MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 479

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	GAA	2	6	25	30	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550289
2	NC_011562	AAC	2	6	99	104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550289
3	NC_011562	ATT	2	6	174	179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550289
4	NC_011562	TTC	2	6	242	247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550289
5	NC_011562	TAG	2	6	263	268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550289
6	NC_011562	AGT	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550289
7	NC_011562	AGA	2	6	654	659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550289
8	NC_011562	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550289
9	NC_011562	GTT	2	6	820	825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550289
10	NC_011562	TTC	2	6	836	841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550289
11	NC_011562	AAG	2	6	991	996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550289
12	NC_011562	AGA	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550289
13	NC_011562	CAG	2	6	1096	1101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550289
14	NC_011562	ATC	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550289
15	NC_011562	ATT	2	6	1154	1159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550289
16	NC_011562	GCT	2	6	1339	1344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550289
17	NC_011562	CTA	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550289
18	NC_011562	TAG	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550289
19	NC_011562	AGA	2	6	1654	1659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011562	TAA	2	6	1675	1680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011562	TTC	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011562	GAG	2	6	1758	1763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011562	CAC	2	6	1974	1979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011562	AGC	2	6	1995	2000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011562	TAA	2	6	2039	2044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550290
26	NC_011562	TTC	2	6	2050	2055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550290
27	NC_011562	TCT	2	6	2059	2064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550290
28	NC_011562	AGA	2	6	2198	2203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550290
29	NC_011562	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550290
30	NC_011562	AAG	2	6	2472	2477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550290
31	NC_011562	TTG	2	6	2626	2631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011562	TTC	2	6	2853	2858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550291
33	NC_011562	GAA	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550291
34	NC_011562	TCA	2	6	2890	2895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550291
35	NC_011562	TTC	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550291
36	NC_011562	TGG	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550291
37	NC_011562	GAA	2	6	3117	3122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550291
38	NC_011562	AGG	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550291
39	NC_011562	AAT	2	6	3151	3156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011562	TTG	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550292
41	NC_011562	TAT	2	6	3403	3408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550292
42	NC_011562	CTT	2	6	3495	3500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550292
43	NC_011562	GAT	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550292
44	NC_011562	TTA	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550292
45	NC_011562	TCT	2	6	3827	3832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550292
46	NC_011562	CAT	2	6	3912	3917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550292
47	NC_011562	TTC	2	6	3942	3947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550292
48	NC_011562	TGG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550292
49	NC_011562	TGG	2	6	4045	4050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550292
50	NC_011562	TGT	2	6	4100	4105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550292
51	NC_011562	TTG	2	6	4233	4238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550292
52	NC_011562	CAA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550292
53	NC_011562	ATA	2	6	4374	4379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550292
54	NC_011562	CTA	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550292
55	NC_011562	AAG	2	6	4517	4522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550292
56	NC_011562	TTC	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550292
57	NC_011562	ATT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550292
58	NC_011562	ATT	2	6	4784	4789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550292
59	NC_011562	GTA	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550292
60	NC_011562	CTC	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550292
61	NC_011562	CAT	2	6	5034	5039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550292
62	NC_011562	ATA	2	6	5188	5193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550292
63	NC_011562	ACA	2	6	5213	5218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550292
64	NC_011562	TAT	2	6	5272	5277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550292
65	NC_011562	TAT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011562	TCA	2	6	5330	5335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011562	TCT	2	6	5364	5369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550293
68	NC_011562	TCT	3	9	5411	5419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550293
69	NC_011562	TTA	2	6	5451	5456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550293
70	NC_011562	TCT	2	6	5484	5489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550293
71	NC_011562	TCC	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550293
72	NC_011562	TAT	2	6	5707	5712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550293
73	NC_011562	GCA	2	6	6123	6128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550293
74	NC_011562	ATC	2	6	6132	6137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550293
75	NC_011562	ACA	2	6	6229	6234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550293
76	NC_011562	ATT	2	6	6345	6350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011562	CAA	2	6	6351	6356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011562	ACA	2	6	6361	6366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011562	AAT	2	6	6407	6412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011562	TGA	2	6	6482	6487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550294
81	NC_011562	GTA	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550294
82	NC_011562	CTT	2	6	6503	6508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550294
83	NC_011562	CTT	2	6	6535	6540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550294
84	NC_011562	GTT	2	6	6630	6635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550294
85	NC_011562	GAT	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550294
86	NC_011562	GAA	2	6	6677	6682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550294
87	NC_011562	GTT	2	6	6701	6706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550294
88	NC_011562	TAA	2	6	6731	6736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550295
89	NC_011562	TGC	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550295
90	NC_011562	GTT	2	6	6833	6838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550295
91	NC_011562	ATG	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550295
92	NC_011562	CTA	2	6	7132	7137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550295
93	NC_011562	AAG	2	6	7145	7150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550295
94	NC_011562	GCA	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550295
95	NC_011562	TTC	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550295
96	NC_011562	CTC	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550295
97	NC_011562	TGT	2	6	7438	7443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550295
98	NC_011562	TTC	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550295
99	NC_011562	TGC	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550296
100	NC_011562	TCT	2	6	7875	7880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
101	NC_011562	TAT	2	6	7990	7995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550296
102	NC_011562	CTC	2	6	8086	8091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550296
103	NC_011562	ATC	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550296
104	NC_011562	ATA	2	6	8360	8365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550296
105	NC_011562	TTG	2	6	8373	8378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550296
106	NC_011562	CTA	2	6	8379	8384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550296
