9	30658	30666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011564	T	6	6	30691	30696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011564	T	7	7	30762	30768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011564	A	6	6	31320	31325	100 %	0 %	0 %	0 %	212550351
85	NC_011564	T	6	6	31693	31698	0 %	100 %	0 %	0 %	212550352
86	NC_011564	T	6	6	31801	31806	0 %	100 %	0 %	0 %	212550352
87	NC_011564	T	7	7	31864	31870	0 %	100 %	0 %	0 %	212550352
88	NC_011564	A	6	6	32008	32013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011564	T	9	9	32059	32067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011564	T	6	6	32208	32213	0 %	100 %	0 %	0 %	212550353
91	NC_011564	T	6	6	32459	32464	0 %	100 %	0 %	0 %	212550353
92	NC_011564	T	7	7	32667	32673	0 %	100 %	0 %	0 %	212550353
93	NC_011564	T	6	6	32734	32739	0 %	100 %	0 %	0 %	212550353
94	NC_011564	T	6	6	32826	32831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011564	T	8	8	33450	33457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011564	T	6	6	34325	34330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011564	T	7	7	34567	34573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011564	A	8	8	35134	35141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011564	T	9	9	35662	35670	0 %	100 %	0 %	0 %	212550355
100	NC_011564	A	6	6	36336	36341	100 %	0 %	0 %	0 %	212550356
101	NC_011564	A	6	6	36845	36850	100 %	0 %	0 %	0 %	212550356
102	NC_011564	A	8	8	37383	37390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011564	A	7	7	37439	37445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011564	A	6	6	37472	37477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011564	A	6	6	37504	37509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011564	T	8	8	37526	37533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.