MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	AAGCA	2	10	1126	1135	60 %	0 %	20 %	20 %	212550289
2	NC_011562	ACCTA	2	10	1736	1745	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011562	TTTGT	2	10	3390	3399	0 %	80 %	20 %	0 %	212550292
4	NC_011562	TTCTT	2	10	3713	3722	0 %	80 %	0 %	20 %	212550292
5	NC_011562	TCTCT	2	10	4212	4221	0 %	60 %	0 %	40 %	212550292
6	NC_011562	GTTGC	2	10	4302	4311	0 %	40 %	40 %	20 %	212550292
7	NC_011562	CATCT	2	10	5870	5879	20 %	40 %	0 %	40 %	212550293
8	NC_011562	TTGCT	2	10	6151	6160	0 %	60 %	20 %	20 %	212550293
9	NC_011562	AAAGA	2	10	6197	6206	80 %	0 %	20 %	0 %	212550293
10	NC_011562	TAAAT	2	10	6312	6321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011562	AACAA	2	10	6369	6378	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011562	GTGTC	2	10	9660	9669	0 %	40 %	40 %	20 %	212550297
13	NC_011562	GCATA	2	10	10046	10055	40 %	20 %	20 %	20 %	212550297
14	NC_011562	TTATT	2	10	11152	11161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011562	TCATT	2	10	11701	11710	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011562	AGAGT	2	10	12333	12342	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011562	AGAGA	2	10	13043	13052	60 %	0 %	40 %	0 %	212550298
18	NC_011562	ACAAA	2	10	13698	13707	80 %	0 %	0 %	20 %	212550298
19	NC_011562	GAGAA	2	10	15528	15537	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011562	TAATT	2	10	15954	15963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011562	CTTTT	2	10	17183	17192	0 %	80 %	0 %	20 %	212550301
22	NC_011562	CATTC	2	10	19072	19081	20 %	40 %	0 %	40 %	212550303
23	NC_011562	CAGTC	2	10	19102	19111	20 %	20 %	20 %	40 %	212550303
24	NC_011562	TCTGC	2	10	19149	19158	0 %	40 %	20 %	40 %	212550303
25	NC_011562	CTTTA	2	10	19412	19421	20 %	60 %	0 %	20 %	212550303
26	NC_011562	CATTC	2	10	19489	19498	20 %	40 %	0 %	40 %	212550303
27	NC_011562	CTTAT	2	10	19629	19638	20 %	60 %	0 %	20 %	212550303
28	NC_011562	CTTTT	2	10	19993	20002	0 %	80 %	0 %	20 %	212550303
29	NC_011562	ATTTC	2	10	20344	20353	20 %	60 %	0 %	20 %	212550303
30	NC_011562	TCTGA	2	10	21897	21906	20 %	40 %	20 %	20 %	212550305
31	NC_011562	TATGC	2	10	23731	23740	20 %	40 %	20 %	20 %	212550307
32	NC_011562	TAAAA	2	10	26417	26426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011562	TTTAG	2	10	27830	27839	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011562	AGAAA	2	10	29027	29036	80 %	0 %	20 %	0 %	212550311
35	NC_011562	TGTTT	2	10	29214	29223	0 %	80 %	20 %	0 %	212550312
36	NC_011562	CTTTC	2	10	30247	30256	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011562	AATAA	2	10	30881	30890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011562	TAAAA	2	10	31109	31118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011562	TCTTT	2	10	31532	31541	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.