MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	AGA	2	6	1654	1659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011562	TAA	2	6	1675	1680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011562	TTC	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011562	GAG	2	6	1758	1763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011562	CAC	2	6	1974	1979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011562	AGC	2	6	1995	2000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011562	TTG	2	6	2626	2631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011562	AAT	2	6	3151	3156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011562	TAT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011562	TCA	2	6	5330	5335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011562	ATT	2	6	6345	6350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011562	CAA	2	6	6351	6356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011562	ACA	2	6	6361	6366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011562	AAT	2	6	6407	6412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011562	TAA	2	6	10652	10657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011562	AGG	2	6	10752	10757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011562	TGT	2	6	10765	10770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011562	TCT	3	9	10792	10800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011562	CAT	2	6	10808	10813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011562	GAA	2	6	10889	10894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011562	CAA	2	6	10895	10900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011562	TCT	15	45	10909	10953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011562	TTC	2	6	10959	10964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011562	ATC	2	6	10983	10988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011562	GTT	2	6	11003	11008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011562	TGT	3	9	11117	11125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011562	ACA	2	6	11135	11140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011562	TGT	2	6	11182	11187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011562	ATA	2	6	11278	11283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011562	AAC	2	6	11311	11316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011562	TCA	2	6	11432	11437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011562	ATC	2	6	11491	11496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011562	GCT	2	6	11558	11563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011562	GCA	2	6	11584	11589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011562	GTT	2	6	11616	11621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011562	GCT	2	6	11712	11717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011562	AGA	2	6	11860	11865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011562	CAT	2	6	11868	11873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011562	CAT	2	6	11930	11935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011562	TAC	2	6	11999	12004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011562	GAT	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011562	GCA	2	6	12105	12110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011562	TAA	2	6	12276	12281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011562	ACA	2	6	12310	12315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011562	ACT	2	6	12511	12516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011562	TCT	2	6	12588	12593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011562	GTA	2	6	12605	12610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011562	ATA	2	6	12736	12741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011562	ATT	2	6	13809	13814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011562	TTG	2	6	13890	13895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011562	ATC	2	6	13910	13915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011562	ATG	2	6	13995	14000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011562	ATA	2	6	14163	14168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011562	CTA	2	6	14236	14241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011562	TTG	2	6	14245	14250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011562	GAA	3	9	14276	14284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011562	AGA	2	6	14553	14558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011562	TGA	2	6	14582	14587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011562	GAA	2	6	14596	14601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011562	TGA	2	6	14789	14794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011562	ATA	2	6	14863	14868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011562	ATG	2	6	14884	14889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011562	CAA	3	9	15253	15261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011562	CAT	2	6	15266	15271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011562	TGA	2	6	15323	15328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011562	AGA	3	9	15344	15352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011562	AAG	2	6	15375	15380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011562	CAG	2	6	15418	15423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011562	GAA	2	6	15474	15479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011562	GAA	2	6	15490	15495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011562	ACG	2	6	15513	15518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011562	ATT	2	6	15581	15586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011562	AGA	2	6	15637	15642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011562	ATT	2	6	15746	15751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011562	TTC	2	6	15759	15764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011562	ATG	2	6	15771	15776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011562	TAT	2	6	15786	15791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011562	GTA	2	6	15804	15809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011562	ATC	2	6	15815	15820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011562	CAG	2	6	15850	15855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011562	GGA	2	6	16058	16063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011562	TAA	2	6	16094	16099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011562	TGA	2	6	17289	17294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011562	TAA	2	6	17305	17310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011562	GTA	2	6	17360	17365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011562	ATT	2	6	17406	17411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011562	CAA	2	6	17523	17528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011562	CTT	2	6	17671	17676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011562	AAT	2	6	17684	17689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011562	TAA	2	6	18620	18625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011562	GCA	2	6	18691	18696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011562	CAC	2	6	18720	18725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011562	GAT	2	6	18813	18818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011562	ATT	2	6	18853	18858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011562	CAT	2	6	18886	18891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011562	CAC	2	6	18903	18908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011562	