MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011527	ATGGCC	2	12	1316	1327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212211670
2	NC_011527	TGAGCG	2	12	4129	4140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212211673
3	NC_011527	CCGACG	2	12	5626	5637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	212211673
4	NC_011527	GTATCT	2	12	11880	11891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212211680
5	NC_011527	TCAAAA	2	12	12104	12115	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	212211681
6	NC_011527	ATGAAA	2	12	22461	22472	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	212211692
7	NC_011527	AAATGG	2	12	24696	24707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212211697
8	NC_011527	AAGCGG	2	12	26856	26867	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212211699
9	NC_011527	AAAGGA	2	12	32887	32898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211704
10	NC_011527	ACGATA	2	12	34442	34453	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212211705
11	NC_011527	ATCTAG	2	12	37923	37934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212211710
12	NC_011527	CCTTTT	2	12	38043	38054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211710
13	NC_011527	ATCGAA	2	12	38496	38507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212211711
14	NC_011527	AAGAAA	2	12	39004	39015	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212211711
15	NC_011527	CGGAAG	2	12	39029	39040	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212211711
16	NC_011527	CGTTGA	2	12	49677	49688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212211723
17	NC_011527	ATGTCA	2	12	52406	52417	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212211725
18	NC_011527	GACTCA	2	12	60555	60566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212211739
19	NC_011527	ACTTTC	3	18	61682	61699	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212211742
20	NC_011527	TCGAAT	2	12	63553	63564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212211744
21	NC_011527	AGAAAA	2	12	64270	64281	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212211746
22	NC_011527	GTGATG	2	12	68217	68228	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	212211750
23	NC_011527	CCACGC	2	12	84860	84871	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	212211763
24	NC_011527	CTACCA	2	12	86751	86762	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	212211765
25	NC_011527	CGAAGC	2	12	87390	87401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211765
26	NC_011527	ATTCGT	2	12	88858	88869	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212211765
27	NC_011527	AAAATA	2	12	89387	89398	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	212211766
28	NC_011527	TTTACC	2	12	94795	94806	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212211767
29	NC_011527	AGCGGC	2	12	100300	100311	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	212211769
30	NC_011527	AAAAAT	2	12	101276	101287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	212211770
31	NC_011527	TCTCAA	2	12	101680	101691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211770
32	NC_011527	GTAAAG	2	12	102279	102290	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212211771
33	NC_011527	CGGGTT	2	12	102861	102872	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	212211772
34	NC_011527	TTTTTA	2	12	110229	110240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212211776
35	NC_011527	GAAAAA	2	12	111769	111780	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212211777
36	NC_011527	TAACGC	2	12	113387	113398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212211780
37	NC_011527	AACCGG	2	12	118227	118238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211786
38	NC_011527	AATTAA	2	12	118275	118286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211786
39	NC_011527	ATCTTC	2	12	118659	118670	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212211787
40	NC_011527	GCTGAA	2	12	121801	121812	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212211793
41	NC_011527	ATTGAG	2	12	123336	123347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211794
42	NC_011527	GGATAA	2	12	123602	123613	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212211794
43	NC_011527	GAGACC	2	12	126972	126983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211798
44	NC_011527	CCCAAT	2	12	128164	128175	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	212211798
45	NC_011527	TTGTTA	2	12	130995	131006	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212211801
46	NC_011527	AATGAG	2	12	138994	139005	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212211808
47	NC_011527	ACATTC	2	12	142150	142161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211812
48	NC_011527	AGACAT	2	12	142866	142877	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212211812
49	NC_011527	ATTTTT	2	12	144674	144685	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212211815
50	NC_011527	CGGCTA	2	12	149332	149343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212211818
51	NC_011527	AGATTG	2	12	151477	151488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211819
52	NC_011527	TCGCCG	2	12	154148	154159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	212211821
53	NC_011527	CGATCG	2	12	154442	154453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212211821
54	NC_011527	AAGTGG	2	12	158405	158416	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	212211824
55	NC_011527	CCTTAG	2	12	158954	158965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212211824
56	NC_011527	CAGAAA	2	12	160061	160072	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212211826
57	NC_011527	AATTTG	2	12	162481	162492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	212211828
58	NC_011527	ATTAAA	2	12	172236	172247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211833
59	NC_011527	ATTAAT	2	12	176253	176264	50 %	50 %	0 %	0 %	212211840
60	NC_011527	CGTTAC	3	18	177490	177507	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212211841
61	NC_011527	CGTTGC	4	24	177508	177531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211841
62	NC_011527	CGTTAT	2	12	178100	178111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212211841
63	NC_011527	ATTGGT	2	12	180481	180492	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212211844
64	NC_011527	GATAAT	2	12	182468	182479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212211845
