MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 1745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011527	TTTCT	2	10	53	62	0 %	80 %	0 %	20 %	212211669
2	NC_011527	TGGAT	2	10	291	300	20 %	40 %	40 %	0 %	212211670
3	NC_011527	AAATT	2	10	1642	1651	60 %	40 %	0 %	0 %	212211671
4	NC_011527	AGCGA	2	10	8072	8081	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011527	GATTT	2	10	10261	10270	20 %	60 %	20 %	0 %	212211679
6	NC_011527	AATGA	2	10	10484	10493	60 %	20 %	20 %	0 %	212211679
7	NC_011527	ATCTC	2	10	12748	12757	20 %	40 %	0 %	40 %	212211681
8	NC_011527	ATGGA	2	10	13923	13932	40 %	20 %	40 %	0 %	212211683
9	NC_011527	CGCAG	2	10	15349	15358	20 %	0 %	40 %	40 %	212211685
10	NC_011527	TTTAT	2	10	15878	15887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011527	GCAAT	2	10	16719	16728	40 %	20 %	20 %	20 %	212211687
12	NC_011527	GCTCA	2	10	17479	17488	20 %	20 %	20 %	40 %	212211688
13	NC_011527	TGCGC	2	10	17801	17810	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011527	ATGGA	2	10	18719	18728	40 %	20 %	40 %	0 %	212211690
15	NC_011527	CTCAA	2	10	19576	19585	40 %	20 %	0 %	40 %	212211691
16	NC_011527	TGCGT	2	10	20699	20708	0 %	40 %	40 %	20 %	212211691
17	NC_011527	TTAAA	2	10	21474	21483	60 %	40 %	0 %	0 %	212211692
18	NC_011527	TTAAT	2	10	23397	23406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011527	GCGAA	2	10	23445	23454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011527	TTTTG	2	10	25349	25358	0 %	80 %	20 %	0 %	212211697
21	NC_011527	GCGCG	2	10	25960	25969	0 %	0 %	60 %	40 %	212211697
22	NC_011527	GCTTC	2	10	26005	26014	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_011527	AAAAT	2	10	27480	27489	80 %	20 %	0 %	0 %	212211699
24	NC_011527	TCGCT	2	10	28451	28460	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011527	AGCGA	2	10	28496	28505	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011527	AATTC	2	10	28515	28524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011527	ATTTT	2	10	31683	31692	20 %	80 %	0 %	0 %	212211703
28	NC_011527	AATCG	2	10	32991	33000	40 %	20 %	20 %	20 %	212211705
29	NC_011527	ACTTT	2	10	33985	33994	20 %	60 %	0 %	20 %	212211705
30	NC_011527	TTCGT	2	10	34393	34402	0 %	60 %	20 %	20 %	212211705
31	NC_011527	CGAAA	2	10	34773	34782	60 %	0 %	20 %	20 %	212211705
32	NC_011527	GAAAA	2	10	35210	35219	80 %	0 %	20 %	0 %	212211705
33	NC_011527	CGCTT	2	10	35806	35815	0 %	40 %	20 %	40 %	212211706
34	NC_011527	AAAAC	2	10	37711	37720	80 %	0 %	0 %	20 %	212211708
35	NC_011527	CCATC	2	10	39283	39292	20 %	20 %	0 %	60 %	212211712
36	NC_011527	GGATT	2	10	39712	39721	20 %	40 %	40 %	0 %	212211712
37	NC_011527	AAATA	2	10	39957	39966	80 %	20 %	0 %	0 %	212211712
38	NC_011527	ATTAA	2	10	40625	40634	60 %	40 %	0 %	0 %	212211712
39	NC_011527	TTGGG	2	10	41132	41141	0 %	40 %	60 %	0 %	212211712
40	NC_011527	CTATC	2	10	41533	41542	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011527	ATTGG	2	10	42482	42491	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011527	GCGCG	2	10	44913	44922	0 %	0 %	60 %	40 %	212211717
43	NC_011527	GCATT	2	10	46451	46460	20 %	40 %	20 %	20 %	212211720
44	NC_011527	TTAAA	2	10	46881	46890	60 %	40 %	0 %	0 %	212211720
45	NC_011527	ATGTT	2	10	47155	47164	20 %	60 %	20 %	0 %	212211721
46	NC_011527	TTTGC	2	10	50037	50046	0 %	60 %	20 %	20 %	212211723
47	NC_011527	ATGAA	2	10	50207	50216	60 %	20 %	20 %	0 %	212211723
48	NC_011527	TGCGT	2	10	51387	51396	0 %	40 %	40 %	20 %	212211724
49	NC_011527	TGCGC	2	10	53147	53156	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011527	CGGTG	2	10	58878	58887	0 %	20 %	60 %	20 %	212211736
