MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	TTTA	2	8	331	338	25 %	75 %	0 %	0 %	212550289
2	NC_011562	TTGA	2	8	370	377	25 %	50 %	25 %	0 %	212550289
3	NC_011562	AATA	2	8	601	608	75 %	25 %	0 %	0 %	212550289
4	NC_011562	GTAG	2	8	724	731	25 %	25 %	50 %	0 %	212550289
5	NC_011562	AGTA	2	8	898	905	50 %	25 %	25 %	0 %	212550289
6	NC_011562	ATTC	2	8	1240	1247	25 %	50 %	0 %	25 %	212550289
7	NC_011562	GAAA	2	8	1322	1329	75 %	0 %	25 %	0 %	212550289
8	NC_011562	GAAG	2	8	1425	1432	50 %	0 %	50 %	0 %	212550289
9	NC_011562	TGAA	2	8	1439	1446	50 %	25 %	25 %	0 %	212550289
10	NC_011562	GATG	2	8	2030	2037	25 %	25 %	50 %	0 %	212550290
11	NC_011562	AGAT	2	8	2407	2414	50 %	25 %	25 %	0 %	212550290
12	NC_011562	CTAC	2	8	2433	2440	25 %	25 %	0 %	50 %	212550290
13	NC_011562	GAAT	2	8	2562	2569	50 %	25 %	25 %	0 %	212550290
14	NC_011562	GAAT	2	8	3086	3093	50 %	25 %	25 %	0 %	212550291
15	NC_011562	ATAC	2	8	3527	3534	50 %	25 %	0 %	25 %	212550292
16	NC_011562	TCAA	2	8	4151	4158	50 %	25 %	0 %	25 %	212550292
17	NC_011562	ATCC	2	8	4554	4561	25 %	25 %	0 %	50 %	212550292
18	NC_011562	TGCT	2	8	4642	4649	0 %	50 %	25 %	25 %	212550292
19	NC_011562	TATG	2	8	4683	4690	25 %	50 %	25 %	0 %	212550292
20	NC_011562	TTTC	2	8	5223	5230	0 %	75 %	0 %	25 %	212550292
21	NC_011562	TTCA	2	8	5630	5637	25 %	50 %	0 %	25 %	212550293
22	NC_011562	ATTC	2	8	5779	5786	25 %	50 %	0 %	25 %	212550293
23	NC_011562	TCTT	2	8	6448	6455	0 %	75 %	0 %	25 %	212550294
24	NC_011562	ATGT	2	8	6561	6568	25 %	50 %	25 %	0 %	212550294
25	NC_011562	TTTC	2	8	6617	6624	0 %	75 %	0 %	25 %	212550294
26	NC_011562	AGCT	2	8	6890	6897	25 %	25 %	25 %	25 %	212550295
27	NC_011562	TTCT	2	8	7190	7197	0 %	75 %	0 %	25 %	212550295
28	NC_011562	GCAG	2	8	7325	7332	25 %	0 %	50 %	25 %	212550295
29	NC_011562	TATT	2	8	7883	7890	25 %	75 %	0 %	0 %	212550296
30	NC_011562	TTTA	2	8	8074	8081	25 %	75 %	0 %	0 %	212550296
31	NC_011562	AACA	2	8	8246	8253	75 %	0 %	0 %	25 %	212550296
32	NC_011562	GAAG	2	8	8746	8753	50 %	0 %	50 %	0 %	212550296
33	NC_011562	TTCG	2	8	9012	9019	0 %	50 %	25 %	25 %	212550296
34	NC_011562	AGAT	2	8	9553	9560	50 %	25 %	25 %	0 %	212550297
35	NC_011562	GATA	2	8	9797	9804	50 %	25 %	25 %	0 %	212550297
36	NC_011562	CTTT	2	8	9908	9915	0 %	75 %	0 %	25 %	212550297
37	NC_011562	TATT	2	8	9958	9965	25 %	75 %	0 %	0 %	212550297
