MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 1285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011528	TGGAT	2	10	291	300	20 %	40 %	40 %	0 %	212217689
2	NC_011528	AAATT	2	10	1642	1651	60 %	40 %	0 %	0 %	212217690
3	NC_011528	GATTT	2	10	10241	10250	20 %	60 %	20 %	0 %	212217696
4	NC_011528	AATGA	2	10	10464	10473	60 %	20 %	20 %	0 %	212217696
5	NC_011528	ATCTC	2	10	12728	12737	20 %	40 %	0 %	40 %	212217698
6	NC_011528	ATGGA	2	10	13903	13912	40 %	20 %	40 %	0 %	212217700
7	NC_011528	CGCAG	2	10	15329	15338	20 %	0 %	40 %	40 %	212217701
8	NC_011528	TTTAT	2	10	15858	15867	20 %	80 %	0 %	0 %	212217702
9	NC_011528	GCAAT	2	10	16702	16711	40 %	20 %	20 %	20 %	212217703
10	NC_011528	GCTCA	2	10	17462	17471	20 %	20 %	20 %	40 %	212217704
11	NC_011528	ATGGA	2	10	18700	18709	40 %	20 %	40 %	0 %	212217706
12	NC_011528	CTCAA	2	10	19557	19566	40 %	20 %	0 %	40 %	212217707
13	NC_011528	TGCGT	2	10	20680	20689	0 %	40 %	40 %	20 %	212217707
14	NC_011528	TTTTG	2	10	25328	25337	0 %	80 %	20 %	0 %	212217713
15	NC_011528	GCGCG	2	10	25939	25948	0 %	0 %	60 %	40 %	212217713
16	NC_011528	AAAAT	2	10	27459	27468	80 %	20 %	0 %	0 %	212217715
17	NC_011528	TCGCT	2	10	28431	28440	0 %	40 %	20 %	40 %	212217716
18	NC_011528	AGCGA	2	10	28476	28485	40 %	0 %	40 %	20 %	212217716
19	NC_011528	AATTC	2	10	28495	28504	40 %	40 %	0 %	20 %	212217716
20	NC_011528	ATTTT	2	10	31663	31672	20 %	80 %	0 %	0 %	212217719
21	NC_011528	AATCG	2	10	32971	32980	40 %	20 %	20 %	20 %	212217721
22	NC_011528	ACTTT	2	10	33965	33974	20 %	60 %	0 %	20 %	212217721
23	NC_011528	TTCGT	2	10	34373	34382	0 %	60 %	20 %	20 %	212217721
24	NC_011528	CGAAA	2	10	34753	34762	60 %	0 %	20 %	20 %	212217721
25	NC_011528	GAAAA	2	10	35190	35199	80 %	0 %	20 %	0 %	212217721
26	NC_011528	AAAAC	2	10	37692	37701	80 %	0 %	0 %	20 %	212217723
27	NC_011528	CCATC	2	10	39264	39273	20 %	20 %	0 %	60 %	212217727
28	NC_011528	GGATT	2	10	39693	39702	20 %	40 %	40 %	0 %	212217727
29	NC_011528	AAATA	2	10	39938	39947	80 %	20 %	0 %	0 %	212217727
30	NC_011528	ATTAA	2	10	40606	40615	60 %	40 %	0 %	0 %	212217727
31	NC_011528	TTGGG	2	10	41113	41122	0 %	40 %	60 %	0 %	212217727
32	NC_011528	GCGCG	2	10	45357	45366	0 %	0 %	60 %	40 %	212217732
33	NC_011528	GCATT	2	10	46896	46905	20 %	40 %	20 %	20 %	212217735
34	NC_011528	TTAAA	2	10	47326	47335	60 %	40 %	0 %	0 %	212217735
35	NC_011528	ATGTT	2	10	47600	47609	20 %	60 %	20 %	0 %	212217736
36	NC_011528	TTTGC	2	10	50482	50491	0 %	60 %	20 %	20 %	212217738
37	NC_011528	ATGAA	2	10	50652	50661	60 %	20 %	20 %	0 %	212217738
38	NC_011528	TGCGT	2	10	51832	51841	0 %	40 %	40 %	20 %	212217739
39	NC_011528	TTACC	2	10	54855	54864	20 %	40 %	0 %	40 %	212217743
