MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	TA	3	6	123	128	50 %	50 %	0 %	0 %	212550289
2	NC_011562	TA	3	6	1531	1536	50 %	50 %	0 %	0 %	212550289
3	NC_011562	TC	3	6	1861	1866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011562	TG	3	6	3061	3066	0 %	50 %	50 %	0 %	212550291
5	NC_011562	AT	3	6	3333	3338	50 %	50 %	0 %	0 %	212550292
6	NC_011562	TC	3	6	4530	4535	0 %	50 %	0 %	50 %	212550292
7	NC_011562	CT	3	6	5418	5423	0 %	50 %	0 %	50 %	212550293
8	NC_011562	TA	3	6	5807	5812	50 %	50 %	0 %	0 %	212550293
9	NC_011562	AT	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	212550293
10	NC_011562	CT	3	6	6159	6164	0 %	50 %	0 %	50 %	212550293
11	NC_011562	AT	3	6	7505	7510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011562	AT	3	6	7772	7777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011562	AT	3	6	7780	7785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011562	AC	3	6	8011	8016	50 %	0 %	0 %	50 %	212550296
15	NC_011562	AG	3	6	8059	8064	50 %	0 %	50 %	0 %	212550296
16	NC_011562	CT	3	6	8805	8810	0 %	50 %	0 %	50 %	212550296
17	NC_011562	AG	3	6	8816	8821	50 %	0 %	50 %	0 %	212550296
18	NC_011562	TA	3	6	8822	8827	50 %	50 %	0 %	0 %	212550296
19	NC_011562	AT	3	6	8975	8980	50 %	50 %	0 %	0 %	212550296
20	NC_011562	AT	3	6	9704	9709	50 %	50 %	0 %	0 %	212550297
21	NC_011562	GA	3	6	9932	9937	50 %	0 %	50 %	0 %	212550297
22	NC_011562	TA	3	6	10476	10481	50 %	50 %	0 %	0 %	212550297
23	NC_011562	GA	3	6	11246	11251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011562	AG	3	6	11956	11961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011562	AG	3	6	12158	12163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011562	TA	4	8	12951	12958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011562	GT	3	6	13368	13373	0 %	50 %	50 %	0 %	212550298
28	NC_011562	TG	3	6	14100	14105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011562	AG	3	6	14207	14212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011562	AG	3	6	14606	14611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011562	AT	3	6	15052	15057	50 %	50 %	0 %	0 %	212550299
32	NC_011562	GA	4	8	15167	15174	50 %	0 %	50 %	0 %	212550299
33	NC_011562	GA	3	6	15190	15195	50 %	0 %	50 %	0 %	212550299
34	NC_011562	AT	3	6	15548	15553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011562	AT	3	6	15560	15565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011562	TA	3	6	15689	15694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011562	TG	3	6	15887	15892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011562	AT	3	6	16999	17004	50 %	50 %	0 %	0 %	212550301
39	NC_011562	TA	3	6	17937	17942	50 %	50 %	0 %	0 %	212550302
40	NC_011562	TA	3	6	18553	18558	50 %	50 %	0 %	0 %	212550302
41	NC_011562	TC	3	6	19851	19856	0 %	50 %	0 %	50 %	212550303
42	NC_011562	CT	3	6	20225	20230	0 %	50 %	0 %	50 %	212550303
43	NC_011562	TA	3	6	20419	20424	50 %	50 %	0 %	0 %	212550304
44	NC_011562	TC	3	6	20554	20559	0 %	50 %	0 %	50 %	212550304
45	NC_011562	TC	3	6	21161	21166	0 %	50 %	0 %	50 %	212550304
46	NC_011562	TA	3	6	21865	21870	50 %	50 %	0 %	0 %	212550305
47	NC_011562	TC	3	6	22192	22197	0 %	50 %	0 %	50 %	212550305
48	NC_011562	TA	3	6	22681	22686	50 %	50 %	0 %	0 %	212550306
49	NC_011562	TG	3	6	23383	23388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011562	TA	3	6	24106	24111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011562	TG	3	6	24342	24347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011562	GA	3	6	24705	24710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011562	AT	3	6	25641	25646	50 %	50 %	0 %	0 %	212550308
54	NC_011562	GA	4	8	27101	27108	50 %	0 %	50 %	0 %	212550309
55	NC_011562	TC	3	6	28280	28285	0 %	50 %	0 %	50 %	212550311
56	NC_011562	AT	3	6	28833	28838	50 %	50 %	0 %	0 %	212550311
57	NC_011562	TA	3	6	28845	28850	50 %	50 %	0 %	0 %	212550311
58	NC_011562	AT	3	6	28938	28943	50 %	50 %	0 %	0 %	212550311
59	NC_011562	CA	3	6	29683	29688	50 %	0 %	0 %	50 %	212550313
60	NC_011562	TC	3	6	29814	29819	0 %	50 %	0 %	50 %	212550313
61	NC_011562	TA	3	6	29841	29846	50 %	50 %	0 %	0 %	212550313
62	NC_011562	GA	3	6	30024	30029	50 %	0 %	50 %	0 %	212550313
63	NC_011562	TA	3	6	30285	30290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011562	AG	3	6	30631	30636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.