MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011527	AGCGA	2	10	8072	8081	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011527	TTTAT	2	10	15878	15887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011527	TGCGC	2	10	17801	17810	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011527	TTAAT	2	10	23397	23406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011527	GCGAA	2	10	23445	23454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011527	GCTTC	2	10	26005	26014	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011527	TCGCT	2	10	28451	28460	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011527	AGCGA	2	10	28496	28505	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011527	AATTC	2	10	28515	28524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011527	CTATC	2	10	41533	41542	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011527	ATTGG	2	10	42482	42491	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011527	TGCGC	2	10	53147	53156	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011527	AAAAG	2	10	59988	59997	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011527	ATAAA	2	10	61050	61059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011527	TTCGA	2	10	62238	62247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011527	ATATT	2	10	64762	64771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011527	GATCG	2	10	69641	69650	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011527	TAATA	2	10	71579	71588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011527	ATAAG	2	10	71656	71665	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011527	TATAA	2	10	72766	72775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011527	GAAAA	2	10	72979	72988	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011527	CATTG	2	10	73842	73851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011527	TTGCT	2	10	73957	73966	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011527	CTTTC	2	10	74102	74111	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011527	ATTTC	2	10	74186	74195	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011527	TCATA	2	10	74199	74208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011527	TTAAC	2	10	74497	74506	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011527	GTGGC	2	10	75561	75570	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011527	AGGAG	2	10	77519	77528	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011527	GAAGC	2	10	79393	79402	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011527	TCGCT	2	10	79445	79454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011527	CGCTT	2	10	81472	81481	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_011527	AAAAT	2	10	90100	90109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011527	CGGTT	2	10	91299	91308	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011527	AAATA	2	10	92152	92161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011527	GAAGC	2	10	99125	99134	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011527	GTTGG	2	10	105917	105926	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011527	TGCGC	2	10	117441	117450	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011527	TTAAG	2	10	128929	128938	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011527	TCGCT	2	10	136014	136023	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011527	AGCGA	2	10	140257	140266	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011527	TTTAA	2	10	144344	144353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011527	CGCTT	2	10	147184	147193	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011527	TTTTC	2	10	147360	147369	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011527	TCAAA	2	10	148475	148484	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011527	CGCTT	2	10	156172	156181	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_011527	TCGCG	2	10	156672	156681	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011527	TGCCA	2	10	163213	163222	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011527	TTAAA	2	10	163512	163521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011527	ATCCC	2	10	164328	164337	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_011527	AGCGA	2	10	180645	180654	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011527	TCGCT	2	10	180697	180706	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_011527	AAATC	2	10	184382	184391	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011527	CAAAA	2	10	184404	184413	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011527	ATTTT	2	10	184491	184500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011527	AAAAT	2	10	188350	188359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011527	TTAAT	2	10	188985	188994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011527	GAGAT	2	10	189844	189853	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011527	AGAGC	2	10	197275	197284	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011527	TATTT	2	10	197785	197794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011527	AGCGA	2	10	199622	199631	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011527	TCGCT	2	10	199672	199681	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_011527	ATGGT	2	10	209075	209084	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011527	TTCCA	2	10	217926	217935	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011527	ATTTT	2	10	221476	221485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011527	AGCGA	2	10	221530	221539	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011527	TCGCT	2	10	221574	221583	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011527	AGGCC	2	10	226191	226200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011527	AACAA	2	10	233824	233833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011527	GGCAA	2	10	250796	250805	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011527	GAAGG	2	10	254797	254806	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011527	AAAAC	2	10	257927	257936	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011527	CTCGG	2	10	258108	258117	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_011527	TAATT	2	10	258919	258928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011527	ATGAC	2	10	261047	261056	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011527	TAACA	2	10	262802	262811	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011527	ATAAA	2	10	269234	269243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011527	GCACA	2	10	271182	271191	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011527	TAAGC	2	10	277637	277646	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011527	