MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	TTTA	2	8	331	338	25 %	75 %	0 %	0 %	212550289
2	NC_011562	TTGA	2	8	370	377	25 %	50 %	25 %	0 %	212550289
3	NC_011562	AATA	2	8	601	608	75 %	25 %	0 %	0 %	212550289
4	NC_011562	GTAG	2	8	724	731	25 %	25 %	50 %	0 %	212550289
5	NC_011562	AGTA	2	8	898	905	50 %	25 %	25 %	0 %	212550289
6	NC_011562	ATTC	2	8	1240	1247	25 %	50 %	0 %	25 %	212550289
7	NC_011562	GAAA	2	8	1322	1329	75 %	0 %	25 %	0 %	212550289
8	NC_011562	GAAG	2	8	1425	1432	50 %	0 %	50 %	0 %	212550289
9	NC_011562	TGAA	2	8	1439	1446	50 %	25 %	25 %	0 %	212550289
10	NC_011562	ACTG	2	8	1724	1731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011562	GGAA	2	8	1851	1858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011562	GACA	2	8	1956	1963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011562	GATG	2	8	2030	2037	25 %	25 %	50 %	0 %	212550290
14	NC_011562	AGAT	2	8	2407	2414	50 %	25 %	25 %	0 %	212550290
15	NC_011562	CTAC	2	8	2433	2440	25 %	25 %	0 %	50 %	212550290
16	NC_011562	GAAT	2	8	2562	2569	50 %	25 %	25 %	0 %	212550290
17	NC_011562	TATT	2	8	2690	2697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011562	GAAT	2	8	3086	3093	50 %	25 %	25 %	0 %	212550291
19	NC_011562	ATAC	2	8	3527	3534	50 %	25 %	0 %	25 %	212550292
20	NC_011562	TCAA	2	8	4151	4158	50 %	25 %	0 %	25 %	212550292
21	NC_011562	ATCC	2	8	4554	4561	25 %	25 %	0 %	50 %	212550292
22	NC_011562	TGCT	2	8	4642	4649	0 %	50 %	25 %	25 %	212550292
23	NC_011562	TATG	2	8	4683	4690	25 %	50 %	25 %	0 %	212550292
24	NC_011562	TTTC	2	8	5223	5230	0 %	75 %	0 %	25 %	212550292
25	NC_011562	TTCA	2	8	5630	5637	25 %	50 %	0 %	25 %	212550293
26	NC_011562	ATTC	2	8	5779	5786	25 %	50 %	0 %	25 %	212550293
27	NC_011562	TCTT	2	8	6448	6455	0 %	75 %	0 %	25 %	212550294
28	NC_011562	ATGT	2	8	6561	6568	25 %	50 %	25 %	0 %	212550294
29	NC_011562	TTTC	2	8	6617	6624	0 %	75 %	0 %	25 %	212550294
30	NC_011562	AGCT	2	8	6890	6897	25 %	25 %	25 %	25 %	212550295
31	NC_011562	TTCT	2	8	7190	7197	0 %	75 %	0 %	25 %	212550295
32	NC_011562	GCAG	2	8	7325	7332	25 %	0 %	50 %	25 %	212550295
33	NC_011562	TTTG	2	8	7496	7503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011562	AAAT	2	8	7624	7631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011562	TATT	2	8	7883	7890	25 %	75 %	0 %	0 %	212550296
36	NC_011562	TTTA	2	8	8074	8081	25 %	75 %	0 %	0 %	212550296
37	NC_011562	AACA	2	8	8246	8253	75 %	0 %	0 %	25 %	212550296
38	NC_011562	GAAG	2	8	8746	8753	50 %	0 %	50 %	0 %	212550296
39	NC_011562	TTCG	2	8	9012	9019	0 %	50 %	25 %	25 %	212550296
40	NC_011562	AGAT	2	8	9553	9560	50 %	25 %	25 %	0 %	212550297
41	NC_011562	GATA	2	8	9797	9804	50 %	25 %	25 %	0 %	212550297
42	NC_011562	CTTT	2	8	9908	9915	0 %	75 %	0 %	25 %	212550297
43	NC_011562	TATT	2	8	9958	9965	25 %	75 %	0 %	0 %	212550297
44	NC_011562	CAGA	2	8	10025	10032	50 %	0 %	25 %	25 %	212550297
45	NC_011562	TCAA	2	8	10195	10202	50 %	25 %	0 %	25 %	212550297
46	NC_011562	CTTT	2	8	10298	10305	0 %	75 %	0 %	25 %	212550297
47	NC_011562	AATG	2	8	10633	10640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011562	TTCT	2	8	10668	10675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011562	TGTC	2	8	11021	11028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011562	AAAG	2	8	11326	11333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011562	CGTT	2	8	11671	11678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011562	TGGG	2	8	11686	11693	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011562	CCCA	2	8	11728	11735	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_011562	CATA	2	8	11990	11997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011562	CCCA	2	8	12410	12417	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_011562	GTAC	2	8	12472	12479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011562	GAAT	2	8	12495	12502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011562	ATGT	2	8	13552	13559	25 %	50 %	25 %	0 %	212550298
59	NC_011562	TGAA	2	8	13675	13682	50 %	25 %	25 %	0 %	212550298
60	NC_011562	AGAT	2	8	13947	13954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011562	AATG	2	8	14002	14009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011562	TAGA	2	8	14122	14129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011562	GCAC	2	8	14314	14321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011562	AGGC	2	8	14346	14353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011562	AAAC	2	8	14646	14653	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011562	AGTA	2	8	14910	14917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011562	GTTG	2	8	15114	15121	0 %	50 %	50 %	0 %	212550299
