MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 5937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011527	CAAA	2	8	247	254	75 %	0 %	0 %	25 %	212211670
2	NC_011527	CCAA	2	8	401	408	50 %	0 %	0 %	50 %	212211670
3	NC_011527	TTTA	2	8	596	603	25 %	75 %	0 %	0 %	212211670
4	NC_011527	GATC	2	8	821	828	25 %	25 %	25 %	25 %	212211670
5	NC_011527	TCAA	2	8	1144	1151	50 %	25 %	0 %	25 %	212211670
6	NC_011527	TTGC	2	8	1430	1437	0 %	50 %	25 %	25 %	212211670
7	NC_011527	CAAA	2	8	2194	2201	75 %	0 %	0 %	25 %	212211671
8	NC_011527	AATT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	212211671
9	NC_011527	ATCG	2	8	2416	2423	25 %	25 %	25 %	25 %	212211671
10	NC_011527	AATC	2	8	2877	2884	50 %	25 %	0 %	25 %	212211672
11	NC_011527	CGAT	2	8	3028	3035	25 %	25 %	25 %	25 %	212211672
12	NC_011527	CCTT	2	8	3188	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	212211672
13	NC_011527	GTGG	2	8	3420	3427	0 %	25 %	75 %	0 %	212211672
14	NC_011527	TTAC	2	8	3585	3592	25 %	50 %	0 %	25 %	212211672
15	NC_011527	ATTT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	212211672
16	NC_011527	TGAT	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	212211672
17	NC_011527	TAGA	2	8	3919	3926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011527	GCTT	2	8	4715	4722	0 %	50 %	25 %	25 %	212211673
19	NC_011527	CATT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	212211673
20	NC_011527	CACT	2	8	4973	4980	25 %	25 %	0 %	50 %	212211673
21	NC_011527	CTTG	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	212211673
22	NC_011527	TGAG	2	8	5995	6002	25 %	25 %	50 %	0 %	212211673
23	NC_011527	ACCC	2	8	6703	6710	25 %	0 %	0 %	75 %	212211674
24	NC_011527	GTAT	2	8	6884	6891	25 %	50 %	25 %	0 %	212211674
25	NC_011527	AGCG	2	8	7271	7278	25 %	0 %	50 %	25 %	212211674
26	NC_011527	TTGT	2	8	7319	7326	0 %	75 %	25 %	0 %	212211674
27	NC_011527	GGGT	2	8	7432	7439	0 %	25 %	75 %	0 %	212211674
28	NC_011527	GAAT	2	8	7699	7706	50 %	25 %	25 %	0 %	212211674
29	NC_011527	CTTT	2	8	8017	8024	0 %	75 %	0 %	25 %	212211675
30	NC_011527	GGGT	2	8	8051	8058	0 %	25 %	75 %	0 %	212211675
31	NC_011527	AATA	2	8	8153	8160	75 %	25 %	0 %	0 %	212211676
32	NC_011527	ATAA	2	8	8248	8255	75 %	25 %	0 %	0 %	212211676
33	NC_011527	CGAA	2	8	10400	10407	50 %	0 %	25 %	25 %	212211679
34	NC_011527	AATT	2	8	11784	11791	50 %	50 %	0 %	0 %	212211680
35	NC_011527	GGAT	2	8	12211	12218	25 %	25 %	50 %	0 %	212211681
36	NC_011527	GAAA	2	8	12237	12244	75 %	0 %	25 %	0 %	212211681
37	NC_011527	CGAT	2	8	12246	12253	25 %	25 %	25 %	25 %	212211681
38	NC_011527	GCTC	2	8	12514	12521	0 %	25 %	25 %	50 %	212211681
39	NC_011527	ATCA	2	8	12528	12535	50 %	25 %	0 %	25 %	212211681
40	NC_011527	TTTC	2	8	13134	13141	0 %	75 %	0 %	25 %	212211682
41	NC_011527	GTTT	2	8	13605	13612	0 %	75 %	25 %	0 %	212211682
42	NC_011527	GAAT	2	8	13721	13728	50 %	25 %	25 %	0 %	212211682
43	NC_011527	TATT	2	8	13885	13892	25 %	75 %	0 %	0 %	212211683
44	NC_011527	AAAT	2	8	13979	13986	75 %	25 %	0 %	0 %	212211683
45	NC_011527	TTCG	2	8	14404	14411	0 %	50 %	25 %	25 %	212211683
46	NC_011527	TAAA	2	8	15076	15083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011527	TTCA	2	8	15372	15379	25 %	50 %	0 %	25 %	212211685