CGCTT	2	10	286339	286348	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011527	ATATA	2	10	305390	305399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011527	CTGCG	2	10	307328	307337	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_011527	AAAAT	2	10	308282	308291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011527	ATTTA	2	10	309751	309760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011527	AGCGA	2	10	319889	319898	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011527	TACTT	2	10	319959	319968	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011527	GTGTT	2	10	322766	322775	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011527	AGCGA	2	10	325455	325464	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011527	AAAAT	2	10	325473	325482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011527	TCGCT	2	10	325504	325513	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_011527	TTAAT	2	10	334278	334287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011527	TACTT	2	10	336046	336055	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011527	GTTAA	2	10	336063	336072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011527	AGCGA	2	10	342056	342065	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011527	TCGCT	2	10	342105	342114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_011527	ATTAA	2	10	349970	349979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011527	AAGCA	2	10	350195	350204	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011527	TTTAA	2	10	350607	350616	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011527	TTAAT	2	10	352403	352412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011527	TAAGG	2	10	366121	366130	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011527	TTAAT	2	10	371762	371771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011527	ATTTA	2	10	378346	378355	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011527	AGCAG	2	10	379828	379837	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011527	ATTAC	2	10	380145	380154	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011527	GCCAA	2	10	381239	381248	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_011527	CGCTT	2	10	385679	385688	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011527	AGCGA	2	10	387916	387925	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011527	TCGCT	2	10	387965	387974	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011527	TACTT	2	10	387984	387993	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_011527	ATCTT	2	10	408468	408477	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011527	GAAGC	2	10	410172	410181	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011527	TCGCT	2	10	410212	410221	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011527	ATCAA	2	10	413657	413666	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011527	ATTTT	2	10	414230	414239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011527	AACCT	2	10	414947	414956	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011527	ATTAA	2	10	416642	416651	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011527	TCGCT	2	10	421195	421204	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_011527	TTTTG	2	10	430964	430973	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011527	AATAA	2	10	431092	431101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011527	GACTC	2	10	431319	431328	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_011527	GAAGC	2	10	431598	431607	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011527	TCGCT	2	10	431641	431650	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011527	TCGCT	2	10	433492	433501	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_011527	TAAAC	2	10	441994	442003	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011527	AGCGA	2	10	445106	445115	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011527	TCGCT	2	10	445155	445164	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011527	ACTTT	2	10	452268	452277	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011527	TTATC	2	10	452493	452502	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011527	GGGGA	2	10	456073	456082	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011527	GCAGC	2	10	468462	468471	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011527	CGCTG	2	10	468508	468517	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_011527	AGCGA	2	10	473514	473523	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011527	TCGCT	2	10	473554	473563	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_011527	GCAAA	2	10	474741	474750	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011527	TAAAA	2	10	475059	475068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011527	AAATG	2	10	475455	475464	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011527	TGCGC	2	10	486202	486211	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_011527	GAAGC	2	10	492796	492805	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011527	TTTCG	2	10	492846	492855	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011527	TTAAA	2	10	499346	499355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011527	TAAAT	2	10	499570	499579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011527	AAATT	2	10	505779	505788	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011527	AGCGA	2	10	509141	509150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011527	ATTTT	2	10	511319	511328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011527	AAATC	2	10	511634	511643	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011527	TAGTT	2	10	518712	518721	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011527	AAAAT	2	10	519880	519889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011527	TGCTT	2	10	520152	520161	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_011527	TCGCT	2	10	524278	524287	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_011527	CTTTT	2	10	571191	571200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_011527	TCGCT	2	10	683533	683542	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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279	NC_011527	ATGCT	2	10	944660	944669	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_011527	ACCAA	2	10	945438	945447	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
282	NC_011527	AAAAT	2	10	945533	945542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_011527	AACGA	2	10	959110	959119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
290	NC_011527	GCTTG	2	10	959512	959521	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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