40	NC_011528	ATTTT	2	10	55095	55104	20 %	80 %	0 %	0 %	212217743
41	NC_011528	AATAG	2	10	55665	55674	60 %	20 %	20 %	0 %	212217744
42	NC_011528	TTATT	2	10	56023	56032	20 %	80 %	0 %	0 %	212217745
43	NC_011528	GAATG	2	10	59458	59467	40 %	20 %	40 %	0 %	212217748
44	NC_011528	ATTTT	2	10	61312	61321	20 %	80 %	0 %	0 %	212217751
45	NC_011528	ATTTT	2	10	61448	61457	20 %	80 %	0 %	0 %	212217751
46	NC_011528	CTTGG	2	10	61488	61497	0 %	40 %	40 %	20 %	212217751
47	NC_011528	TCATT	2	10	61901	61910	20 %	60 %	0 %	20 %	212217751
48	NC_011528	CAAAA	2	10	62212	62221	80 %	0 %	0 %	20 %	212217751
49	NC_011528	GAAGC	2	10	64061	64070	40 %	0 %	40 %	20 %	212217753
50	NC_011528	TCGCT	2	10	64102	64111	0 %	40 %	20 %	40 %	212217753
51	NC_011528	TGGCA	2	10	65996	66005	20 %	20 %	40 %	20 %	212217754
52	NC_011528	TGCGG	2	10	66956	66965	0 %	20 %	60 %	20 %	212217754
53	NC_011528	AAAAT	2	10	68720	68729	80 %	20 %	0 %	0 %	212217756
54	NC_011528	CCTTA	2	10	70324	70333	20 %	40 %	0 %	40 %	212217757
55	NC_011528	ATTTC	2	10	70508	70517	20 %	60 %	0 %	20 %	212217757
56	NC_011528	AAAGG	2	10	70568	70577	60 %	0 %	40 %	0 %	212217757
57	NC_011528	TCGAT	2	10	71137	71146	20 %	40 %	20 %	20 %	212217757
58	NC_011528	TTTGA	2	10	71762	71771	20 %	60 %	20 %	0 %	212217758
59	NC_011528	GAAAA	2	10	72877	72886	80 %	0 %	20 %	0 %	212217758
60	NC_011528	TCGCG	2	10	74973	74982	0 %	20 %	40 %	40 %	212217760
61	NC_011528	CAACG	2	10	76458	76467	40 %	0 %	20 %	40 %	212217761
62	NC_011528	AAGGA	2	10	78434	78443	60 %	0 %	40 %	0 %	212217763
63	NC_011528	CTTTT	2	10	85662	85671	0 %	80 %	0 %	20 %	212217767
64	NC_011528	TAATT	2	10	86893	86902	40 %	60 %	0 %	0 %	212217768
65	NC_011528	GAGAA	2	10	88133	88142	60 %	0 %	40 %	0 %	212217769
66	NC_011528	TTATT	2	10	89424	89433	20 %	80 %	0 %	0 %	212217770
67	NC_011528	ATTTT	2	10	89898	89907	20 %	80 %	0 %	0 %	212217770
68	NC_011528	ATTGA	2	10	90329	90338	40 %	40 %	20 %	0 %	212217771
69	NC_011528	TTTTA	2	10	90781	90790	20 %	80 %	0 %	0 %	212217772
70	NC_011528	AAGCA	2	10	90864	90873	60 %	0 %	20 %	20 %	212217772
71	NC_011528	AAAAG	2	10	91072	91081	80 %	0 %	20 %	0 %	212217772
72	NC_011528	GGAAA	2	10	91754	91763	60 %	0 %	40 %	0 %	212217773
73	NC_011528	CAAAA	2	10	92356	92365	80 %	0 %	0 %	20 %	212217774
74	NC_011528	AAGTA	2	10	92914	92923	60 %	20 %	20 %	0 %	212217775
75	NC_011528	CTCAT	2	10	94491	94500	20 %	40 %	0 %	40 %	212217778
76	NC_011528	AAGGA	2	10	96284	96293	60 %	0 %	40 %	0 %	212217782
77	NC_011528	GAAAC	2	10	97419	97428	60 %	0 %	20 %	20 %	212217783
78	NC_011528	AAATT	2	10	97795	97804	60 %	40 %	0 %	0 %	212217783
79	NC_011528	TAATA	2	10	98677	98686	60 %	40 %	0 %	0 %	212217785