48	NC_011527	CGCT	2	8	16056	16063	0 %	25 %	25 %	50 %	212211687
49	NC_011527	GGCA	2	8	17184	17191	25 %	0 %	50 %	25 %	212211688
50	NC_011527	GGGT	2	8	18132	18139	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011527	CTCA	2	8	18634	18641	25 %	25 %	0 %	50 %	212211690
52	NC_011527	GATA	2	8	18834	18841	50 %	25 %	25 %	0 %	212211690
53	NC_011527	AAGC	2	8	18992	18999	50 %	0 %	25 %	25 %	212211690
54	NC_011527	AATT	2	8	19001	19008	50 %	50 %	0 %	0 %	212211690
55	NC_011527	AAAC	2	8	20394	20401	75 %	0 %	0 %	25 %	212211691
56	NC_011527	TTAG	2	8	20454	20461	25 %	50 %	25 %	0 %	212211691
57	NC_011527	CACC	2	8	20674	20681	25 %	0 %	0 %	75 %	212211691
58	NC_011527	GCCA	2	8	20916	20923	25 %	0 %	25 %	50 %	212211691
59	NC_011527	CGAT	2	8	21067	21074	25 %	25 %	25 %	25 %	212211691
60	NC_011527	GATA	2	8	21209	21216	50 %	25 %	25 %	0 %	212211691
61	NC_011527	CAAT	2	8	21424	21431	50 %	25 %	0 %	25 %	212211692
62	NC_011527	ACCC	2	8	21586	21593	25 %	0 %	0 %	75 %	212211692
63	NC_011527	ATTT	2	8	21869	21876	25 %	75 %	0 %	0 %	212211692
64	NC_011527	TATT	2	8	22028	22035	25 %	75 %	0 %	0 %	212211692
65	NC_011527	GTTG	2	8	22129	22136	0 %	50 %	50 %	0 %	212211692
66	NC_011527	AACA	2	8	22148	22155	75 %	0 %	0 %	25 %	212211692
67	NC_011527	TCAT	2	8	22834	22841	25 %	50 %	0 %	25 %	212211693
68	NC_011527	TTTA	2	8	23227	23234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011527	GCAA	2	8	23861	23868	50 %	0 %	25 %	25 %	212211695
70	NC_011527	AAGA	2	8	23935	23942	75 %	0 %	25 %	0 %	212211695
71	NC_011527	AAAC	2	8	24628	24635	75 %	0 %	0 %	25 %	212211697
72	NC_011527	CAAC	2	8	24709	24716	50 %	0 %	0 %	50 %	212211697
73	NC_011527	AGCG	2	8	25161	25168	25 %	0 %	50 %	25 %	212211697
74	NC_011527	TGGT	2	8	25187	25194	0 %	50 %	50 %	0 %	212211697
75	NC_011527	AATG	2	8	25209	25216	50 %	25 %	25 %	0 %	212211697
76	NC_011527	GAAC	2	8	25306	25313	50 %	0 %	25 %	25 %	212211697
77	NC_011527	TATT	2	8	25628	25635	25 %	75 %	0 %	0 %	212211697
78	NC_011527	GCCC	2	8	26798	26805	0 %	0 %	25 %	75 %	212211699
79	NC_011527	CGTT	2	8	26918	26925	0 %	50 %	25 %	25 %	212211699
80	NC_011527	GACA	2	8	27214	27221	50 %	0 %	25 %	25 %	212211699
81	NC_011527	CCAC	2	8	27615	27622	25 %	0 %	0 %	75 %	212211699
82	NC_011527	GACG	2	8	28000	28007	25 %	0 %	50 %	25 %	212211700
83	NC_011527	TGCA	2	8	28232	28239	25 %	25 %	25 %	25 %	212211700
84	NC_011527	ATTT	2	8	28265	28272	25 %	75 %	0 %	0 %	212211700
85	NC_011527	TCAA	2	8	28329	28336	50 %	25 %	0 %	25 %	212211700
86	NC_011527	GAAA	2	8	28762	28769	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011527	AACC	2	8	29134	29141	50 %	0 %	0 %	50 %	212211701
88	NC_011527	GCTT	2	8	29223	29230	0 %	50 %	25 %	25 %	212211701
89	NC_011527	ATTA	2	8	29422	29429	50 %	50 %	0 %	0 %	212211701
90	NC_011527	ACGA	2	8	29533	29540	50 %	0 %	25 %	25 %	212211701
91	NC_011527	GTCC	2	8	29624	29631	0 %	25 %	25 %	50 %	212211701
92	NC_011527	ATTA	2	8	30346	30353	50 %	50 %	0 %	0 %	212211701
93	NC_011527	ACCA	2	8	30576	30583	50 %	0 %	0 %	50 %	212211701
94	NC_011527	CACC	2	8	30856	30863	25 %	0 %	0 %	75 %	212211702
95	NC_011527	CTAT	2	8	30878	30885	25 %	50 %	0 %	25 %	212211702