65	NC_011527	GTCGAA	2	12	183026	183037	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212211846
66	NC_011527	GAATTA	2	12	184763	184774	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212211848
67	NC_011527	CTAAAG	2	12	186256	186267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212211849
68	NC_011527	CCTTTT	2	12	190264	190275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211854
69	NC_011527	GCATAG	2	12	201525	201536	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212211864
70	NC_011527	GAAGCC	2	12	206107	206118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211868
71	NC_011527	CTGATA	2	12	206222	206233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212211868
72	NC_011527	TTGGCT	2	12	207252	207263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212211870
73	NC_011527	ATTGAT	2	12	209268	209279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	212211874
74	NC_011527	GCAATT	2	12	209418	209429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212211874
75	NC_011527	CCTTGT	2	12	209993	210004	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212211875
76	NC_011527	TCAAAG	2	12	212547	212558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212211877
77	NC_011527	TTTTCT	2	12	213255	213266	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	212211879
78	NC_011527	CTTTTT	2	12	213337	213348	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	212211879
79	NC_011527	ATTGTT	2	12	215766	215777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212211881
80	NC_011527	GACTCC	2	12	228790	228801	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212211888
81	NC_011527	AATTTT	2	12	230068	230079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211890
82	NC_011527	CCTTTG	2	12	230301	230312	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212211891
83	NC_011527	ATAAAG	2	12	235325	235336	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	212211897
84	NC_011527	CATCCC	2	12	239599	239610	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	212211901
85	NC_011527	CCGCAG	2	12	241517	241528	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	212211903
86	NC_011527	ACCATC	2	12	246157	246168	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	212211911
87	NC_011527	CCGCTG	2	12	247823	247834	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	212211911
88	NC_011527	ATTGAA	2	12	248466	248477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212211912
89	NC_011527	ACGCCT	2	12	261653	261664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212211929
90	NC_011527	AAGCCA	2	12	262403	262414	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	212211929
91	NC_011527	CATACG	2	12	266100	266111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212211934
92	NC_011527	AAAAGC	2	12	267531	267542	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	212211935
93	NC_011527	GACGGT	2	12	270888	270899	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212211938
94	NC_011527	CTAATG	2	12	275483	275494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212211944
95	NC_011527	CCAAAG	2	12	279249	279260	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	212211949
96	NC_011527	TGTGAT	2	12	280177	280188	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212211949
97	NC_011527	TAATAT	2	12	287762	287773	50 %	50 %	0 %	0 %	212211958
98	NC_011527	AATAAA	2	12	289085	289096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	212211958
99	NC_011527	TCGAGG	2	12	291026	291037	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212211961
100	NC_011527	AAAACC	2	12	291507	291518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211960
101	NC_011527	TAAATT	2	12	293395	293406	50 %	50 %	0 %	0 %	212211963
102	NC_011527	AATATG	2	12	299498	299509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212211969
103	NC_011527	ATGCCA	2	12	305259	305270	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212211975
104	NC_011527	TGAAAA	2	12	311258	311269	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	212211979
105	NC_011527	ATTAAA	2	12	311289	311300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211979
106	NC_011527	TCAGAA	2	12	313293	313304	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212211980
107	NC_011527	TAAAAT	2	12	318875	318886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211988
108	NC_011527	ATCGCA	2	12	322915	322926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212211992
109	NC_011527	GAAAAA	2	12	329849	329860	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212212000
110	NC_011527	TAGCAG	2	12	333835	333846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212212005
111	NC_011527	ATAAAA	2	12	343653	343664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	212212017
112	NC_011527	GCAATA	2	12	346873	346884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212212019
113	NC_011527	CTGGCG	2	12	347094	347105	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	212212020
114	NC_011527	TGGGTT	2	12	355311	355322	0 %	50 %	50 %	0 %	212212030
115	NC_011527	GCGAAG	2	12	357152	357163	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212212031
116	NC_011527	TCTGTT	2	12	365388	365399	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	212212037
117	NC_011527	GGGTTG	2	12	367936	367947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212212041
118	NC_011527	TCCTTT	2	12	370751	370762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212212043
119	NC_011527	CCTTTA	2	12	371213	371224	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212212043
120	NC_011527	AGCTTA	2	12	381507	381518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212212052
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218	NC_011527	CGTGGA	2	12	698023	698034	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212212334
219	NC_011527	ACCCTA	2	12	700228	700239	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	212212338
220	NC_011527	ATGACG	2	12	700792	700803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212212339
221	NC_011527	TTCACT	2	12	706556	706567	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212212344
222	NC_011527	AGAAAA	2	12	707021	707032	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212212344
223	NC_011527	GCCCAA	2	12	713660	713671	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	212212351
224	NC_011527	TAACCA	2	12	715091	715102	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	212212353
