MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	AGTA	2	8	904	911	50 %	25 %	25 %	0 %	212550260
2	NC_011561	ATTC	2	8	1246	1253	25 %	50 %	0 %	25 %	212550260
3	NC_011561	GAAA	2	8	1328	1335	75 %	0 %	25 %	0 %	212550260
4	NC_011561	TGAA	2	8	1430	1437	50 %	25 %	25 %	0 %	212550260
5	NC_011561	TGAA	2	8	1445	1452	50 %	25 %	25 %	0 %	212550260
6	NC_011561	GATG	2	8	1859	1866	25 %	25 %	50 %	0 %	212550261
7	NC_011561	AATT	2	8	2055	2062	50 %	50 %	0 %	0 %	212550261
8	NC_011561	TAAG	2	8	2709	2716	50 %	25 %	25 %	0 %	212550262
9	NC_011561	GGAA	2	8	3261	3268	50 %	0 %	50 %	0 %	212550263
10	NC_011561	GACA	2	8	3365	3372	50 %	0 %	25 %	25 %	212550263
11	NC_011561	GATG	2	8	3439	3446	25 %	25 %	50 %	0 %	212550263
12	NC_011561	AGAT	2	8	3816	3823	50 %	25 %	25 %	0 %	212550263
13	NC_011561	GAAT	2	8	3971	3978	50 %	25 %	25 %	0 %	212550263
14	NC_011561	AGGA	2	8	4373	4380	50 %	0 %	50 %	0 %	212550264
15	NC_011561	CTAC	2	8	4683	4690	25 %	25 %	0 %	50 %	212550265
16	NC_011561	GATT	2	8	4729	4736	25 %	50 %	25 %	0 %	212550265
17	NC_011561	ATGG	2	8	4758	4765	25 %	25 %	50 %	0 %	212550265
18	NC_011561	ATCT	2	8	4779	4786	25 %	50 %	0 %	25 %	212550265
19	NC_011561	TTTC	2	8	5027	5034	0 %	75 %	0 %	25 %	212550265
20	NC_011561	ATTA	2	8	5130	5137	50 %	50 %	0 %	0 %	212550265
21	NC_011561	TAGT	2	8	5164	5171	25 %	50 %	25 %	0 %	212550265
22	NC_011561	TTAA	2	8	5655	5662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011561	GATT	2	8	5765	5772	25 %	50 %	25 %	0 %	212550266
24	NC_011561	TCTA	2	8	6282	6289	25 %	50 %	0 %	25 %	212550266
25	NC_011561	TAAA	2	8	6468	6475	75 %	25 %	0 %	0 %	212550266
26	NC_011561	TTTC	2	8	7145	7152	0 %	75 %	0 %	25 %	212550266
27	NC_011561	CTTT	2	8	7157	7164	0 %	75 %	0 %	25 %	212550266
28	NC_011561	TATT	2	8	7193	7200	25 %	75 %	0 %	0 %	212550266
29	NC_011561	AATA	2	8	7392	7399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011561	ATTT	2	8	8253	8260	25 %	75 %	0 %	0 %	212550268
31	NC_011561	AAGT	2	8	8437	8444	50 %	25 %	25 %	0 %	212550268
32	NC_011561	TCTT	2	8	8750	8757	0 %	75 %	0 %	25 %	212550268
33	NC_011561	TTTC	2	8	8985	8992	0 %	75 %	0 %	25 %	212550268
34	NC_011561	CTTT	2	8	9026	9033	0 %	75 %	0 %	25 %	212550268
35	NC_011561	CTCC	2	8	9253	9260	0 %	25 %	0 %	75 %	212550268
36	NC_011561	TTGC	2	8	9674	9681	0 %	50 %	25 %	25 %	212550268
37	NC_011561	TGTA	2	8	9774	9781	25 %	50 %	25 %	0 %	212550268
38	NC_011561	CAAC	2	8	10119	10126	50 %	0 %	0 %	50 %	212550268
39	NC_011561	AGGA	2	8	10967	10974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011561	TCTG	2	8	11981	11988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011561	GTCT	2	8	12715	12722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011561	ATAA	2	8	13701	13708	75 %	25 %	0 %	0 %	212550270
43	NC_011561	ATCC	2	8	13777	13784	25 %	25 %	0 %	50 %	212550270
44	NC_011561	CAAC	2	8	14466	14473	50 %	0 %	0 %	50 %	212550271
45	NC_011561	AAAG	2	8	14565	14572	75 %	0 %	25 %	0 %	212550271
46	NC_011561	TCGT	2	8	14668	14675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011561	ATTC	2	8	15055	15062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011561	TATC	2	8	15611	15618	25 %	50 %	0 %	25 %	212550272
49	NC_011561	TAGT	2	8	15990	15997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011561	CATC	2	8	16446	16453	25 %	25 %	0 %	50 %	212550273
51	NC_011561	TACT	2	8	16645	16652	25 %	50 %	0 %	25 %	212550273
52	NC_011561	TCCA	2	8	16861	16868	25 %	25 %	0 %	50 %	212550273
53	NC_011561	TATC	2	8	16939	16946	25 %	50 %	0 %	25 %	212550273
54	NC_011561	CAGT	2	8	17277	17284	25 %	25 %	25 %	25 %	212550273
55	NC_011561	TATT	2	8	18082	18089	25 %	75 %	0 %	0 %	212550273
56	NC_011561	ATGG	2	8	18707	18714	25 %	25 %	50 %	0 %	212550274
57	NC_011561	ATAG	2	8	18838	18845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011561	TTTC	2	8	18916	18923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011561	TTAT	2	8	19087	19094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011561	AATG	2	8	19144	19151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011561	GACA	2	8	19192	19199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011561	ATTC	2	8	19211	19218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011561	CGAA	2	8	20011	20018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011561	GCAT	2	8	20302	20309	25 %	25 %	25 %	25 %	212550275
65	NC_011561	GGAT	2	8	20492	20499	25 %	25 %	50 %	0 %	212550275
66	NC_011561	ATTG	2	8	21108	21115	25 %	50 %	25 %	0 %	212550276
