MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	ATCAA	2	10	290	299	60 %	20 %	0 %	20 %	212550260
2	NC_011561	TTATT	2	10	1676	1685	20 %	80 %	0 %	0 %	212550261
3	NC_011561	CTCTC	2	10	4737	4746	0 %	40 %	0 %	60 %	212550265
4	NC_011561	GACAA	2	10	6036	6045	60 %	0 %	20 %	20 %	212550266
5	NC_011561	CCATT	2	10	6787	6796	20 %	40 %	0 %	40 %	212550266
6	NC_011561	TAAAA	2	10	7564	7573	80 %	20 %	0 %	0 %	212550267
7	NC_011561	CAAGA	2	10	7974	7983	60 %	0 %	20 %	20 %	212550267
8	NC_011561	GAAAA	2	10	14139	14148	80 %	0 %	20 %	0 %	212550270
9	NC_011561	CATTC	2	10	16579	16588	20 %	40 %	0 %	40 %	212550273
10	NC_011561	CAGTC	2	10	16609	16618	20 %	20 %	20 %	40 %	212550273
11	NC_011561	GTATA	2	10	17177	17186	40 %	40 %	20 %	0 %	212550273
12	NC_011561	CAGTC	2	10	17545	17554	20 %	20 %	20 %	40 %	212550273
13	NC_011561	CTTTT	2	10	18022	18031	0 %	80 %	0 %	20 %	212550273
14	NC_011561	TATTC	2	10	18222	18231	20 %	60 %	0 %	20 %	212550273
15	NC_011561	GAAAG	2	10	18756	18765	60 %	0 %	40 %	0 %	212550274
16	NC_011561	TAGGC	2	10	23786	23795	20 %	20 %	40 %	20 %	212550277
17	NC_011561	TTCTT	2	10	35741	35750	0 %	80 %	0 %	20 %	212550287
18	NC_011561	GAAAC	2	10	36330	36339	60 %	0 %	20 %	20 %	212550287

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.