MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 1780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011528	TTTCT	2	10	53	62	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011528	TGGAT	2	10	291	300	20 %	40 %	40 %	0 %	212217689
3	NC_011528	CCCCT	2	10	1513	1522	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_011528	AAATT	2	10	1642	1651	60 %	40 %	0 %	0 %	212217690
5	NC_011528	GATTT	2	10	10241	10250	20 %	60 %	20 %	0 %	212217696
6	NC_011528	AATGA	2	10	10464	10473	60 %	20 %	20 %	0 %	212217696
7	NC_011528	ATCTC	2	10	12728	12737	20 %	40 %	0 %	40 %	212217698
8	NC_011528	ATGGA	2	10	13903	13912	40 %	20 %	40 %	0 %	212217700
9	NC_011528	CGCAG	2	10	15329	15338	20 %	0 %	40 %	40 %	212217701
10	NC_011528	TTTAT	2	10	15858	15867	20 %	80 %	0 %	0 %	212217702
11	NC_011528	GCAAT	2	10	16702	16711	40 %	20 %	20 %	20 %	212217703
12	NC_011528	GCTCA	2	10	17462	17471	20 %	20 %	20 %	40 %	212217704
13	NC_011528	TGCGC	2	10	17784	17793	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011528	ATGGA	2	10	18700	18709	40 %	20 %	40 %	0 %	212217706
15	NC_011528	CTCAA	2	10	19557	19566	40 %	20 %	0 %	40 %	212217707
16	NC_011528	TGCGT	2	10	20680	20689	0 %	40 %	40 %	20 %	212217707
17	NC_011528	TTAAT	2	10	23376	23385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011528	GCGAA	2	10	23424	23433	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011528	TTTTG	2	10	25328	25337	0 %	80 %	20 %	0 %	212217713
20	NC_011528	GCGCG	2	10	25939	25948	0 %	0 %	60 %	40 %	212217713
21	NC_011528	GCTTC	2	10	25984	25993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011528	AAAAT	2	10	27459	27468	80 %	20 %	0 %	0 %	212217715
23	NC_011528	TCGCT	2	10	28431	28440	0 %	40 %	20 %	40 %	212217716
24	NC_011528	AGCGA	2	10	28476	28485	40 %	0 %	40 %	20 %	212217716
25	NC_011528	AATTC	2	10	28495	28504	40 %	40 %	0 %	20 %	212217716
26	NC_011528	ATTTT	2	10	31663	31672	20 %	80 %	0 %	0 %	212217719
27	NC_011528	AATCG	2	10	32971	32980	40 %	20 %	20 %	20 %	212217721
28	NC_011528	ACTTT	2	10	33965	33974	20 %	60 %	0 %	20 %	212217721
29	NC_011528	TTCGT	2	10	34373	34382	0 %	60 %	20 %	20 %	212217721
30	NC_011528	CGAAA	2	10	34753	34762	60 %	0 %	20 %	20 %	212217721
31	NC_011528	GAAAA	2	10	35190	35199	80 %	0 %	20 %	0 %	212217721
32	NC_011528	CGCTT	2	10	35786	35795	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_011528	AAAAC	2	10	37692	37701	80 %	0 %	0 %	20 %	212217723
34	NC_011528	CCATC	2	10	39264	39273	20 %	20 %	0 %	60 %	212217727
35	NC_011528	GGATT	2	10	39693	39702	20 %	40 %	40 %	0 %	212217727
36	NC_011528	AAATA	2	10	39938	39947	80 %	20 %	0 %	0 %	212217727
37	NC_011528	ATTAA	2	10	40606	40615	60 %	40 %	0 %	0 %	212217727
38	NC_011528	TTGGG	2	10	41113	41122	0 %	40 %	60 %	0 %	212217727
39	NC_011528	CTATC	2	10	41514	41523	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011528	ATTGG	2	10	42924	42933	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011528	GCGCG	2	10	45357	45366	0 %	0 %	60 %	40 %	212217732
42	NC_011528	GCATT	2	10	46896	46905	20 %	40 %	20 %	20 %	212217735
43	NC_011528	TTAAA	2	10	47326	47335	60 %	40 %	0 %	0 %	212217735
44	NC_011528	ATGTT	2	10	47600	47609	20 %	60 %	20 %	0 %	212217736
45	NC_011528	TTTGC	2	10	50482	50491	0 %	60 %	20 %	20 %	212217738
46	NC_011528	ATGAA	2	10	50652	50661	60 %	20 %	20 %	0 %	212217738
47	NC_011528	TGCGT	2	10	51832	51841	0 %	40 %	40 %	20 %	212217739
48	NC_011528	TGCGC	2	10	53592	53601	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011528	TTACC	2	10	54855	54864	20 %	40 %	0 %	40 %	212217743
50	NC_011528	ATTTT	2	10	55095	55104	20 %	80 %	0 %	0 %	212217743
51	NC_011528	AATAG	2	10	55665	55674	60 %	20 %	20 %	0 %	212217744
52	NC_011528	TTATT	2	10	56023	56032	20 %	80 %	0 %	0 %	212217745
53	NC_011528	GAATG	2	10	59458	59467	40 %	20 %	40 %	0 %	212217748
54	NC_011528	ATTTT	2	10	61312	61321	20 %	80 %	0 %	0 %	212217751
55	NC_011528	ATTTT	2	10	61448	61457	20 %	80 %	0 %	0 %	212217751
56	NC_011528	CTTGG	2	10	61488	61497	0 %	40 %	40 %	20 %	212217751
57	NC_011528	TCATT	2	10	61901	61910	20 %	60 %	0 %	20 %	212217751
