MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	A	7	7	31	37	100 %	0 %	0 %	0 %	212550260
2	NC_011561	A	7	7	184	190	100 %	0 %	0 %	0 %	212550260
3	NC_011561	A	8	8	599	606	100 %	0 %	0 %	0 %	212550260
4	NC_011561	A	6	6	1292	1297	100 %	0 %	0 %	0 %	212550260
5	NC_011561	A	8	8	1484	1491	100 %	0 %	0 %	0 %	212550260
6	NC_011561	A	6	6	1660	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	212550261
7	NC_011561	A	6	6	1972	1977	100 %	0 %	0 %	0 %	212550261
8	NC_011561	A	6	6	1995	2000	100 %	0 %	0 %	0 %	212550261
9	NC_011561	T	6	6	2206	2211	0 %	100 %	0 %	0 %	212550262
10	NC_011561	A	6	6	3962	3967	100 %	0 %	0 %	0 %	212550263
11	NC_011561	T	6	6	4152	4157	0 %	100 %	0 %	0 %	212550264
12	NC_011561	T	6	6	4600	4605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011561	A	6	6	5691	5696	100 %	0 %	0 %	0 %	212550266
14	NC_011561	T	7	7	5715	5721	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
15	NC_011561	T	6	6	5782	5787	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
16	NC_011561	T	6	6	5850	5855	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
17	NC_011561	T	8	8	6073	6080	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
18	NC_011561	T	8	8	6101	6108	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
19	NC_011561	A	6	6	6319	6324	100 %	0 %	0 %	0 %	212550266
20	NC_011561	T	6	6	6332	6337	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
21	NC_011561	A	6	6	6658	6663	100 %	0 %	0 %	0 %	212550266
22	NC_011561	T	6	6	6973	6978	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
23	NC_011561	A	6	6	7340	7345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011561	T	7	7	8601	8607	0 %	100 %	0 %	0 %	212550268
25	NC_011561	T	6	6	8812	8817	0 %	100 %	0 %	0 %	212550268
26	NC_011561	T	6	6	8867	8872	0 %	100 %	0 %	0 %	212550268
27	NC_011561	T	7	7	9037	9043	0 %	100 %	0 %	0 %	212550268
28	NC_011561	T	6	6	9100	9105	0 %	100 %	0 %	0 %	212550268
29	NC_011561	T	6	6	10274	10279	0 %	100 %	0 %	0 %	212550268
30	NC_011561	T	6	6	10744	10749	0 %	100 %	0 %	0 %	212550268
31	NC_011561	T	6	6	11109	11114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011561	A	6	6	11222	11227	100 %	0 %	0 %	0 %	212550269
33	NC_011561	T	7	7	11875	11881	0 %	100 %	0 %	0 %	212550269
34	NC_011561	A	6	6	11882	11887	100 %	0 %	0 %	0 %	212550269
35	NC_011561	T	6	6	11904	11909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011561	A	7	7	12075	12081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011561	T	9	9	12181	12189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011561	A	6	6	12268	12273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011561	A	9	9	12874	12882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011561	T	9	9	12896	12904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011561	T	9	9	13001	13009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011561	T	9	9	13036	13044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011561	A	6	6	13423	13428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011561	A	6	6	13942	13947	100 %	0 %	0 %	0 %	212550270
45	NC_011561	T	6	6	14792	14797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011561	A	7	7	15366	15372	100 %	0 %	0 %	0 %	212550272
47	NC_011561	T	6	6	16112	16117	0 %	100 %	0 %	0 %	212550273
48	NC_011561	T	6	6	16340	16345	0 %	100 %	0 %	0 %	212550273
49	NC_011561	A	6	6	17233	17238	100 %	0 %	0 %	0 %	212550273
50	NC_011561	T	6	6	17906	17911	0 %	100 %	0 %	0 %	212550273
51	NC_011561	T	6	6	18200	18205	0 %	100 %	0 %	0 %	212550273
52	NC_011561	A	6	6	18336	18341	100 %	0 %	0 %	0 %	212550273
53	NC_011561	T	7	7	18887	18893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011561	T	6	6	18958	18963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011561	T	7	7	19599	19605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011561	T	7	7	19912	19918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011561	A	8	8	19963	19970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011561	T	6	6	20170	20175	0 %	100 %	0 %	0 %	212550275
59	NC_011561	T	8	8	20516	20523	0 %	100 %	0 %	0 %	212550275
60	NC_011561	T	8	8	21248	21255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011561	T	6	6	22052	22057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011561	A	7	7	22548	22554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011561	A	7	7	23039	23045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011561	T	7	7	24735	24741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011561	T	6	6	25190	25195	0 %	100 %	0 %	0 %	212550278
66	NC_011561	T	7	7	25588	25594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011561	A	7	7	25727	25733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011561	T	6	6	25805	25810	0 %	100 %	0 %	0 %	212550279
69	NC_011561	T	6	6	25813	25818	0 %	100 %	0 %	0 %	212550279
70	NC_011561	T	6	6	25856	25861	0 %	100 %	0 %	0 %	212550279
71	NC_011561	T	6	6	25864	25869	0 %	100 %	0 %	0 %	212550279
72	NC_011561	T	7	7	26092	26098	0 %	100 %	0 %	0 %	212550279
73	NC_011561	A	6	6	26404	26409	100 %	0 %	0 %	0 %	212550279
74	NC_011561	A	7	7	26529	26535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011561	T	6	6	26579	26584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011561	A	6	6	26718	26723	100 %	0 %	0 %	0 %	212550280
77	NC_011561	T	10	10	27138	27147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011561	T	9	9	27178	27186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011561	T	9	9	28834	28842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011561	A	8	8	29014	29021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011561	C	6	6	29168	29173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_011561	T	6	6	29348	29353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011561	T	6	6	29504	29509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011561	T	7	7	29511	29517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011561	A	7	7	30034	30040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011561	T	7	7	30073	30079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011561	T	8	8	30115	30122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011561	A	6	6	30186	30191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011561	T	7	7	30217	30223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011561	A	6	6	31135	31140	100 %	0 %	0 %	0 %	212550284
91	NC_011561	T	6	6	31179	31184	0 %	100 %	0 %	0 %	212550284
92	NC_011561	T	7	7	31291	31297	0 %	100 %	0 %	0 %	212550284
93	NC_011561	T	7	7	31354	31360	0 %	100 %	0 %	0 %	212550284
94	NC_011561	A	6	6	31498	31503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011561	T	9	9	31549	31557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011561	T	6	6	31820	31825	0 %	100 %	0 %	0 %	212550285
97	NC_011561	T	6	6	32266	32271	0 %	100 %	0 %	0 %	212550285
98	NC_011561	T	8	8	32417	32424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011561	T	8	8	32532	32539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011561	T	8	8	33550	33557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011561	T	6	6	33607	33612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011561	A	6	6	34118	34123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011561	T	8	8	34712	34719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011561	T	8	8	35192	35199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011561	A	6	6	35526	35531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011561	T	6	6	35588	35593	0 %	100 %	0 %	0 %	212550287
107	NC_011561	A	7	7	35819	35825	100 %	0 %	0 %	0 %	212550287
108	NC_011561	A	6	6	36231	36236	100 %	0 %	0 %	0 %	212550287
109	NC_011561	A	7	7	36866	36872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.