MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 20654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011527	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211670
2	NC_011527	CAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211670
3	NC_011527	TAC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211670
4	NC_011527	CCT	2	6	356	361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211670
5	NC_011527	AGC	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211670
6	NC_011527	TCG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211670
7	NC_011527	GCC	3	9	545	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211670
8	NC_011527	TGG	2	6	604	609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211670
9	NC_011527	TTG	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211670
10	NC_011527	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211670
11	NC_011527	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211670
12	NC_011527	AGA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211670
13	NC_011527	CTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211670
14	NC_011527	CGT	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211670
15	NC_011527	AGA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211670
16	NC_011527	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211671
17	NC_011527	TCT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211671
18	NC_011527	CCG	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211671
19	NC_011527	TAT	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211671
20	NC_011527	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211671
21	NC_011527	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211671
22	NC_011527	GAG	2	6	2266	2271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211671
23	NC_011527	AAT	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211671
24	NC_011527	CTA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211671
25	NC_011527	GTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211671
26	NC_011527	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211671
27	NC_011527	CCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211671
28	NC_011527	AAG	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211671
29	NC_011527	GAA	3	9	2551	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211671
30	NC_011527	AGC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211671
31	NC_011527	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211672
32	NC_011527	TTA	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211672
33	NC_011527	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211672
34	NC_011527	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211672
35	NC_011527	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211672
36	NC_011527	CCG	2	6	3669	3674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211672
37	NC_011527	CGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211672
38	NC_011527	CAC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211673
39	NC_011527	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211673
40	NC_011527	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211673
41	NC_011527	CAC	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211673
42	NC_011527	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211673
43	NC_011527	AGA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211673
44	NC_011527	GCC	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211673
45	NC_011527	TTA	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211673
46	NC_011527	CGG	2	6	4439	4444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211673
47	NC_011527	CGG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211673
48	NC_011527	GTG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211673
49	NC_011527	AGA	2	6	4520	4525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211673
50	NC_011527	AAT	2	6	4947	4952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211673
51	NC_011527	CGG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211673
52	NC_011527	AGT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211673
53	NC_011527	TGC	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211673
54	NC_011527	ACG	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211673
55	NC_011527	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211673
56	NC_011527	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211673
57	NC_011527	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211673
58	NC_011527	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211673
59	NC_011527	TCT	2	6	5674	5679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211673
60	NC_011527	GTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211673
61	NC_011527	GCG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211673
62	NC_011527	GCT	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211673
63	NC_011527	GGA	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211673
64	NC_011527	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211673
65	NC_011527	TTG	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211673
66	NC_011527	TAT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211673
67	NC_011527	ACC	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211673
68	NC_011527	CGC	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211673
69	NC_011527	TGA	2	6	6836	6841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211674
70	NC_011527	GTG	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211674
71	NC_011527	GGA	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211674
72	NC_011527	GCA	2	6	7004	7009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211674
73	NC_011527	AAC	2	6	7117	7122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211674
74	NC_011527	GTT	2	6	7199	7204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211674
75	NC_011527	GTG	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211674
76	NC_011527	TTG	2	6	7335	7340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211674
77	NC_011527	GAG	2	6	7368	7373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211674
78	NC_011527	TCA	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211674
79	NC_011527	ACA	2	6	7535	7540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211674
80	NC_011527	AGG	2	6	7555	7560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211674
81	NC_011527	TGT	2	6	7561	7566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211674
82	NC_011527	CCG	2	6	7797	7802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211675
83	NC_011527	TGA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211675
84	NC_011527	TCA	2	6	7957	7962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211675
85	NC_011527	TGG	2	6	7972	7977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211675
86	NC_011527	TCA	2	6	8025	8030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211675
87	NC_011527	TTG	2	6	8038	8043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211675
88	NC_011527	ACA	2	6	8044	8049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211675
89	NC_011527	TCT	2	6	8133	8138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211676
90	NC_011527	TCT	2	6	8282	8287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211676
91	NC_011527	AAG	2	6	8352	8357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211676
92	NC_011527	TGG	3	9	8412	8420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211676
93	NC_011527	CAA	2	6	8475	8480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211676
94	NC_011527	CAC	2	6	8526	8531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211676
95	NC_011527	GTG	2	6	8612	8617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211676
96	NC_011527	GAT	2	6	8674	8679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211676
97	NC_011527	ACG	2	6	8979	8984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211678
98	NC_011527	TTC	2	6	9196	9201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211679
99	NC_011527	TCT	2	6	9264	9269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211679
100	NC_011527	TGC	2	6	9274	9279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211679
101	NC_011527	TGC	2	6	9287	9292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211679
102	NC_011527	AAT	2	6	9330	9335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211679
103	NC_011527	GAT	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211679
104	NC_011527	CGC	2	6	9433	9438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211679
105	NC_011527	GCT	2	6	9512	9517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212211679
106	NC_011527	CCG	2	6	9554	9559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211679
107	NC_011527	AGA	2	6	9634	9639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211679
108	NC_011527	TCC	2	6	9649	9654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211679
109	NC_011527	AAT	2	6	9684	9689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211679
110	NC_011527	AAT	2	6	9724	9729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211679
111	NC_011527	TTG	2	6	9736	9741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211679
112	NC_011527	TTG	2	6	9757	9762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211679
113	NC_011527	GCG	2	6	9842	9847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211679
114	NC_011527	ATT	2	6	9898	9903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211679
115	NC_011527	TCA	2	6	9938	9943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211679
116	NC_011527	GGA	2	6	9980	9985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212211679
117	NC_011527	ACA	2	6	10074	10079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211679
118	NC_011527	TGT	2	6	10279	10284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211679
119	NC_011527	AAG	2	6	10314	10319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212211679
120	NC_011527	ACG	2	6	10344	10349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211679
121	NC_011527	CCA	2	6	10377	10382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211679
122	NC_011527	CCG	2	6	10535	10540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211680
123	NC_011527	GGC	2	6	10604	10609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212211680
124	NC_011527	TTG	2	6	10635	10640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212211680
125	NC_011527	CTC	2	6	10718	10723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212211680
126	NC_011527	CTT	2	6	10805	10810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211680
127	NC_011527	CTT	2	6	10856	10861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211680
128	NC_011527	GCC	2	6	11010	11015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211680
129	NC_011527	CAA	2	6	11016	11021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211680
130	NC_011527	ACG	2	6	11075	11080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211680
131	NC_011527	CAT	2	6	11094	11099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211680
132	NC_011527	ATC	2	6	11101	11106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211680
133	NC_011527	CAA	2	6	11264	11269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211680
134	NC_011527	ATT	2	6	11274	11279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211680
135	NC_011527	TGG	2	6	11359	11364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212211680
136	NC_011527	CGC	3	9	11385	11393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211680
137	NC_011527	CGC	2	6	11443	11448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212211680
138	NC_011527	TAA	2	6	11496	11501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211680
139	NC_011527	ATC	2	6	11580	11585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211680
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144	NC_011527	ACC	2	6	11755	11760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212211680
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146	NC_011527	ATT	2	6	11799	11804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211680
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152	NC_011527	TAA	2	6	12328	12333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211681
153	NC_011527	CAA	2	6	12341	12346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211681
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155	NC_011527	TAA	2	6	12616	12621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211681
156	NC_011527	CAA	2	6	12638	12643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211681
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168	NC_011527	ATT	2	6	13691	13696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211682
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242	NC_011527	TTC	2	6	19734	19739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211691
243	NC_011527	TCA	2	6	19841	19846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212211691
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251	NC_011527	ACA	2	6	20100	20105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212211691
252	NC_011527	TAT	2	6	20168	20173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211691
253	NC_011527	TAA	2	6	20230	20235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212211691
254	NC_011527	CTT	2	6	20258	20263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211691
255	NC_011527	TGA	2	6	20408	20413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212211691
256	NC_011527	AGC	2	6	20420	20425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212211691
257	NC_011527	CTT	2	6	20436	20441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212211691
258	NC_011527	TTA	2	6	20504	20509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211691
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260	NC_011527	ATT	2	6	20563	20568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211691
261	NC_011527	TTA	2	6	20604	20609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211691
262	NC_011527	TAT	2	6	20654	20659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212211691
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