58	NC_011528	CAAAA	2	10	62212	62221	80 %	0 %	0 %	20 %	212217751
59	NC_011528	GAAGC	2	10	64061	64070	40 %	0 %	40 %	20 %	212217753
60	NC_011528	TCGCT	2	10	64102	64111	0 %	40 %	20 %	40 %	212217753
61	NC_011528	TGGCA	2	10	65996	66005	20 %	20 %	40 %	20 %	212217754
62	NC_011528	TGCGG	2	10	66956	66965	0 %	20 %	60 %	20 %	212217754
63	NC_011528	AAAAT	2	10	68720	68729	80 %	20 %	0 %	0 %	212217756
64	NC_011528	CCTTA	2	10	70324	70333	20 %	40 %	0 %	40 %	212217757
65	NC_011528	ATTTC	2	10	70508	70517	20 %	60 %	0 %	20 %	212217757
66	NC_011528	AAAGG	2	10	70568	70577	60 %	0 %	40 %	0 %	212217757
67	NC_011528	TCGAT	2	10	71137	71146	20 %	40 %	20 %	20 %	212217757
68	NC_011528	TTTGA	2	10	71762	71771	20 %	60 %	20 %	0 %	212217758
69	NC_011528	GAAAA	2	10	72877	72886	80 %	0 %	20 %	0 %	212217758
70	NC_011528	TCGCG	2	10	74973	74982	0 %	20 %	40 %	40 %	212217760
71	NC_011528	CAACG	2	10	76458	76467	40 %	0 %	20 %	40 %	212217761
72	NC_011528	AAGGA	2	10	78434	78443	60 %	0 %	40 %	0 %	212217763
73	NC_011528	TGCCA	2	10	81517	81526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_011528	ATCCC	2	10	82336	82345	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_011528	CTTTT	2	10	85662	85671	0 %	80 %	0 %	20 %	212217767
76	NC_011528	TAATT	2	10	86893	86902	40 %	60 %	0 %	0 %	212217768
77	NC_011528	GAGAA	2	10	88133	88142	60 %	0 %	40 %	0 %	212217769
78	NC_011528	TTATT	2	10	89424	89433	20 %	80 %	0 %	0 %	212217770
79	NC_011528	ATTTT	2	10	89898	89907	20 %	80 %	0 %	0 %	212217770
80	NC_011528	ATTGA	2	10	90329	90338	40 %	40 %	20 %	0 %	212217771
81	NC_011528	TTTTA	2	10	90781	90790	20 %	80 %	0 %	0 %	212217772
82	NC_011528	AAGCA	2	10	90864	90873	60 %	0 %	20 %	20 %	212217772
83	NC_011528	AAAAG	2	10	91072	91081	80 %	0 %	20 %	0 %	212217772
84	NC_011528	GGAAA	2	10	91754	91763	60 %	0 %	40 %	0 %	212217773
85	NC_011528	CAAAA	2	10	92356	92365	80 %	0 %	0 %	20 %	212217774
86	NC_011528	AAGTA	2	10	92914	92923	60 %	20 %	20 %	0 %	212217775
87	NC_011528	CTCAT	2	10	94491	94500	20 %	40 %	0 %	40 %	212217778
88	NC_011528	TCGCT	2	10	95209	95218	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011528	AAGGA	2	10	96284	96293	60 %	0 %	40 %	0 %	212217782
90	NC_011528	GAAAC	2	10	97419	97428	60 %	0 %	20 %	20 %	212217783
91	NC_011528	AAATT	2	10	97795	97804	60 %	40 %	0 %	0 %	212217783
92	NC_011528	TAATA	2	10	98677	98686	60 %	40 %	0 %	0 %	212217785
93	NC_011528	CGTTG	2	10	98742	98751	0 %	40 %	40 %	20 %	212217785
94	NC_011528	GGGAA	2	10	101056	101065	40 %	0 %	60 %	0 %	212217786
95	NC_011528	AAAAT	2	10	101165	101174	80 %	20 %	0 %	0 %	212217786
96	NC_011528	GTTGT	2	10	101689	101698	0 %	60 %	40 %	0 %	212217787
97	NC_011528	CTAAA	2	10	102505	102514	60 %	20 %	0 %	20 %	212217788
98	NC_011528	AGCGA	2	10	103292	103301	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011528	TCGCT	2	10	103344	103353	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_011528	ATTTA	2	10	104024	104033	40 %	60 %	0 %	0 %	212217790
101	NC_011528	GCCGC	2	10	104196	104205	0 %	0 %	40 %	60 %	212217790
102	NC_011528	GCTTT	2	10	104446	104455	0 %	60 %	20 %	20 %	212217790
103	NC_011528	GGAAT	2	10	106754	106763	40 %	20 %	40 %	0 %	212217792
104	NC_011528	AAATC	2	10	107029	107038	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011528	AAAAT	2	10	107052	107061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011528	ATTTT	2	10	107138	107147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011528	CTCTT	2	10	108600	108609	0 %	60 %	0 %	40 %	212217793
108	NC_011528	ACGCT	2	10	109367	109376	20 %	20 %	20 %	40 %	212217794
109	NC_011528	AAAAT	2	10	111004	111013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011528	AAATA	2	10	111485	111494	80 %	20 %	0 %	0 %	212217797
111	NC_011528	TTAAT	2	10	111642	111651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011528	GAGAT	2	10	112500	112509	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011528	CCGTG	2	10	113534	113543	0 %	20 %	40 %	40 %	212217800
114	NC_011528	GGCGA	2	10	113920	113929	20 %	0 %	60 %	20 %	212217800
