MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	TTAA	2	8	5655	5662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011561	AATA	2	8	7392	7399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011561	AGGA	2	8	10967	10974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011561	TCTG	2	8	11981	11988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011561	GTCT	2	8	12715	12722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011561	TCGT	2	8	14668	14675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011561	ATTC	2	8	15055	15062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011561	TAGT	2	8	15990	15997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011561	ATAG	2	8	18838	18845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011561	TTTC	2	8	18916	18923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011561	TTAT	2	8	19087	19094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011561	AATG	2	8	19144	19151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011561	GACA	2	8	19192	19199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011561	ATTC	2	8	19211	19218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011561	CGAA	2	8	20011	20018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011561	ATAG	2	8	21539	21546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011561	TCTG	2	8	22798	22805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011561	ATAA	2	8	23052	23059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011561	TAAG	2	8	24049	24056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011561	TAAG	2	8	25365	25372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011561	ATTT	2	8	25583	25590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011561	TGTT	2	8	25640	25647	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011561	CAAT	2	8	26469	26476	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011561	AATA	2	8	28923	28930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011561	TAAA	2	8	29126	29133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011561	CCGC	2	8	29255	29262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_011561	AGCA	2	8	29518	29525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011561	AATG	2	8	29631	29638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011561	AGAT	2	8	30066	30073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011561	TATC	2	8	31011	31018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011561	ATTG	2	8	32512	32519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011561	ATTC	3	12	32546	32557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011561	TAAC	2	8	33049	33056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011561	AACA	2	8	34035	34042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011561	TTTA	2	8	34172	34179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011561	TCTA	2	8	34371	34378	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011561	AATC	2	8	34661	34668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011561	GCAT	2	8	34773	34780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011561	TTAC	2	8	34898	34905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011561	TCTA	2	8	34912	34919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011561	TATT	2	8	35003	35010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011561	GGAT	2	8	35101	35108	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011561	ACTT	2	8	36927	36934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011561	ACTT	2	8	36959	36966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011561	ACTT	2	8	36991	36998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011561	ACTT	2	8	37023	37030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011561	ACTT	2	8	37055	37062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.