38	NC_011562	CAGA	2	8	10025	10032	50 %	0 %	25 %	25 %	212550297
39	NC_011562	TCAA	2	8	10195	10202	50 %	25 %	0 %	25 %	212550297
40	NC_011562	CTTT	2	8	10298	10305	0 %	75 %	0 %	25 %	212550297
41	NC_011562	ATGT	2	8	13552	13559	25 %	50 %	25 %	0 %	212550298
42	NC_011562	TGAA	2	8	13675	13682	50 %	25 %	25 %	0 %	212550298
43	NC_011562	GTTG	2	8	15114	15121	0 %	50 %	50 %	0 %	212550299
44	NC_011562	TTGG	2	8	16592	16599	0 %	50 %	50 %	0 %	212550300
45	NC_011562	CTGT	2	8	17074	17081	0 %	50 %	25 %	25 %	212550301
46	NC_011562	TTCT	2	8	17087	17094	0 %	75 %	0 %	25 %	212550301
47	NC_011562	CGGT	2	8	18041	18048	0 %	25 %	50 %	25 %	212550302
48	NC_011562	ATGT	2	8	18103	18110	25 %	50 %	25 %	0 %	212550302
49	NC_011562	CTAT	2	8	18353	18360	25 %	50 %	0 %	25 %	212550302
50	NC_011562	CCAT	2	8	19355	19362	25 %	25 %	0 %	50 %	212550303
51	NC_011562	AGTC	2	8	19516	19523	25 %	25 %	25 %	25 %	212550303
52	NC_011562	CAAC	2	8	19524	19531	50 %	0 %	0 %	50 %	212550303
53	NC_011562	CTAT	2	8	19704	19711	25 %	50 %	0 %	25 %	212550303
54	NC_011562	CCAT	2	8	19772	19779	25 %	25 %	0 %	50 %	212550303
55	NC_011562	TTTA	2	8	20129	20136	25 %	75 %	0 %	0 %	212550303
56	NC_011562	ATTG	2	8	23073	23080	25 %	50 %	25 %	0 %	212550306
57	NC_011562	CATC	2	8	23799	23806	25 %	25 %	0 %	50 %	212550307
58	NC_011562	CTAT	2	8	25535	25542	25 %	50 %	0 %	25 %	212550308
59	NC_011562	GGAT	2	8	25568	25575	25 %	25 %	50 %	0 %	212550308
60	NC_011562	AGTA	2	8	26749	26756	50 %	25 %	25 %	0 %	212550309
61	NC_011562	GTAA	2	8	26771	26778	50 %	25 %	25 %	0 %	212550309
62	NC_011562	TTTG	2	8	27170	27177	0 %	75 %	25 %	0 %	212550309
63	NC_011562	TAAT	2	8	27210	27217	50 %	50 %	0 %	0 %	212550309
64	NC_011562	TATC	2	8	27221	27228	25 %	50 %	0 %	25 %	212550309
65	NC_011562	CAGA	2	8	27244	27251	50 %	0 %	25 %	25 %	212550309
66	NC_011562	GTTA	2	8	27348	27355	25 %	50 %	25 %	0 %	212550309
67	NC_011562	AGGA	2	8	27698	27705	50 %	0 %	50 %	0 %	212550310
68	NC_011562	TATT	2	8	28107	28114	25 %	75 %	0 %	0 %	212550311
69	NC_011562	AGAC	2	8	28991	28998	50 %	0 %	25 %	25 %	212550311
70	NC_011562	TTAT	2	8	29076	29083	25 %	75 %	0 %	0 %	212550312
71	NC_011562	TCCT	2	8	29225	29232	0 %	50 %	0 %	50 %	212550312
72	NC_011562	CTGT	2	8	29907	29914	0 %	50 %	25 %	25 %	212550313

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.