MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	ATCAA	2	10	290	299	60 %	20 %	0 %	20 %	212550260
2	NC_011561	TTATT	2	10	1676	1685	20 %	80 %	0 %	0 %	212550261
3	NC_011561	CTCTC	2	10	4737	4746	0 %	40 %	0 %	60 %	212550265
4	NC_011561	GACAA	2	10	6036	6045	60 %	0 %	20 %	20 %	212550266
5	NC_011561	CCATT	2	10	6787	6796	20 %	40 %	0 %	40 %	212550266
6	NC_011561	AATCA	2	10	7348	7357	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011561	TAAAA	2	10	7564	7573	80 %	20 %	0 %	0 %	212550267
8	NC_011561	CAAGA	2	10	7974	7983	60 %	0 %	20 %	20 %	212550267
9	NC_011561	ACAAA	2	10	11969	11978	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011561	ATTTA	3	15	12317	12331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011561	TTATT	2	10	12333	12342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011561	TGAAA	2	10	12495	12504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011561	ATGGG	2	10	12756	12765	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011561	GAAAA	2	10	14139	14148	80 %	0 %	20 %	0 %	212550270
15	NC_011561	GAAAG	2	10	15953	15962	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011561	AAGCA	2	10	15966	15975	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011561	CATTC	2	10	16579	16588	20 %	40 %	0 %	40 %	212550273
18	NC_011561	CAGTC	2	10	16609	16618	20 %	20 %	20 %	40 %	212550273
19	NC_011561	GTATA	2	10	17177	17186	40 %	40 %	20 %	0 %	212550273
20	NC_011561	CAGTC	2	10	17545	17554	20 %	20 %	20 %	40 %	212550273
21	NC_011561	CTTTT	2	10	18022	18031	0 %	80 %	0 %	20 %	212550273
22	NC_011561	TATTC	2	10	18222	18231	20 %	60 %	0 %	20 %	212550273
23	NC_011561	GAAAG	2	10	18756	18765	60 %	0 %	40 %	0 %	212550274
24	NC_011561	TCTGA	2	10	19314	19323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011561	CCAGA	2	10	19979	19988	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011561	TTATT	2	10	22066	22075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011561	TACGT	2	10	22760	22769	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011561	TAGGC	2	10	23786	23795	20 %	20 %	40 %	20 %	212550277
29	NC_011561	TAAAT	2	10	23877	23886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011561	ATTAA	2	10	33010	33019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011561	TAAAA	2	10	34064	34073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011561	TTCTT	2	10	35067	35076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011561	TTTTC	2	10	35403	35412	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011561	TTCTT	2	10	35741	35750	0 %	80 %	0 %	20 %	212550287
35	NC_011561	GAAAC	2	10	36330	36339	60 %	0 %	20 %	20 %	212550287
36	NC_011561	TCTTT	2	10	36711	36720	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.