96	NC_011527	CGGG	2	8	31176	31183	0 %	0 %	75 %	25 %	212211702
97	NC_011527	ATTG	2	8	31694	31701	25 %	50 %	25 %	0 %	212211703
98	NC_011527	CGAT	2	8	32210	32217	25 %	25 %	25 %	25 %	212211704
99	NC_011527	TGGC	2	8	32387	32394	0 %	25 %	50 %	25 %	212211704
100	NC_011527	TTGA	2	8	32455	32462	25 %	50 %	25 %	0 %	212211704
101	NC_011527	AGCG	2	8	32726	32733	25 %	0 %	50 %	25 %	212211704
102	NC_011527	AATT	2	8	32756	32763	50 %	50 %	0 %	0 %	212211704
103	NC_011527	ATTT	2	8	33358	33365	25 %	75 %	0 %	0 %	212211705
104	NC_011527	ATCG	2	8	34312	34319	25 %	25 %	25 %	25 %	212211705
105	NC_011527	TGGT	2	8	34557	34564	0 %	50 %	50 %	0 %	212211705
106	NC_011527	TTAA	2	8	35035	35042	50 %	50 %	0 %	0 %	212211705
107	NC_011527	GCCG	2	8	35295	35302	0 %	0 %	50 %	50 %	212211705
108	NC_011527	CGTT	2	8	35950	35957	0 %	50 %	25 %	25 %	212211706
109	NC_011527	ATTT	2	8	37818	37825	25 %	75 %	0 %	0 %	212211709
110	NC_011527	ACGA	2	8	38359	38366	50 %	0 %	25 %	25 %	212211711
111	NC_011527	AGTT	2	8	38818	38825	25 %	50 %	25 %	0 %	212211711
112	NC_011527	CCTT	2	8	39236	39243	0 %	50 %	0 %	50 %	212211712
113	NC_011527	ATTA	2	8	39502	39509	50 %	50 %	0 %	0 %	212211712
114	NC_011527	TGGA	2	8	39870	39877	25 %	25 %	50 %	0 %	212211712
115	NC_011527	GAAA	2	8	40063	40070	75 %	0 %	25 %	0 %	212211712
116	NC_011527	GGAA	2	8	40150	40157	50 %	0 %	50 %	0 %	212211712
117	NC_011527	AATT	2	8	41175	41182	50 %	50 %	0 %	0 %	212211712
118	NC_011527	CAAT	2	8	41453	41460	50 %	25 %	0 %	25 %	212211712
119	NC_011527	CACC	2	8	41545	41552	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_011527	TGTT	2	8	42231	42238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011527	GCTT	2	8	42335	42342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011527	TTCT	2	8	42505	42512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011527	GTTT	2	8	42729	42736	0 %	75 %	25 %	0 %	212211715
124	NC_011527	GAAA	2	8	42821	42828	75 %	0 %	25 %	0 %	212211715
125	NC_011527	ATCA	2	8	43873	43880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011527	GCTT	2	8	43952	43959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011527	ATCA	2	8	43960	43967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011527	GTTT	2	8	44524	44531	0 %	75 %	25 %	0 %	212211716
129	NC_011527	TTAT	2	8	44886	44893	25 %	75 %	0 %	0 %	212211717
130	NC_011527	GATT	2	8	45304	45311	25 %	50 %	25 %	0 %	212211717
131	NC_011527	AATT	2	8	45373	45380	50 %	50 %	0 %	0 %	212211717
132	NC_011527	AATT	2	8	45561	45568	50 %	50 %	0 %	0 %	212211718
133	NC_011527	TTTA	2	8	45604	45611	25 %	75 %	0 %	0 %	212211718
134	NC_011527	AGTG	2	8	46433	46440	25 %	25 %	50 %	0 %	212211719
135	NC_011527	AATA	2	8	46772	46779	75 %	25 %	0 %	0 %	212211720
136	NC_011527	ATGG	2	8	46949	46956	25 %	25 %	50 %	0 %	212211720
137	NC_011527	GGAA	2	8	47099	47106	50 %	0 %	50 %	0 %	212211721
138	NC_011527	ACCG	2	8	47456	47463	25 %	0 %	25 %	50 %	212211721
139	NC_011527	AATC	2	8	47470	47477	50 %	25 %	0 %	25 %	212211721
140	NC_011527	AATT	2	8	47512	47519	50 %	50 %	0 %	0 %	212211721
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142	NC_011527	CAAC	2	8	48043	48050	50 %	0 %	0 %	50 %	212211721
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