51	NC_011527	AAAAG	2	10	59988	59997	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011527	ATAAA	2	10	61050	61059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011527	TTCGA	2	10	62238	62247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011527	TTAAA	2	10	62740	62749	60 %	40 %	0 %	0 %	212211743
55	NC_011527	ATATT	2	10	64762	64771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011527	TAAGA	2	10	68029	68038	60 %	20 %	20 %	0 %	212211750
57	NC_011527	GATCG	2	10	69641	69650	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011527	TAATA	2	10	71579	71588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011527	ATAAG	2	10	71656	71665	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011527	TATAA	2	10	72766	72775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011527	GAAAA	2	10	72979	72988	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011527	CATTG	2	10	73842	73851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011527	TTGCT	2	10	73957	73966	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011527	CTTTC	2	10	74102	74111	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011527	ATTTC	2	10	74186	74195	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011527	TCATA	2	10	74199	74208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011527	TTAAC	2	10	74497	74506	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011527	GTGGC	2	10	75561	75570	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011527	AGGAG	2	10	77519	77528	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011527	GAAGC	2	10	79393	79402	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011527	TCGCT	2	10	79445	79454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_011527	CGCTT	2	10	81472	81481	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_011527	CAATG	2	10	83359	83368	40 %	20 %	20 %	20 %	212211762
74	NC_011527	TTTCA	2	10	85011	85020	20 %	60 %	0 %	20 %	212211763
75	NC_011527	CCACG	2	10	86120	86129	20 %	0 %	20 %	60 %	212211763
76	NC_011527	GCGAT	2	10	87008	87017	20 %	20 %	40 %	20 %	212211765
77	NC_011527	CATTG	2	10	89276	89285	20 %	40 %	20 %	20 %	212211765
78	NC_011527	AAAAT	2	10	90100	90109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011527	CGGTT	2	10	91299	91308	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011527	AAATA	2	10	92152	92161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011527	GTTTT	2	10	94668	94677	0 %	80 %	20 %	0 %	212211767
82	NC_011527	GAAGC	2	10	99125	99134	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011527	AGAAA	2	10	101056	101065	80 %	0 %	20 %	0 %	212211769
84	NC_011527	TCAAT	2	10	101974	101983	40 %	40 %	0 %	20 %	212211770
85	NC_011527	GCGGG	2	10	102895	102904	0 %	0 %	80 %	20 %	212211772
86	NC_011527	AAAGC	2	10	103451	103460	60 %	0 %	20 %	20 %	212211772
87	NC_011527	TTATT	2	10	103695	103704	20 %	80 %	0 %	0 %	212211772
88	NC_011527	GATTA	2	10	103823	103832	40 %	40 %	20 %	0 %	212211773
89	NC_011527	TAATA	2	10	103979	103988	60 %	40 %	0 %	0 %	212211773
90	NC_011527	GTTGG	2	10	105917	105926	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011527	ATAAA	2	10	110122	110131	80 %	20 %	0 %	0 %	212211776
92	NC_011527	TTGAT	2	10	110639	110648	20 %	60 %	20 %	0 %	212211776
93	NC_011527	TCTCG	2	10	111453	111462	0 %	40 %	20 %	40 %	212211777
94	NC_011527	GTCCC	2	10	114721	114730	0 %	20 %	20 %	60 %	212211782
95	NC_011527	CCTTC	2	10	115434	115443	0 %	40 %	0 %	60 %	212211782
