MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	CT	3	6	305	310	0 %	50 %	0 %	50 %	212550260
2	NC_011561	AG	3	6	655	660	50 %	0 %	50 %	0 %	212550260
3	NC_011561	TA	3	6	1537	1542	50 %	50 %	0 %	0 %	212550260
4	NC_011561	GA	3	6	1814	1819	50 %	0 %	50 %	0 %	212550261
5	NC_011561	AG	4	8	2429	2436	50 %	0 %	50 %	0 %	212550262
6	NC_011561	AT	3	6	2628	2633	50 %	50 %	0 %	0 %	212550262
7	NC_011561	TG	3	6	4358	4363	0 %	50 %	50 %	0 %	212550264
8	NC_011561	TC	3	6	4716	4721	0 %	50 %	0 %	50 %	212550265
9	NC_011561	TA	3	6	4851	4856	50 %	50 %	0 %	0 %	212550265
10	NC_011561	CT	3	6	4965	4970	0 %	50 %	0 %	50 %	212550265
11	NC_011561	TA	3	6	5238	5243	50 %	50 %	0 %	0 %	212550265
12	NC_011561	CT	3	6	5938	5943	0 %	50 %	0 %	50 %	212550266
13	NC_011561	AT	3	6	6068	6073	50 %	50 %	0 %	0 %	212550266
14	NC_011561	AT	3	6	6158	6163	50 %	50 %	0 %	0 %	212550266
15	NC_011561	AT	3	6	7226	7231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011561	AT	3	6	7235	7240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011561	AT	4	8	7481	7488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011561	AT	3	6	7853	7858	50 %	50 %	0 %	0 %	212550267
19	NC_011561	AT	3	6	7939	7944	50 %	50 %	0 %	0 %	212550267
20	NC_011561	CA	3	6	8012	8017	50 %	0 %	0 %	50 %	212550267
21	NC_011561	TC	3	6	8182	8187	0 %	50 %	0 %	50 %	212550268
22	NC_011561	AT	3	6	8616	8621	50 %	50 %	0 %	0 %	212550268
23	NC_011561	AT	3	6	9346	9351	50 %	50 %	0 %	0 %	212550268
24	NC_011561	CT	3	6	9521	9526	0 %	50 %	0 %	50 %	212550268
25	NC_011561	AT	4	8	9743	9750	50 %	50 %	0 %	0 %	212550268
26	NC_011561	CT	3	6	10043	10048	0 %	50 %	0 %	50 %	212550268
27	NC_011561	GT	3	6	10710	10715	0 %	50 %	50 %	0 %	212550268
28	NC_011561	TA	3	6	11302	11307	50 %	50 %	0 %	0 %	212550269
29	NC_011561	TC	3	6	11453	11458	0 %	50 %	0 %	50 %	212550269
30	NC_011561	TG	4	8	11463	11470	0 %	50 %	50 %	0 %	212550269
31	NC_011561	CA	3	6	11787	11792	50 %	0 %	0 %	50 %	212550269
32	NC_011561	TA	3	6	12139	12144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011561	TA	3	6	12917	12922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011561	AG	7	14	13373	13386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011561	TA	3	6	13448	13453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011561	CA	3	6	13561	13566	50 %	0 %	0 %	50 %	212550270
37	NC_011561	GA	3	6	13595	13600	50 %	0 %	50 %	0 %	212550270
38	NC_011561	AG	3	6	13686	13691	50 %	0 %	50 %	0 %	212550270
39	NC_011561	AG	3	6	14988	14993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011561	GT	3	6	15072	15077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011561	TG	3	6	15194	15199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011561	CT	3	6	15242	15247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011561	AT	3	6	15392	15397	50 %	50 %	0 %	0 %	212550272
44	NC_011561	AG	3	6	16430	16435	50 %	0 %	50 %	0 %	212550273
45	NC_011561	CT	3	6	17881	17886	0 %	50 %	0 %	50 %	212550273
46	NC_011561	TG	3	6	18234	18239	0 %	50 %	50 %	0 %	212550273
47	NC_011561	AT	3	6	18417	18422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011561	AT	3	6	18589	18594	50 %	50 %	0 %	0 %	212550274
49	NC_011561	GT	3	6	18735	18740	0 %	50 %	50 %	0 %	212550274
50	NC_011561	TA	3	6	19282	19287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011561	TC	3	6	19608	19613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011561	AT	3	6	20717	20722	50 %	50 %	0 %	0 %	212550276
53	NC_011561	CA	3	6	21296	21301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011561	AT	3	6	21359	21364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011561	TC	3	6	21442	21447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011561	TG	3	6	21484	21489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011561	TA	3	6	21718	21723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011561	CA	3	6	22347	22352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011561	AG	3	6	23247	23252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011561	AC	3	6	24207	24212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011561	TC	3	6	24321	24326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011561	AT	4	8	24489	24496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011561	AT	3	6	24616	24621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011561	CT	3	6	25019	25024	0 %	50 %	0 %	50 %	212550278
65	NC_011561	TC	3	6	25314	25319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011561	AT	4	8	25629	25636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011561	TC	3	6	26203	26208	0 %	50 %	0 %	50 %	212550279
68	NC_011561	AT	4	8	26545	26552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011561	AT	4	8	26558	26565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011561	TC	3	6	26823	26828	0 %	50 %	0 %	50 %	212550280
71	NC_011561	AT	3	6	26906	26911	50 %	50 %	0 %	0 %	212550280
72	NC_011561	GA	3	6	27148	27153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011561	AG	3	6	27575	27580	50 %	0 %	50 %	0 %	212550281
74	NC_011561	CT	3	6	27774	27779	0 %	50 %	0 %	50 %	212550282
75	NC_011561	GA	3	6	27800	27805	50 %	0 %	50 %	0 %	212550282
76	NC_011561	TC	3	6	27935	27940	0 %	50 %	0 %	50 %	212550282
77	NC_011561	GA	3	6	28654	28659	50 %	0 %	50 %	0 %	212550282
78	NC_011561	GA	3	6	29096	29101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011561	AT	4	8	29388	29395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011561	GA	3	6	30676	30681	50 %	0 %	50 %	0 %	212550283
81	NC_011561	AG	3	6	30729	30734	50 %	0 %	50 %	0 %	212550283
82	NC_011561	TC	3	6	31778	31783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011561	TC	3	6	31973	31978	0 %	50 %	0 %	50 %	212550285
84	NC_011561	AT	3	6	32288	32293	50 %	50 %	0 %	0 %	212550285
85	NC_011561	TC	3	6	32719	32724	0 %	50 %	0 %	50 %	212550286
86	NC_011561	TA	3	6	32746	32751	50 %	50 %	0 %	0 %	212550286
87	NC_011561	AG	3	6	33585	33590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011561	TC	3	6	34724	34729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011561	TA	3	6	34767	34772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011561	AT	3	6	35294	35299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011561	GA	3	6	35674	35679	50 %	0 %	50 %	0 %	212550287
92	NC_011561	TA	3	6	35689	35694	50 %	50 %	0 %	0 %	212550287
93	NC_011561	AG	3	6	36350	36355	50 %	0 %	50 %	0 %	212550287

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.