115	NC_011528	TAAAA	2	10	116142	116151	80 %	20 %	0 %	0 %	212217802
116	NC_011528	GATTT	2	10	116527	116536	20 %	60 %	20 %	0 %	212217802
117	NC_011528	AGGAG	2	10	116557	116566	40 %	0 %	60 %	0 %	212217802
118	NC_011528	TATTG	2	10	116658	116667	20 %	60 %	20 %	0 %	212217803
119	NC_011528	CACTA	2	10	116702	116711	40 %	20 %	0 %	40 %	212217803
120	NC_011528	TTTTC	2	10	118475	118484	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011528	TTCGT	2	10	119748	119757	0 %	60 %	20 %	20 %	212217805
122	NC_011528	AGAGC	2	10	119872	119881	40 %	0 %	40 %	20 %	212217805
123	NC_011528	TATTT	2	10	120382	120391	20 %	80 %	0 %	0 %	212217805
124	NC_011528	AGCGA	2	10	122219	122228	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011528	TCGCT	2	10	122269	122278	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_011528	TAACA	2	10	125096	125105	60 %	20 %	0 %	20 %	212217809
127	NC_011528	GTAAT	2	10	126527	126536	40 %	40 %	20 %	0 %	212217811
128	NC_011528	AAATA	2	10	127415	127424	80 %	20 %	0 %	0 %	212217812
129	NC_011528	GCGCG	2	10	128162	128171	0 %	0 %	60 %	40 %	212217813
130	NC_011528	AAGTC	2	10	130112	130121	40 %	20 %	20 %	20 %	212217815
131	NC_011528	GCTAC	2	10	130727	130736	20 %	20 %	20 %	40 %	212217816
132	NC_011528	GCAAC	2	10	130771	130780	40 %	0 %	20 %	40 %	212217816
133	NC_011528	ATGGT	2	10	131673	131682	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011528	GTCTT	2	10	137436	137445	0 %	60 %	20 %	20 %	212217825
135	NC_011528	CTTCT	2	10	137896	137905	0 %	60 %	0 %	40 %	212217825
136	NC_011528	GTTTT	2	10	138758	138767	0 %	80 %	20 %	0 %	212217826
137	NC_011528	CTCGT	2	10	139555	139564	0 %	40 %	20 %	40 %	212217826
138	NC_011528	AATAA	2	10	140124	140133	80 %	20 %	0 %	0 %	212217827
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250	NC_011528	CTTAC	2	10	285976	285985	20 %	40 %	0 %	40 %	212217978
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252	NC_011528	GAAAA	2	10	288833	288842	80 %	0 %	20 %	0 %	212217981
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258	NC_011528	AAAAT	2	10	295038	295047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_011528	ATTTA	2	10	296510	296519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_011528	TTAAT	2	10	297589	297598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_011528	CTTAA	2	10	297762	297771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
262	NC_011528	GTAAG	2	10	299835	299844	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
263	NC_011528	GGGAA	2	10	300641	300650	40 %	0 %	60 %	0 %	212217991
264	NC_011528	AAAAC	2	10	301151	301160	80 %	0 %	0 %	20 %	212217991
265	NC_011528	ATTTC	2	10	302844	302853	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_011528	AATAA	2	10	303011	303020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_011528	TTCGT	2	10	303619	303628	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
268	NC_011528	ATTTG	2	10	305502	305511	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_011528	AGCGA	2	10	306466	306475	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
270	NC_011528	TACTT	2	10	306536	306545	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_011528	CCGTC	2	10	307842	307851	0 %	20 %	20 %	60 %	212217996
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406	NC_011528	AAAAT	2	10	481723	481732	80 %	20 %	0 %	0 %	212218167
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447	NC_011528	TGAAA	2	10	523185	523194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_011528	TCGCT	2	10	555814	555823	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
478	NC_011528	AAATT	2	10	558074	558083	60 %	40 %	0 %	0 %	212218238
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486	NC_011528	TCGCT	2	10	565681	565690	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
487	NC_011528	AAGAA	2	10	566193	566202	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_011528	GTATT	2	10	579887	579896	20 %	60 %	20 %	0 %	212218255

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