68	NC_011562	ATGA	2	8	15396	15403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011562	AGAA	2	8	15904	15911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011562	TTGG	2	8	16592	16599	0 %	50 %	50 %	0 %	212550300
71	NC_011562	CTGT	2	8	17074	17081	0 %	50 %	25 %	25 %	212550301
72	NC_011562	TTCT	2	8	17087	17094	0 %	75 %	0 %	25 %	212550301
73	NC_011562	CCTT	2	8	17631	17638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011562	CGGT	2	8	18041	18048	0 %	25 %	50 %	25 %	212550302
75	NC_011562	ATGT	2	8	18103	18110	25 %	50 %	25 %	0 %	212550302
76	NC_011562	CTAT	2	8	18353	18360	25 %	50 %	0 %	25 %	212550302
77	NC_011562	CCAT	2	8	19355	19362	25 %	25 %	0 %	50 %	212550303
78	NC_011562	AGTC	2	8	19516	19523	25 %	25 %	25 %	25 %	212550303
79	NC_011562	CAAC	2	8	19524	19531	50 %	0 %	0 %	50 %	212550303
80	NC_011562	CTAT	2	8	19704	19711	25 %	50 %	0 %	25 %	212550303
81	NC_011562	CCAT	2	8	19772	19779	25 %	25 %	0 %	50 %	212550303
82	NC_011562	TTTA	2	8	20129	20136	25 %	75 %	0 %	0 %	212550303
83	NC_011562	AGAT	2	8	20390	20397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011562	ACCA	2	8	21416	21423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011562	TTTC	2	8	21496	21503	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011562	TCTT	2	8	21543	21550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011562	TTAT	2	8	21667	21674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011562	AATG	2	8	21728	21735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011562	GACA	2	8	21776	21783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011562	ATTC	2	8	21795	21802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011562	ATTG	2	8	23073	23080	25 %	50 %	25 %	0 %	212550306
92	NC_011562	ATAA	2	8	23630	23637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011562	CATC	2	8	23799	23806	25 %	25 %	0 %	50 %	212550307
94	NC_011562	TCTT	2	8	24483	24490	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011562	TGCC	2	8	25142	25149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011562	CTAT	2	8	25535	25542	25 %	50 %	0 %	25 %	212550308
97	NC_011562	GGAT	2	8	25568	25575	25 %	25 %	50 %	0 %	212550308
98	NC_011562	TAAG	2	8	25830	25837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011562	ATTT	2	8	26040	26047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011562	TGTT	2	8	26099	26106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011562	GTAT	2	8	26360	26367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011562	AGAT	2	8	26493	26500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011562	AGTA	2	8	26749	26756	50 %	25 %	25 %	0 %	212550309
104	NC_011562	GTAA	2	8	26771	26778	50 %	25 %	25 %	0 %	212550309
105	NC_011562	TTTG	2	8	27170	27177	0 %	75 %	25 %	0 %	212550309
106	NC_011562	TAAT	2	8	27210	27217	50 %	50 %	0 %	0 %	212550309
107	NC_011562	TATC	2	8	27221	27228	25 %	50 %	0 %	25 %	212550309
108	NC_011562	CAGA	2	8	27244	27251	50 %	0 %	25 %	25 %	212550309
109	NC_011562	GTTA	2	8	27348	27355	25 %	50 %	25 %	0 %	212550309
110	NC_011562	TATC	2	8	27436	27443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011562	AGGA	2	8	27698	27705	50 %	0 %	50 %	0 %	212550310
112	NC_011562	TATT	2	8	28107	28114	25 %	75 %	0 %	0 %	212550311
113	NC_011562	AGAC	2	8	28991	28998	50 %	0 %	25 %	25 %	212550311
114	NC_011562	TTAT	2	8	29076	29083	25 %	75 %	0 %	0 %	212550312
115	NC_011562	TCCT	2	8	29225	29232	0 %	50 %	0 %	50 %	212550312
116	NC_011562	CTGT	2	8	29907	29914	0 %	50 %	25 %	25 %	212550313
117	NC_011562	TGGT	2	8	31000	31007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011562	AATG	2	8	31076	31083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011562	TTTA	2	8	31219	31226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011562	ATAA	2	8	31229	31236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011562	TAAT	2	8	31757	31764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011562	TAAT	2	8	31789	31796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011562	TAAT	2	8	31821	31828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.