96	NC_011527	CAACG	2	10	115612	115621	40 %	0 %	20 %	40 %	212211782
97	NC_011527	TTGAT	2	10	115828	115837	20 %	60 %	20 %	0 %	212211783
98	NC_011527	AAAAT	2	10	117137	117146	80 %	20 %	0 %	0 %	212211785
99	NC_011527	TGCGC	2	10	117441	117450	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_011527	AGAAA	2	10	121449	121458	80 %	0 %	20 %	0 %	212211793
101	NC_011527	CGACC	2	10	122558	122567	20 %	0 %	20 %	60 %	212211793
102	NC_011527	CAAAA	2	10	122778	122787	80 %	0 %	0 %	20 %	212211794
103	NC_011527	TTCCC	2	10	124616	124625	0 %	40 %	0 %	60 %	212211795
104	NC_011527	GCGGG	2	10	125459	125468	0 %	0 %	80 %	20 %	212211797
105	NC_011527	TTATT	3	15	126071	126085	20 %	80 %	0 %	0 %	212211797
106	NC_011527	TTAAG	2	10	128929	128938	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011527	GAAGC	2	10	130358	130367	40 %	0 %	40 %	20 %	212211800
108	NC_011527	TCTCT	2	10	131043	131052	0 %	60 %	0 %	40 %	212211801
109	NC_011527	AATGA	2	10	132071	132080	60 %	20 %	20 %	0 %	212211801
110	NC_011527	TTTCA	2	10	132696	132705	20 %	60 %	0 %	20 %	212211802
111	NC_011527	AATGA	2	10	133642	133651	60 %	20 %	20 %	0 %	212211802
112	NC_011527	CAACT	2	10	133997	134006	40 %	20 %	0 %	40 %	212211802
113	NC_011527	GCCAA	2	10	135018	135027	40 %	0 %	20 %	40 %	212211803
114	NC_011527	TCGCT	2	10	136014	136023	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_011527	GAGAG	2	10	136399	136408	40 %	0 %	60 %	0 %	212211807
116	NC_011527	AATAA	2	10	136646	136655	80 %	20 %	0 %	0 %	212211807
117	NC_011527	TCATG	2	10	136725	136734	20 %	40 %	20 %	20 %	212211807
118	NC_011527	CGAAG	2	10	139789	139798	40 %	0 %	40 %	20 %	212211810
119	NC_011527	TATCG	2	10	139977	139986	20 %	40 %	20 %	20 %	212211810
120	NC_011527	CCACG	2	10	140001	140010	20 %	0 %	20 %	60 %	212211810
121	NC_011527	AGCGA	2	10	140257	140266	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011527	CCGCT	2	10	143175	143184	0 %	20 %	20 %	60 %	212211812
123	NC_011527	TTTAA	2	10	144344	144353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011527	GAAGC	2	10	147141	147150	40 %	0 %	40 %	20 %	212211817
125	NC_011527	CGCTT	2	10	147184	147193	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_011527	TTTTC	2	10	147360	147369	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011527	TCAAA	2	10	148475	148484	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011527	ATCGA	2	10	149099	149108	40 %	20 %	20 %	20 %	212211818
129	NC_011527	CCTTT	2	10	149668	149677	0 %	60 %	0 %	40 %	212211818
130	NC_011527	GAAAT	2	10	149728	149737	60 %	20 %	20 %	0 %	212211818
131	NC_011527	TAAGG	2	10	149912	149921	40 %	20 %	40 %	0 %	212211818
132	NC_011527	ATTTT	2	10	151516	151525	20 %	80 %	0 %	0 %	212211819
133	NC_011527	GCCAT	2	10	153350	153359	20 %	20 %	20 %	40 %	212211821
134	NC_011527	CGTTT	2	10	153703	153712	0 %	60 %	20 %	20 %	212211821
135	NC_011527	TGCCA	2	10	154237	154246	20 %	20 %	20 %	40 %	212211821
136	NC_011527	CGAAA	2	10	156133	156142	60 %	0 %	20 %	20 %	212211823
137	NC_011527	CGCTT	2	10	156172	156181	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_011527	TCGCG	2	10	156672	156681	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011527	CAACG	2	10	158157	158166	40 %	0 %	20 %	40 %	212211824
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162	NC_011527	TCGCT	2	10	180697	180706	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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269	NC_011527	CTTAC	2	10	299221	299230	20 %	40 %	0 %	40 %	212211969
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