107	NC_011562	TAT	2	6	8385	8390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550296
108	NC_011562	TTC	2	6	8401	8406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
109	NC_011562	ACT	2	6	8428	8433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550296
110	NC_011562	TTG	2	6	8438	8443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550296
111	NC_011562	AGC	2	6	8578	8583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550296
112	NC_011562	ATG	2	6	8585	8590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550296
113	NC_011562	CCA	2	6	8612	8617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550296
114	NC_011562	TCT	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
115	NC_011562	TCT	2	6	8702	8707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
116	NC_011562	CAC	2	6	8715	8720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550296
117	NC_011562	GAC	2	6	8722	8727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550296
118	NC_011562	TTA	2	6	8828	8833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550296
119	NC_011562	GAA	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550296
120	NC_011562	TCT	2	6	8884	8889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
121	NC_011562	TTC	2	6	8899	8904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
122	NC_011562	ATA	2	6	8917	8922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550296
123	NC_011562	CTA	2	6	8961	8966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550296
124	NC_011562	TCT	2	6	8981	8986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550296
125	NC_011562	GGC	2	6	9070	9075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212550296
126	NC_011562	TAT	2	6	9241	9246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550297
127	NC_011562	TTA	2	6	9259	9264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550297
128	NC_011562	ATT	2	6	9280	9285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550297
129	NC_011562	TGC	2	6	9306	9311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550297
130	NC_011562	TTG	2	6	9401	9406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550297
131	NC_011562	GCT	2	6	9472	9477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550297
132	NC_011562	TCT	2	6	9493	9498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550297
133	NC_011562	TCT	2	6	9512	9517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550297
134	NC_011562	TTC	2	6	9535	9540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550297
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259	NC_011562	ATT	2	6	17406	17411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_011562	CTT	2	6	17671	17676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_011562	AAT	2	6	17684	17689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_011562	GAT	2	6	17745	17750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550302
264	NC_011562	TTG	2	6	17827	17832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550302
265	NC_011562	ATT	2	6	17947	17952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550302
266	NC_011562	TTG	3	9	17962	17970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550302
267	NC_011562	GAA	2	6	17992	17997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550302
268	NC_011562	GTC	2	6	18082	18087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550302
269	NC_011562	TCT	2	6	18149	18154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550302
270	NC_011562	TTG	2	6	18262	18267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550302
271	NC_011562	CAT	2	6	18277	18282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550302
272	NC_011562	TCT	2	6	18300	18305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550302
273	NC_011562	TCC	2	6	18336	18341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550302
274	NC_011562	TCT	2	6	18377	18382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550302
275	NC_011562	AAT	2	6	18416	18421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550302
276	NC_011562	TGT	2	6	18447	18452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550302
277	NC_011562	TCA	2	6	18453	18458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550302
278	NC_011562	TTC	2	6	18602	18607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550302
279	NC_011562	TAA	2	6	18620	18625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_011562	GCA	2	6	18691	18696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_011562	CAC	2	6	18720	18725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_011562	GAT	2	6	18813	18818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011562	ATT	2	6	18853	18858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_011562	CAT	2	6	18886	18891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_011562	CAC	2	6	18903	18908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_011562	GAT	2	6	18979	18984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550303
287	NC_011562	TCT	2	6	19053	19058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550303
288	NC_011562	TCC	2	6	19171	19176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550303
289	NC_011562	ATC	2	6	19187	19192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550303
290	NC_011562	TAC	2	6	19207	19212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550303
291	NC_011562	TTG	2	6	19221	19226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550303
292	NC_011562	ATT	2	6	19241	19246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550303
293	NC_011562	TCA	2	6	19300	19305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550303
294	NC_011562	ATC	2	6	19334	19339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550303
295	NC_011562	TCT	2	6	19470	19475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550303
296	NC_011562	CAC	2	6	19606	19611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550303
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298	NC_011562	TTG	2	6	19923	19928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550303
299	NC_011562	ATC	2	6	20009	20014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550303
300	NC_011562	GTT	2	6	20084	20089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550303
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302	NC_011562	TGT	2	6	20281	20286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550303
303	NC_011562	AGA	2	6	20323	20328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550303
304	NC_011562	AGA	2	6	20376	20381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
305	NC_011562	GTT	2	6	20458	20463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550304
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315	NC_011562	ATT	2	6	21270	21275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_011562	TTA	2	6	21309	21314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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318	NC_011562	TCC	3	9	21441	21449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
319	NC_011562	TGT	2	6	21512	21517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_011562	TAA	2	6	21661	21666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_011562	GAT	2	6	21810	21815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
324	NC_011562	AGT	2	6	21824	21829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_011562	TAG	2	6	22526	22531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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348	NC_011562	ATA	2	6	23574	23579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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362	NC_011562	ATA	2	6	24637	24642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_011562	ATG	2	6	26029	26034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_011562	TTA	2	6	26216	26221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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394	NC_011562	TAT	2	6	26255	26260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_011562	AAT	2	6	26324	26329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_011562	CAT	2	6	26469	26474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
397	NC_011562	GTT	2	6	26483	26488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
398	NC_011562	TCT	2	6	26535	26540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_011562	CTT	2	6	26553	26558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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408	NC_011562	CTT	2	6	27490	27495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550310
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442	NC_011562	TAT	2	6	29617	29622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_011562	CGT	2	6	31449	31454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_011562	GTT	2	6	31583	31588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_011562	TAT	2	6	31856	31861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding