MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 5594

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011527	AGA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011527	AAT	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011527	TCC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011527	GCC	2	6	6669	6674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011527	GTG	2	6	8758	8763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011527	CGT	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011527	CTG	2	6	8807	8812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011527	AAT	2	6	18070	18075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011527	GAC	2	6	18098	18103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011527	CAC	2	6	18126	18131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011527	TCA	2	6	23110	23115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011527	AGC	2	6	23165	23170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011527	CGA	2	6	23180	23185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011527	CTG	2	6	23242	23247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011527	TAA	2	6	23365	23370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011527	TAA	2	6	23377	23382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011527	TTG	2	6	23466	23471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011527	TTG	2	6	26036	26041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011527	GCA	2	6	26079	26084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011527	CAG	2	6	26248	26253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011527	TGT	2	6	26256	26261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011527	GGA	2	6	26290	26295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011527	TTA	2	6	28426	28431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011527	TAT	2	6	28595	28600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011527	GTT	2	6	28648	28653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011527	TAG	2	6	28662	28667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011527	ATT	2	6	28697	28702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011527	TTG	2	6	28718	28723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011527	CGA	2	6	28734	28739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011527	CAG	2	6	28756	28761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011527	TAA	2	6	41984	41989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011527	GAT	2	6	42001	42006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011527	TCT	2	6	42013	42018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011527	ACG	2	6	42047	42052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011527	ATT	2	6	42098	42103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011527	CAA	2	6	42107	42112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011527	TTC	2	6	42272	42277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011527	ACC	2	6	42400	42405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011527	TTC	2	6	42413	42418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011527	CCA	2	6	42437	42442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011527	TCA	2	6	42462	42467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011527	TTG	2	6	42919	42924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011527	AGT	2	6	42939	42944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011527	TGA	2	6	43022	43027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011527	CGG	2	6	43142	43147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011527	GAT	2	6	43230	43235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011527	CTT	2	6	43266	43271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011527	TTA	2	6	43394	43399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011527	TAA	2	6	43429	43434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011527	TAA	2	6	43449	43454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011527	CGA	2	6	43482	43487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011527	ATA	3	9	43496	43504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011527	TTC	2	6	43534	43539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011527	ACC	2	6	43561	43566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011527	CTG	2	6	43727	43732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011527	AAC	2	6	43741	43746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011527	TCA	2	6	43814	43819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011527	GAT	2	6	44029	44034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011527	TCA	2	6	44046	44051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011527	GCT	2	6	44052	44057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011527	CCA	2	6	44115	44120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011527	AAT	2	6	44137	44142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011527	CTT	2	6	44161	44166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011527	AAG	2	6	45534	45539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011527	CGT	2	6	45863	45868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011527	ATA	2	6	45959	45964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011527	TTC	2	6	48625	48630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011527	GAT	2	6	48641	48646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011527	CGA	2	6	51029	51034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011527	AAG	2	6	51130	51135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011527	AAG	2	6	53010	53015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011527	CAT	2	6	53038	53043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011527	GTC	2	6	54730	54735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011527	GCC	2	6	54747	54752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011527	GGA	2	6	57956	57961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011527	CGT	2	6	59741	59746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011527	CGT	2	6	59763	59768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011527	AAT	2	6	59910	59915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011527	AGA	2	6	59928	59933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011527	ATT	2	6	60057	60062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011527	ATC	2	6	60458	60463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011527	AAT	2	6	60930	60935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011527	GTT	2	6	61093	61098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011527	TTA	2	6	61125	61130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011527	TAA	2	6	61157	61162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011527	TAA	2	6	61169	61174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011527	ACG	2	6	61214	61219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011527	TAT	2	6	62178	62183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011527	TCT	2	6	62313	62318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011527	TAA	2	6	62435	62440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011527	AGG	2	6	62454	62459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011527	ATT	2	6	62486	62491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011527	ATT	2	6	62532	62537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011527	TAT	2	6	63838	63843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011527	TTA	2	6	63865	63870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011527	TAC	2	6	63900	63905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011527	AGG	2	6	63923	63928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011527	CAA	2	6	64006	64011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011527	TCA	2	6	64727	64732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011527	CTC	2	6	64738	64743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011527	ATT	2	6	64789	64794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011527	TAA	2	6	64837	64842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011527	CCT	2	6	65649	65654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011527	TTA	2	6	65665	65670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011527	TTA	2	6	65687	65692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011527	CAG	2	6	65745	65750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011527	GTA	2	6	65934	65939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011527	TTA	2	6	66029	66034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011527	ATC	2	6	66085	66090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011527	GAA	2	6	66227	66232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011527	TTC	2	6	66250	66255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011527	TAT	2	6	66277	66282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011527	GGA	2	6	66957	66962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011527	AAT	2	6	67243	67248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011527	GAA	2	6	67327	67332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011527	TCG	2	6	67373	67378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011527	TCT	2	6	68904	68909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011527	TCT	3	9	69029	69037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011527	AAT	2	6	69139	69144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011527	GTG	2	6	69205	69210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011527	TCC	2	6	69212	69217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_011527	CCG	2	6	69288	69293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011527	CCG	2	6	69454	69459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011527	CAC	2	6	69476	69481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011527	CGG	2	6	69547	69552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011527	CGA	2	6	69574	69579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011527	GAT	2	6	69942	69947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011527	GCT	2	6	70004	70009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011527	ATC	2	6	70037	70042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011527	CGT	2	6	70171	70176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011527	ATC	2	6	70206	70211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011527	GTT	2	6	70265	70270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011527	CGC	2	6	70330	70335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_011527	CTT	2	6	70483	70488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011527	ATC	2	6	70616	70621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011527	ATC	2	6	70623	70628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011527	CTG	2	6	70677	70682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011527	CAT	2	6	70703	70708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011527	TCG	2	6	70762	70767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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