MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	GGAGCT	2	12	1702	1713	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212550261
2	NC_011561	TTATCG	2	12	3373	3384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212550263
3	NC_011561	CTTTCG	2	12	5267	5278	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212550265
4	NC_011561	TAATTC	2	12	5880	5891	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212550266
5	NC_011561	ATTGAA	2	12	6549	6560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212550266
6	NC_011561	CTTCCA	2	12	8889	8900	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	212550268
7	NC_011561	TCGGCT	2	12	10127	10138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550268
8	NC_011561	TACATC	2	12	12447	12458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011561	CATCTA	2	12	12461	12472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011561	GGTTCT	2	12	15298	15309	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212550272
11	NC_011561	TAGTTG	2	12	20907	20918	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212550276
12	NC_011561	ATTTTA	2	12	21221	21232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550276
13	NC_011561	GTATTC	2	12	21517	21528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011561	GAAACT	2	12	24435	24446	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011561	TTTTTC	2	12	25559	25570	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011561	AAAGAA	2	12	25671	25682	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011561	AGTAAA	2	12	26520	26531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011561	AGGCTT	2	12	29599	29610	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011561	TTCATA	2	12	31364	31375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212550284
20	NC_011561	GATAAA	2	12	31704	31715	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011561	CGTTAT	2	12	31718	31729	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011561	TCCTAA	2	12	33618	33629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011561	TACAGT	2	12	34244	34255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011561	TCTCTT	2	12	34477	34488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011561	TAAATC	2	12	35239	35250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011561	GTTAAA	2	12	36909	36920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.