67	NC_011561	ATAG	2	8	21539	21546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011561	TCTG	2	8	22798	22805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011561	ATAA	2	8	23052	23059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011561	CTTC	2	8	23426	23433	0 %	50 %	0 %	50 %	212550277
71	NC_011561	ATTT	2	8	23569	23576	25 %	75 %	0 %	0 %	212550277
72	NC_011561	TAAG	2	8	24049	24056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011561	AAAG	2	8	24866	24873	75 %	0 %	25 %	0 %	212550278
74	NC_011561	CTAT	2	8	25071	25078	25 %	50 %	0 %	25 %	212550278
75	NC_011561	GGAT	2	8	25104	25111	25 %	25 %	50 %	0 %	212550278
76	NC_011561	TAAG	2	8	25365	25372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011561	ATTT	2	8	25583	25590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011561	TGTT	2	8	25640	25647	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011561	CAAT	2	8	26469	26476	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011561	GTAT	2	8	27013	27020	25 %	50 %	25 %	0 %	212550280
81	NC_011561	AAAG	2	8	27261	27268	75 %	0 %	25 %	0 %	212550281
82	NC_011561	TCCT	2	8	27411	27418	0 %	50 %	0 %	50 %	212550281
83	NC_011561	AATG	2	8	27425	27432	50 %	25 %	25 %	0 %	212550281
84	NC_011561	AAAG	2	8	27495	27502	75 %	0 %	25 %	0 %	212550281
85	NC_011561	GTCA	2	8	27870	27877	25 %	25 %	25 %	25 %	212550282
86	NC_011561	AGAT	2	8	28369	28376	50 %	25 %	25 %	0 %	212550282
87	NC_011561	TCGT	2	8	28794	28801	0 %	50 %	25 %	25 %	212550282
88	NC_011561	AATA	2	8	28923	28930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011561	TAAA	2	8	29126	29133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011561	CCGC	2	8	29255	29262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_011561	AGCA	2	8	29518	29525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011561	AATG	2	8	29631	29638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011561	AGAT	2	8	30066	30073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011561	AGTA	2	8	30324	30331	50 %	25 %	25 %	0 %	212550283
95	NC_011561	CAAA	2	8	30597	30604	75 %	0 %	0 %	25 %	212550283
96	NC_011561	TTTG	2	8	30745	30752	0 %	75 %	25 %	0 %	212550283
97	NC_011561	CAGA	2	8	30819	30826	50 %	0 %	25 %	25 %	212550283
98	NC_011561	GTTA	2	8	30923	30930	25 %	50 %	25 %	0 %	212550283
99	NC_011561	TATC	2	8	31011	31018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011561	CTGT	2	8	31257	31264	0 %	50 %	25 %	25 %	212550284
101	NC_011561	AGGA	2	8	31267	31274	50 %	0 %	50 %	0 %	212550284
102	NC_011561	CTTT	2	8	32294	32301	0 %	75 %	0 %	25 %	212550285
103	NC_011561	ATTG	2	8	32512	32519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011561	ATTC	3	12	32546	32557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011561	ATTT	2	8	32621	32628	25 %	75 %	0 %	0 %	212550286
106	NC_011561	TGGA	2	8	32768	32775	25 %	25 %	50 %	0 %	212550286
107	NC_011561	TTTC	2	8	32881	32888	0 %	75 %	0 %	25 %	212550286
108	NC_011561	TAAC	2	8	33049	33056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011561	AACA	2	8	34035	34042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011561	TTTA	2	8	34172	34179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011561	TCTA	2	8	34371	34378	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011561	AATC	2	8	34661	34668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011561	GCAT	2	8	34773	34780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011561	TTAC	2	8	34898	34905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011561	TCTA	2	8	34912	34919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011561	TATT	2	8	35003	35010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011561	GGAT	2	8	35101	35108	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011561	CCTT	2	8	35582	35589	0 %	50 %	0 %	50 %	212550287
119	NC_011561	ATTC	2	8	35624	35631	25 %	50 %	0 %	25 %	212550287
120	NC_011561	TACC	2	8	36209	36216	25 %	25 %	0 %	50 %	212550287
121	NC_011561	TGAA	2	8	36508	36515	50 %	25 %	25 %	0 %	212550287
122	NC_011561	ACTT	2	8	36927	36934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011561	ACTT	2	8	36959	36966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011561	ACTT	2	8	36991	36998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011561	ACTT	2	8	37023	37030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011561	ACTT	2	8	37055	37062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.