MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	GCTTG	2	10	3083	3092	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011526	TTATC	2	10	5369	5378	20 %	60 %	0 %	20 %	212208412
3	NC_011526	GCCAC	2	10	7892	7901	20 %	0 %	20 %	60 %	212208415
4	NC_011526	ATTTT	2	10	8825	8834	20 %	80 %	0 %	0 %	212208415
5	NC_011526	AGTTA	2	10	8955	8964	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011526	TGATA	2	10	9251	9260	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011526	TGAAA	2	10	9266	9275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011526	GAAAG	2	10	9351	9360	60 %	0 %	40 %	0 %	212208417
9	NC_011526	AAGCA	2	10	9495	9504	60 %	0 %	20 %	20 %	212208417
10	NC_011526	CAATG	2	10	9612	9621	40 %	20 %	20 %	20 %	212208417
11	NC_011526	AAAAT	2	10	10761	10770	80 %	20 %	0 %	0 %	212208418
12	NC_011526	TTTTC	2	10	11332	11341	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011526	TTATA	2	10	11545	11554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011526	CTTAT	2	10	12658	12667	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011526	ATTAT	2	10	12732	12741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011526	CGATC	2	10	13427	13436	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011526	CGATC	2	10	15287	15296	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011526	TCTTA	2	10	16899	16908	20 %	60 %	0 %	20 %	212208419
19	NC_011526	CTGGG	2	10	19079	19088	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011526	TTTAA	2	10	20957	20966	40 %	60 %	0 %	0 %	212208424
21	NC_011526	TCGAA	2	10	21459	21468	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011526	TTTAT	2	10	22639	22648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011526	TAGCT	2	10	23442	23451	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011526	ATCTT	2	10	25137	25146	20 %	60 %	0 %	20 %	212208430
25	NC_011526	CTTTT	2	10	26663	26672	0 %	80 %	0 %	20 %	212208433
26	NC_011526	TGGAT	2	10	28180	28189	20 %	40 %	40 %	0 %	212208436
27	NC_011526	TGATT	2	10	29884	29893	20 %	60 %	20 %	0 %	212208436
28	NC_011526	GCAAT	2	10	30905	30914	40 %	20 %	20 %	20 %	212208438
29	NC_011526	ATGAT	2	10	30950	30959	40 %	40 %	20 %	0 %	212208438
30	NC_011526	TTTAA	2	10	31075	31084	40 %	60 %	0 %	0 %	212208438
31	NC_011526	ATCCC	2	10	31280	31289	20 %	20 %	0 %	60 %	212208438
32	NC_011526	ATCAA	2	10	31457	31466	60 %	20 %	0 %	20 %	212208438
33	NC_011526	ATAAA	2	10	31557	31566	80 %	20 %	0 %	0 %	212208438
34	NC_011526	GTTTC	2	10	33385	33394	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011526	TTACG	2	10	35259	35268	20 %	40 %	20 %	20 %	212208444
36	NC_011526	AAACA	2	10	36764	36773	80 %	0 %	0 %	20 %	212208445
37	NC_011526	AGATT	2	10	37688	37697	40 %	40 %	20 %	0 %	212208446
38	NC_011526	ATAAA	2	10	38063	38072	80 %	20 %	0 %	0 %	212208446
39	NC_011526	TTGAA	2	10	38132	38141	40 %	40 %	20 %	0 %	212208446
40	NC_011526	CGGGA	2	10	38330	38339	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011526	GAGCT	2	10	38524	38533	20 %	20 %	40 %	20 %	212208447
42	NC_011526	TTGAT	2	10	38940	38949	20 %	60 %	20 %	0 %	212208447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.