AGA	2	6	20376	20381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011562	ATT	2	6	21270	21275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011562	TTA	2	6	21309	21314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011562	ATC	2	6	21332	21337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011562	TCC	3	9	21441	21449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011562	TGT	2	6	21512	21517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011562	AAC	2	6	21613	21618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011562	TAA	2	6	21661	21666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011562	CTT	2	6	21740	21745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011562	GAT	2	6	21810	21815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011562	AGT	2	6	21824	21829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011562	TTG	2	6	22274	22279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011562	ATA	2	6	22291	22296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011562	TTC	2	6	22498	22503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011562	TAG	2	6	22526	22531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011562	CTG	2	6	23348	23353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011562	CAT	2	6	23396	23401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011562	GTA	2	6	23445	23450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011562	CAT	2	6	23493	23498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011562	ATA	2	6	23574	23579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011562	AAT	2	6	23641	23646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011562	TGT	2	6	23684	23689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011562	GAC	2	6	23701	23706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011562	TCG	2	6	24189	24194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011562	TTC	2	6	24285	24290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011562	ATA	2	6	24496	24501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011562	ATA	2	6	24572	24577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011562	ATA	2	6	24637	24642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011562	TCC	2	6	24692	24697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011562	ATT	3	9	24721	24729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011562	GTA	2	6	24792	24797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011562	CTT	2	6	24889	24894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011562	ATC	3	9	24895	24903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011562	AGC	2	6	24999	25004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011562	AAC	2	6	25068	25073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011562	CAG	2	6	25080	25085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011562	ACT	2	6	25117	25122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011562	TCT	2	6	25123	25128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011562	ATT	2	6	25129	25134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011562	TAT	2	6	25188	25193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011562	TTC	2	6	25195	25200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011562	TTA	2	6	25803	25808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011562	TAC	2	6	25917	25922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011562	GTT	2	6	25934	25939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011562	TTC	2	6	25949	25954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011562	CTT	2	6	26003	26008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011562	ATG	2	6	26029	26034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011562	TCT	2	6	26064	26069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011562	ATT	2	6	26141	26146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011562	TTA	2	6	26216	26221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011562	ACA	2	6	26223	26228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011562	TAT	2	6	26255	26260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011562	AAT	2	6	26324	26329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011562	CAT	2	6	26469	26474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011562	GTT	2	6	26483	26488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011562	TCT	2	6	26535	26540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011562	CTT	2	6	26553	26558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_011562	AAC	2	6	27379	27384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_011562	GTT	2	6	27811	27816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011562	TAA	2	6	28053	28058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011562	TCT	2	6	28072	28077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_011562	GTT	2	6	29060	29065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011562	TTC	2	6	29395	29400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_011562	CTT	2	6	29421	29426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_011562	CAT	2	6	29427	29432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_011562	CTT	2	6	29442	29447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_011562	ATC	2	6	29491	29496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_011562	CTT	2	6	29530	29535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_011562	TAT	2	6	29617	29622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011562	ACT	2	6	30131	30136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_011562	TCT	2	6	30158	30163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_011562	ATC	2	6	30380	30385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_011562	AAT	2	6	30388	30393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_011562	ATA	2	6	30404	30409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_011562	GAA	2	6	30507	30512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_011562	TTC	3	9	30561	30569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_011562	CAT	2	6	30575	30580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_011562	ATG	2	6	30620	30625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_011562	AGT	2	6	30726	30731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_011562	CAT	2	6	30732	30737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_011562	TGT	2	6	30776	30781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_011562	TCA	2	6	30846	30851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_011562	TCT	3	9	30867	30875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_011562	ATT	2	6	30955	30960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011562	AAC	2	6	31024	31029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_011562	AAG	2	6	31031	31036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011562	CCA	2	6	31062	31067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_011562	AAT	2	6	31181	31186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_011562	TAA	2	6	31201	31206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_011562	TTC	2	6	31273	31278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_011562	ATG	2	6	31280	31285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_011562	TCC	2	6	31395	31400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
190	NC_011562	TTC	2	6	31424	31429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_011562	CGT	2	6	31449	31454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_011562	TAT	2	6	31856	31861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.