MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	AAGCA	2	10	1126	1135	60 %	0 %	20 %	20 %	212550289
2	NC_011562	TTTGT	2	10	3390	3399	0 %	80 %	20 %	0 %	212550292
3	NC_011562	TTCTT	2	10	3713	3722	0 %	80 %	0 %	20 %	212550292
4	NC_011562	TCTCT	2	10	4212	4221	0 %	60 %	0 %	40 %	212550292
5	NC_011562	GTTGC	2	10	4302	4311	0 %	40 %	40 %	20 %	212550292
6	NC_011562	CATCT	2	10	5870	5879	20 %	40 %	0 %	40 %	212550293
7	NC_011562	TTGCT	2	10	6151	6160	0 %	60 %	20 %	20 %	212550293
8	NC_011562	AAAGA	2	10	6197	6206	80 %	0 %	20 %	0 %	212550293
9	NC_011562	GTGTC	2	10	9660	9669	0 %	40 %	40 %	20 %	212550297
10	NC_011562	GCATA	2	10	10046	10055	40 %	20 %	20 %	20 %	212550297
11	NC_011562	AGAGA	2	10	13043	13052	60 %	0 %	40 %	0 %	212550298
12	NC_011562	ACAAA	2	10	13698	13707	80 %	0 %	0 %	20 %	212550298
13	NC_011562	CTTTT	2	10	17183	17192	0 %	80 %	0 %	20 %	212550301
14	NC_011562	CATTC	2	10	19072	19081	20 %	40 %	0 %	40 %	212550303
15	NC_011562	CAGTC	2	10	19102	19111	20 %	20 %	20 %	40 %	212550303
16	NC_011562	TCTGC	2	10	19149	19158	0 %	40 %	20 %	40 %	212550303
17	NC_011562	CTTTA	2	10	19412	19421	20 %	60 %	0 %	20 %	212550303
18	NC_011562	CATTC	2	10	19489	19498	20 %	40 %	0 %	40 %	212550303
19	NC_011562	CTTAT	2	10	19629	19638	20 %	60 %	0 %	20 %	212550303
20	NC_011562	CTTTT	2	10	19993	20002	0 %	80 %	0 %	20 %	212550303
21	NC_011562	ATTTC	2	10	20344	20353	20 %	60 %	0 %	20 %	212550303
22	NC_011562	TCTGA	2	10	21897	21906	20 %	40 %	20 %	20 %	212550305
23	NC_011562	TATGC	2	10	23731	23740	20 %	40 %	20 %	20 %	212550307
24	NC_011562	AGAAA	2	10	29027	29036	80 %	0 %	20 %	0 %	212550311
25	NC_011562	TGTTT	2	10	29214	29223	0 %	80 %	20 %	0 %	212550312

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.