MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG3

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011562	T	6	6	255	260	0 %	100 %	0 %	0 %	212550289
2	NC_011562	A	6	6	298	303	100 %	0 %	0 %	0 %	212550289
3	NC_011562	T	6	6	306	311	0 %	100 %	0 %	0 %	212550289
4	NC_011562	A	6	6	391	396	100 %	0 %	0 %	0 %	212550289
5	NC_011562	A	6	6	545	550	100 %	0 %	0 %	0 %	212550289
6	NC_011562	A	6	6	1286	1291	100 %	0 %	0 %	0 %	212550289
7	NC_011562	A	6	6	2553	2558	100 %	0 %	0 %	0 %	212550290
8	NC_011562	T	6	6	2750	2755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011562	T	7	7	2911	2917	0 %	100 %	0 %	0 %	212550291
10	NC_011562	T	7	7	3370	3376	0 %	100 %	0 %	0 %	212550292
11	NC_011562	T	6	6	3816	3821	0 %	100 %	0 %	0 %	212550292
12	NC_011562	T	6	6	3906	3911	0 %	100 %	0 %	0 %	212550292
13	NC_011562	T	6	6	4511	4516	0 %	100 %	0 %	0 %	212550292
14	NC_011562	T	7	7	4567	4573	0 %	100 %	0 %	0 %	212550292
15	NC_011562	T	6	6	4819	4824	0 %	100 %	0 %	0 %	212550292
16	NC_011562	A	6	6	4930	4935	100 %	0 %	0 %	0 %	212550292
17	NC_011562	T	8	8	5696	5703	0 %	100 %	0 %	0 %	212550293
18	NC_011562	A	6	6	6386	6391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011562	T	6	6	6646	6651	0 %	100 %	0 %	0 %	212550294
20	NC_011562	T	6	6	6705	6710	0 %	100 %	0 %	0 %	212550294
21	NC_011562	A	6	6	6790	6795	100 %	0 %	0 %	0 %	212550295
22	NC_011562	A	6	6	7555	7560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011562	T	6	6	8344	8349	0 %	100 %	0 %	0 %	212550296
24	NC_011562	T	7	7	8390	8396	0 %	100 %	0 %	0 %	212550296
25	NC_011562	T	9	9	8472	8480	0 %	100 %	0 %	0 %	212550296
26	NC_011562	T	6	6	8531	8536	0 %	100 %	0 %	0 %	212550296
27	NC_011562	T	6	6	8761	8766	0 %	100 %	0 %	0 %	212550296
28	NC_011562	T	8	8	9178	9185	0 %	100 %	0 %	0 %	212550296
29	NC_011562	T	6	6	9213	9218	0 %	100 %	0 %	0 %	212550296
30	NC_011562	T	6	6	9273	9278	0 %	100 %	0 %	0 %	212550297
31	NC_011562	T	6	6	9573	9578	0 %	100 %	0 %	0 %	212550297
32	NC_011562	T	7	7	10246	10252	0 %	100 %	0 %	0 %	212550297
33	NC_011562	T	6	6	10601	10606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011562	C	6	6	10969	10974	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_011562	T	6	6	11187	11192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011562	T	6	6	11632	11637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011562	G	6	6	11691	11696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011562	A	7	7	11920	11926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011562	T	7	7	12437	12443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011562	T	6	6	12822	12827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011562	A	7	7	12849	12855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011562	T	9	9	13856	13864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011562	T	7	7	14366	14372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011562	A	6	6	14675	14680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011562	A	6	6	15519	15524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011562	T	8	8	16892	16899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011562	A	7	7	16948	16954	100 %	0 %	0 %	0 %	212550301
48	NC_011562	T	6	6	17584	17589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011562	T	6	6	18062	18067	0 %	100 %	0 %	0 %	212550302
50	NC_011562	A	6	6	18475	18480	100 %	0 %	0 %	0 %	212550302
51	NC_011562	T	6	6	18748	18753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011562	T	6	6	19022	19027	0 %	100 %	0 %	0 %	212550303
53	NC_011562	T	6	6	19745	19750	0 %	100 %	0 %	0 %	212550303
54	NC_011562	T	6	6	20171	20176	0 %	100 %	0 %	0 %	212550303
55	NC_011562	T	8	8	20365	20372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011562	T	6	6	20426	20431	0 %	100 %	0 %	0 %	212550304
57	NC_011562	T	6	6	20508	20513	0 %	100 %	0 %	0 %	212550304
58	NC_011562	T	7	7	21173	21179	0 %	100 %	0 %	0 %	212550304
59	NC_011562	T	6	6	21467	21472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011562	T	7	7	22184	22190	0 %	100 %	0 %	0 %	212550305
61	NC_011562	T	7	7	23610	23616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011562	T	6	6	24040	24045	0 %	100 %	0 %	0 %	212550307
63	NC_011562	T	6	6	24406	24411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011562	T	6	6	24503	24508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011562	A	6	6	24650	24655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011562	T	6	6	24799	24804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011562	T	6	6	25654	25659	0 %	100 %	0 %	0 %	212550308
68	NC_011562	T	6	6	26045	26050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011562	T	10	10	26159	26168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011562	T	7	7	26199	26205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011562	A	6	6	26463	26468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011562	T	8	8	26542	26549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011562	T	6	6	26574	26579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011562	A	6	6	26614	26619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011562	T	7	7	26645	26651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011562	A	6	6	27200	27205	100 %	0 %	0 %	0 %	212550309
77	NC_011562	A	6	6	27560	27565	100 %	0 %	0 %	0 %	212550310
78	NC_011562	T	7	7	27722	27728	0 %	100 %	0 %	0 %	212550310
79	NC_011562	T	8	8	27785	27792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011562	A	6	6	27930	27935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011562	T	9	9	27981	27989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011562	A	6	6	28004	28009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011562	T	7	7	28236	28242	0 %	100 %	0 %	0 %	212550311
84	NC_011562	G	7	7	28422	28428	0 %	0 %	100 %	0 %	212550311
85	NC_011562	T	6	6	28501	28506	0 %	100 %	0 %	0 %	212550311
86	NC_011562	A	6	6	28518	28523	100 %	0 %	0 %	0 %	212550311
87	NC_011562	T	7	7	28819	28825	0 %	100 %	0 %	0 %	212550311
88	NC_011562	T	6	6	28918	28923	0 %	100 %	0 %	0 %	212550311
89	NC_011562	T	6	6	28977	28982	0 %	100 %	0 %	0 %	212550311
90	NC_011562	T	6	6	29043	29048	0 %	100 %	0 %	0 %	212550311
91	NC_011562	T	9	9	29590	29598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011562	T	6	6	29689	29694	0 %	100 %	0 %	0 %	212550313
93	NC_011562	T	7	7	29721	29727	0 %	100 %	0 %	0 %	212550313
94	NC_011562	T	7	7	30007	30013	0 %	100 %	0 %	0 %	212550313
95	NC_011562	T	6	6	30354	30359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011562	T	7	7	30597	30603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011562	A	7	7	31164	31170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011562	T	6	6	31406	31411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011562	A	7	7	31689	31695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.