MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 21162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011528	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217689
2	NC_011528	CAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217689
3	NC_011528	TAC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217689
4	NC_011528	CCT	2	6	356	361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217689
5	NC_011528	AGC	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217689
6	NC_011528	TCG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217689
7	NC_011528	GCC	3	9	545	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217689
8	NC_011528	TGG	2	6	604	609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217689
9	NC_011528	TTG	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217689
10	NC_011528	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217689
11	NC_011528	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217689
12	NC_011528	AGA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217689
13	NC_011528	CTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217689
14	NC_011528	CGT	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217689
15	NC_011528	AGA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217689
16	NC_011528	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
17	NC_011528	TCT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217690
18	NC_011528	CCG	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217690
19	NC_011528	TAT	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
20	NC_011528	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217690
21	NC_011528	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
22	NC_011528	GAG	2	6	2266	2271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217690
23	NC_011528	AAT	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217690
24	NC_011528	CTA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217690
25	NC_011528	GTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217690
26	NC_011528	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
27	NC_011528	CCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217690
28	NC_011528	AAG	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217690
29	NC_011528	GAA	3	9	2551	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217690
30	NC_011528	AGC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217690
31	NC_011528	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217691
32	NC_011528	TTA	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217691
33	NC_011528	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217691
34	NC_011528	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217691
35	NC_011528	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217691
36	NC_011528	CCG	2	6	3669	3674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217691
37	NC_011528	CGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217691
38	NC_011528	CAC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217692
39	NC_011528	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217692
40	NC_011528	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217692
41	NC_011528	CAC	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217692
42	NC_011528	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217692
43	NC_011528	AGA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
44	NC_011528	GCC	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217692
45	NC_011528	TTA	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217692
46	NC_011528	CGG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217692
47	NC_011528	GTG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217692
48	NC_011528	AGA	2	6	4520	4525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
49	NC_011528	AAT	2	6	4947	4952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217692
50	NC_011528	CGG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217692
51	NC_011528	AGT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217692
52	NC_011528	TGC	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217692
53	NC_011528	ACG	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217692
54	NC_011528	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217692
55	NC_011528	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217692
56	NC_011528	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
57	NC_011528	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217692
58	NC_011528	TCT	2	6	5674	5679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217692
59	NC_011528	GTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217692
60	NC_011528	GCG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217692
61	NC_011528	GCT	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217692
62	NC_011528	GAA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
63	NC_011528	GGA	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217692
64	NC_011528	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217692
65	NC_011528	TTG	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217692
66	NC_011528	TAT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217692
67	NC_011528	ACC	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217692
68	NC_011528	CGC	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217692
69	NC_011528	CCG	2	6	7796	7801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217693
70	NC_011528	TGA	2	6	7862	7867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217693
71	NC_011528	TCA	2	6	7956	7961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217693
72	NC_011528	TGG	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217693
73	NC_011528	TCA	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217693
74	NC_011528	TTG	2	6	8037	8042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217693
75	NC_011528	ACA	2	6	8043	8048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217693
76	NC_011528	TCT	2	6	8132	8137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217694
77	NC_011528	TCT	2	6	8281	8286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217694
78	NC_011528	AAG	2	6	8351	8356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217694
79	NC_011528	TGG	2	6	8411	8416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217694
80	NC_011528	CAA	2	6	8471	8476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217694
81	NC_011528	CAC	2	6	8522	8527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217694
82	NC_011528	GTG	2	6	8608	8613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217694
83	NC_011528	GAT	2	6	8670	8675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217694
84	NC_011528	ACG	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217695
85	NC_011528	ACT	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217695
86	NC_011528	TTC	2	6	9176	9181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217696
87	NC_011528	TCT	2	6	9244	9249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217696
88	NC_011528	TGC	2	6	9254	9259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217696
89	NC_011528	TGC	2	6	9267	9272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217696
90	NC_011528	AAT	2	6	9310	9315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217696
91	NC_011528	GAT	2	6	9398	9403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217696
92	NC_011528	CGC	2	6	9413	9418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217696
93	NC_011528	GCT	2	6	9492	9497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217696
94	NC_011528	CCG	2	6	9534	9539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217696
95	NC_011528	AGA	2	6	9614	9619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217696
96	NC_011528	TCC	2	6	9629	9634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217696
97	NC_011528	AAT	2	6	9664	9669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217696
98	NC_011528	AAT	2	6	9704	9709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217696
99	NC_011528	TTG	2	6	9716	9721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217696
100	NC_011528	TTG	2	6	9737	9742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217696
101	NC_011528	GCG	2	6	9822	9827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217696
102	NC_011528	ATT	2	6	9878	9883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217696
103	NC_011528	TCA	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217696
104	NC_011528	GGA	2	6	9960	9965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217696
105	NC_011528	TGT	2	6	10259	10264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217696
106	NC_011528	AAG	2	6	10294	10299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217696
107	NC_011528	ACG	2	6	10324	10329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217696
108	NC_011528	CCA	2	6	10357	10362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217696
109	NC_011528	TGA	2	6	10480	10485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217696
110	NC_011528	CCG	2	6	10515	10520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217697
111	NC_011528	GGC	2	6	10584	10589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217697
112	NC_011528	TTG	2	6	10615	10620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217697
113	NC_011528	CTC	2	6	10698	10703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217697
114	NC_011528	CTT	2	6	10785	10790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217697
115	NC_011528	CTT	2	6	10836	10841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217697
116	NC_011528	GCC	2	6	10990	10995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217697
117	NC_011528	CAA	2	6	10996	11001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217697
118	NC_011528	ACG	2	6	11055	11060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217697
119	NC_011528	CAT	2	6	11074	11079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217697
120	NC_011528	ATC	2	6	11081	11086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217697
121	NC_011528	CAA	2	6	11244	11249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217697
122	NC_011528	ATT	2	6	11254	11259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217697
123	NC_011528	TGG	2	6	11339	11344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217697
124	NC_011528	CGC	3	9	11365	11373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217697
125	NC_011528	CGC	2	6	11423	11428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217697
126	NC_011528	TAA	2	6	11476	11481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217697
127	NC_011528	ATC	2	6	11560	11565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217697
128	NC_011528	CAC	2	6	11586	11591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217697
129	NC_011528	CGG	2	6	11622	11627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217697
130	NC_011528	CAT	2	6	11650	11655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217697
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132	NC_011528	ACC	2	6	11735	11740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217697
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135	NC_011528	CAT	2	6	11830	11835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217697
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251	NC_011528	TAT	2	6	20635	20640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217707
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255	NC_011528	AAG	2	6	20862	20867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217707
256	NC_011528	CCG	2	6	20929	20934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217707
257	NC_011528	AGC	3	9	20983	20991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217707
258	NC_011528	TAA	2	6	20992	20997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217707
259	NC_011528	AAT	2	6	21125	21130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217707
260	NC_011528	CTG	2	6	21260	21265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217707
261	NC_011528	ACA	2	6	21274	21279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217707
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263	NC_011528	CAA	2	6	21642	21647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217708
264	NC_011528	ATT	2	6	21648	21653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217708
265	NC_011528	AAC	2	6	21793	21798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217708
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270	NC_011528	AGG	2	6	22401	22406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217708
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378	NC_011528	GCG	2	6	30602	30607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217717
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380	NC_011528	GAA	2	6	30631	30636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217717
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