80	NC_011528	CGTTG	2	10	98742	98751	0 %	40 %	40 %	20 %	212217785
81	NC_011528	GGGAA	2	10	101056	101065	40 %	0 %	60 %	0 %	212217786
82	NC_011528	AAAAT	2	10	101165	101174	80 %	20 %	0 %	0 %	212217786
83	NC_011528	GTTGT	2	10	101689	101698	0 %	60 %	40 %	0 %	212217787
84	NC_011528	CTAAA	2	10	102505	102514	60 %	20 %	0 %	20 %	212217788
85	NC_011528	ATTTA	2	10	104024	104033	40 %	60 %	0 %	0 %	212217790
86	NC_011528	GCCGC	2	10	104196	104205	0 %	0 %	40 %	60 %	212217790
87	NC_011528	GCTTT	2	10	104446	104455	0 %	60 %	20 %	20 %	212217790
88	NC_011528	GGAAT	2	10	106754	106763	40 %	20 %	40 %	0 %	212217792
89	NC_011528	CTCTT	2	10	108600	108609	0 %	60 %	0 %	40 %	212217793
90	NC_011528	ACGCT	2	10	109367	109376	20 %	20 %	20 %	40 %	212217794
91	NC_011528	AAATA	2	10	111485	111494	80 %	20 %	0 %	0 %	212217797
92	NC_011528	CCGTG	2	10	113534	113543	0 %	20 %	40 %	40 %	212217800
93	NC_011528	GGCGA	2	10	113920	113929	20 %	0 %	60 %	20 %	212217800
94	NC_011528	TAAAA	2	10	116142	116151	80 %	20 %	0 %	0 %	212217802
95	NC_011528	GATTT	2	10	116527	116536	20 %	60 %	20 %	0 %	212217802
96	NC_011528	AGGAG	2	10	116557	116566	40 %	0 %	60 %	0 %	212217802
97	NC_011528	TATTG	2	10	116658	116667	20 %	60 %	20 %	0 %	212217803
98	NC_011528	CACTA	2	10	116702	116711	40 %	20 %	0 %	40 %	212217803
99	NC_011528	TTCGT	2	10	119748	119757	0 %	60 %	20 %	20 %	212217805
100	NC_011528	AGAGC	2	10	119872	119881	40 %	0 %	40 %	20 %	212217805
101	NC_011528	TATTT	2	10	120382	120391	20 %	80 %	0 %	0 %	212217805
102	NC_011528	TAACA	2	10	125096	125105	60 %	20 %	0 %	20 %	212217809
103	NC_011528	GTAAT	2	10	126527	126536	40 %	40 %	20 %	0 %	212217811
104	NC_011528	AAATA	2	10	127415	127424	80 %	20 %	0 %	0 %	212217812
105	NC_011528	GCGCG	2	10	128162	128171	0 %	0 %	60 %	40 %	212217813
106	NC_011528	AAGTC	2	10	130112	130121	40 %	20 %	20 %	20 %	212217815
107	NC_011528	GCTAC	2	10	130727	130736	20 %	20 %	20 %	40 %	212217816
108	NC_011528	GCAAC	2	10	130771	130780	40 %	0 %	20 %	40 %	212217816
109	NC_011528	GTCTT	2	10	137436	137445	0 %	60 %	20 %	20 %	212217825
110	NC_011528	CTTCT	2	10	137896	137905	0 %	60 %	0 %	40 %	212217825
111	NC_011528	GTTTT	2	10	138758	138767	0 %	80 %	20 %	0 %	212217826
112	NC_011528	CTCGT	2	10	139555	139564	0 %	40 %	20 %	40 %	212217826
113	NC_011528	AATAA	2	10	140124	140133	80 %	20 %	0 %	0 %	212217827
114	NC_011528	TTCCA	2	10	140531	140540	20 %	40 %	0 %	40 %	212217829
115	NC_011528	CCCAA	2	10	142233	142242	40 %	0 %	0 %	60 %	212217831
116	NC_011528	AAAAT	2	10	142350	142359	80 %	20 %	0 %	0 %	212217831
117	NC_011528	ATTTT	2	10	144085	144094	20 %	80 %	0 %	0 %	212217832
118	NC_011528	GCGCG	2	10	147491	147500	0 %	0 %	60 %	40 %	212217835