225	NC_011527	GCGATT	2	12	716823	716834	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212212357
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227	NC_011527	TTTGAT	2	12	733232	733243	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212212372
228	NC_011527	GCGCTT	2	12	733298	733309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212372
229	NC_011527	TTTTAG	2	12	737530	737541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212212375
230	NC_011527	ACGATG	2	12	738979	738990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212212377
231	NC_011527	TTCGCG	2	12	741263	741274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212381
232	NC_011527	CGTTGT	2	12	744100	744111	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212212385
233	NC_011527	TTGAAA	2	12	754321	754332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212212389
234	NC_011527	ATATTA	2	12	771755	771766	50 %	50 %	0 %	0 %	212212400
235	NC_011527	TTATAA	2	12	773497	773508	50 %	50 %	0 %	0 %	212212402
236	NC_011527	TATGGA	2	12	774626	774637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212212402
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323	NC_011527	CGCTGT	2	12	1100550	1100561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212689
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326	NC_011527	GTTGCT	2	12	1113274	1113285	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212212699
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330	NC_011527	TCGCTG	2	12	1128026	1128037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212212711
331	NC_011527	TGCTTT	2	12	1128422	1128433	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	212212711
332	NC_011527	TTTTTG	2	12	1128943	1128954	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	212212711
333	NC_011527	TAAAAT	2	12	1131329	1131340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212212713
334	NC_011527	CGTAAT	2	12	1132033	1132044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212212714
335	NC_011527	ATAAAA	2	12	1136125	1136136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	212212717
336	NC_011527	GAAAAA	2	12	1138444	1138455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212212720
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338	NC_011527	AAGCAT	2	12	1150496	1150507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212212728
339	NC_011527	CGTTCC	2	12	1155513	1155524	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212212732
340	NC_011527	AACAGT	2	12	1158782	1158793	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212212735
341	NC_011527	GCGCAA	2	12	1165195	1165206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212212742
342	NC_011527	TAATTT	2	12	1165563	1165574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212212742
343	NC_011527	AGAAAA	2	12	1169560	1169571	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212212746
344	NC_011527	GAATAG	2	12	1169949	1169960	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212212746
345	NC_011527	AACTCT	2	12	1170232	1170243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212212746
346	NC_011527	AAATGG	2	12	1170513	1170524	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	212212747
347	NC_011527	CACTTT	2	12	1177162	1177173	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	212212750
348	NC_011527	TAAAAA	2	12	1184414	1184425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	212212752
349	NC_011527	AAGAAT	2	12	1188540	1188551	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	212212756
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369	NC_011527	TTCCTC	2	12	1291204	1291215	0 %	50 %	0 %	50 %	212212845
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455	NC_011527	ATTTCA	2	12	1539413	1539424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212213085
456	NC_011527	GTTGGG	2	12	1541375	1541386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212213088
457	NC_011527	TCATCG	2	12	1541989	1542000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212213088
458	NC_011527	ATCAAA	2	12	1551867	1551878	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	212213097
459	NC_011527	TTAATT	2	12	1551889	1551900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212213097
460	NC_011527	GCTTTT	2	12	1555160	1555171	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	212213102
461	NC_011527	TTTTTA	2	12	1556528	1556539	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212213103
462	NC_011527	CTATTT	2	12	1556642	1556653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	212213104
463	NC_011527	ATCCTG	2	12	1559252	1559263	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212213106
464	NC_011527	AGGCGA	2	12	1559604	1559615	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	212213106
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466	NC_011527	GGAATG	2	12	1562159	1562170	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	212213109
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476	NC_011527	CATTTT	2	12	1598066	1598077	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	212213142
477	NC_011527	CAATAA	2	12	1600343	1600354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	212213145
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480	NC_011527	GGTATC	2	12	1632264	1632275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212213167
481	NC_011527	CAGAAT	2	12	1644026	1644037	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212213179
482	NC_011527	GTTACC	2	12	1644096	1644107	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212213179
483	NC_011527	CAAAAT	2	12	1645603	1645614	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	212213181
484	NC_011527	ATGGTG	2	12	1647494	1647505	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	212213182
485	NC_011527	TTATTT	2	12	1648938	1648949	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	212213185
486	NC_011527	CTAAGC	2	12	1649603	1649614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212213186
487	NC_011527	GTTTAG	2	12	1650458	1650469	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212213186
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489	NC_011527	GTCAAC	2	12	1654088	1654099	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212213189
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494	NC_011527	CCATTG	2	12	1671016	1671027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212213213
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