MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	TA	3	6	123	128	50 %	50 %	0 %	0 %	212550289
2	NC_011562	TA	3	6	1531	1536	50 %	50 %	0 %	0 %	212550289
3	NC_011562	TG	3	6	3061	3066	0 %	50 %	50 %	0 %	212550291
4	NC_011562	AT	3	6	3333	3338	50 %	50 %	0 %	0 %	212550292
5	NC_011562	TC	3	6	4530	4535	0 %	50 %	0 %	50 %	212550292
6	NC_011562	CT	3	6	5418	5423	0 %	50 %	0 %	50 %	212550293
7	NC_011562	TA	3	6	5807	5812	50 %	50 %	0 %	0 %	212550293
8	NC_011562	AT	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	212550293
9	NC_011562	CT	3	6	6159	6164	0 %	50 %	0 %	50 %	212550293
10	NC_011562	AC	3	6	8011	8016	50 %	0 %	0 %	50 %	212550296
11	NC_011562	AG	3	6	8059	8064	50 %	0 %	50 %	0 %	212550296
12	NC_011562	CT	3	6	8805	8810	0 %	50 %	0 %	50 %	212550296
13	NC_011562	AG	3	6	8816	8821	50 %	0 %	50 %	0 %	212550296
14	NC_011562	TA	3	6	8822	8827	50 %	50 %	0 %	0 %	212550296
15	NC_011562	AT	3	6	8975	8980	50 %	50 %	0 %	0 %	212550296
16	NC_011562	AT	3	6	9704	9709	50 %	50 %	0 %	0 %	212550297
17	NC_011562	GA	3	6	9932	9937	50 %	0 %	50 %	0 %	212550297
18	NC_011562	TA	3	6	10476	10481	50 %	50 %	0 %	0 %	212550297
19	NC_011562	GT	3	6	13368	13373	0 %	50 %	50 %	0 %	212550298
20	NC_011562	AT	3	6	15052	15057	50 %	50 %	0 %	0 %	212550299
21	NC_011562	GA	4	8	15167	15174	50 %	0 %	50 %	0 %	212550299
22	NC_011562	GA	3	6	15190	15195	50 %	0 %	50 %	0 %	212550299
23	NC_011562	AT	3	6	16999	17004	50 %	50 %	0 %	0 %	212550301
24	NC_011562	TA	3	6	17937	17942	50 %	50 %	0 %	0 %	212550302
25	NC_011562	TA	3	6	18553	18558	50 %	50 %	0 %	0 %	212550302
26	NC_011562	TC	3	6	19851	19856	0 %	50 %	0 %	50 %	212550303
27	NC_011562	CT	3	6	20225	20230	0 %	50 %	0 %	50 %	212550303
28	NC_011562	TA	3	6	20419	20424	50 %	50 %	0 %	0 %	212550304
29	NC_011562	TC	3	6	20554	20559	0 %	50 %	0 %	50 %	212550304
30	NC_011562	TC	3	6	21161	21166	0 %	50 %	0 %	50 %	212550304
31	NC_011562	TA	3	6	21865	21870	50 %	50 %	0 %	0 %	212550305
32	NC_011562	TC	3	6	22192	22197	0 %	50 %	0 %	50 %	212550305
33	NC_011562	TA	3	6	22681	22686	50 %	50 %	0 %	0 %	212550306
34	NC_011562	AT	3	6	25641	25646	50 %	50 %	0 %	0 %	212550308
35	NC_011562	GA	4	8	27101	27108	50 %	0 %	50 %	0 %	212550309
36	NC_011562	TC	3	6	28280	28285	0 %	50 %	0 %	50 %	212550311
37	NC_011562	AT	3	6	28833	28838	50 %	50 %	0 %	0 %	212550311
38	NC_011562	TA	3	6	28845	28850	50 %	50 %	0 %	0 %	212550311
39	NC_011562	AT	3	6	28938	28943	50 %	50 %	0 %	0 %	212550311
40	NC_011562	CA	3	6	29683	29688	50 %	0 %	0 %	50 %	212550313
41	NC_011562	TC	3	6	29814	29819	0 %	50 %	0 %	50 %	212550313
42	NC_011562	TA	3	6	29841	29846	50 %	50 %	0 %	0 %	212550313
43	NC_011562	GA	3	6	30024	30029	50 %	0 %	50 %	0 %	212550313

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.