119	NC_011528	AGGCC	2	10	148801	148810	20 %	0 %	40 %	40 %	212217835
120	NC_011528	AAAAT	2	10	152508	152517	80 %	20 %	0 %	0 %	212217839
121	NC_011528	GGAGG	2	10	153226	153235	20 %	0 %	80 %	0 %	212217840
122	NC_011528	AATTT	2	10	153647	153656	40 %	60 %	0 %	0 %	212217840
123	NC_011528	TTGCC	2	10	154598	154607	0 %	40 %	20 %	40 %	212217840
124	NC_011528	AACAA	2	10	156426	156435	80 %	0 %	0 %	20 %	212217844
125	NC_011528	AATTA	2	10	158036	158045	60 %	40 %	0 %	0 %	212217847
126	NC_011528	GCCCC	2	10	162604	162613	0 %	0 %	20 %	80 %	212217851
127	NC_011528	GAAAT	2	10	162709	162718	60 %	20 %	20 %	0 %	212217852
128	NC_011528	TGTCT	2	10	163010	163019	0 %	60 %	20 %	20 %	212217852
129	NC_011528	AATAA	2	10	163074	163083	80 %	20 %	0 %	0 %	212217852
130	NC_011528	ACTTT	2	10	163489	163498	20 %	60 %	0 %	20 %	212217852
131	NC_011528	TCAAA	2	10	167285	167294	60 %	20 %	0 %	20 %	212217858
132	NC_011528	CGAGG	2	10	167648	167657	20 %	0 %	60 %	20 %	212217858
133	NC_011528	TGAAT	2	10	168813	168822	40 %	40 %	20 %	0 %	212217861
134	NC_011528	AAATA	2	10	169191	169200	80 %	20 %	0 %	0 %	212217861
135	NC_011528	GGCAA	2	10	173389	173398	40 %	0 %	40 %	20 %	212217864
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244	NC_011528	TGGGC	2	10	363345	363354	0 %	20 %	60 %	20 %	212218042
245	NC_011528	ATTTA	2	10	372655	372664	40 %	60 %	0 %	0 %	212218050
246	NC_011528	GTGTG	2	10	373456	373465	0 %	40 %	60 %	0 %	212218050
247	NC_011528	TTCTG	2	10	379351	379360	0 %	60 %	20 %	20 %	212218054
248	NC_011528	AGAAA	2	10	381531	381540	80 %	0 %	20 %	0 %	212218057
249	NC_011528	ATTAA	2	10	384461	384470	60 %	40 %	0 %	0 %	212218061
250	NC_011528	TATTG	2	10	385568	385577	20 %	60 %	20 %	0 %	212218062
251	NC_011528	ACGTG	2	10	388126	388135	20 %	20 %	40 %	20 %	212218065
252	NC_011528	GTGAA	2	10	390925	390934	40 %	20 %	40 %	0 %	212218066
253	NC_011528	CCGCA	2	10	395023	395032	20 %	0 %	20 %	60 %	212218066
254	NC_011528	TCGCG	2	10	397500	397509	0 %	20 %	40 %	40 %	212218070
255	NC_011528	TGGAT	2	10	397906	397915	20 %	40 %	40 %	0 %	212218071
256	NC_011528	TTGAT	2	10	398305	398314	20 %	60 %	20 %	0 %	212218071
257	NC_011528	AGAAA	2	10	399992	400001	80 %	0 %	20 %	0 %	212218072
258	NC_011528	CTATT	2	10	401368	401377	20 %	60 %	0 %	20 %	212218073
259	NC_011528	AAAAC	2	10	403190	403199	80 %	0 %	0 %	20 %	212218077
260	NC_011528	GGCGC	2	10	408250	408259	0 %	0 %	60 %	40 %	212218088
261	NC_011528	CGATA	2	10	408825	408834	40 %	20 %	20 %	20 %	212218089
262	NC_011528	GAATT	2	10	409212	409221	40 %	40 %	20 %	0 %	212218090
263	NC_011528	AATGC	2	10	409567	409576	40 %	20 %	20 %	20 %	212218091
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