MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	TTATC	2	10	5369	5378	20 %	60 %	0 %	20 %	212208412
2	NC_011526	GCCAC	2	10	7892	7901	20 %	0 %	20 %	60 %	212208415
3	NC_011526	ATTTT	2	10	8825	8834	20 %	80 %	0 %	0 %	212208415
4	NC_011526	GAAAG	2	10	9351	9360	60 %	0 %	40 %	0 %	212208417
5	NC_011526	AAGCA	2	10	9495	9504	60 %	0 %	20 %	20 %	212208417
6	NC_011526	CAATG	2	10	9612	9621	40 %	20 %	20 %	20 %	212208417
7	NC_011526	AAAAT	2	10	10761	10770	80 %	20 %	0 %	0 %	212208418
8	NC_011526	TCTTA	2	10	16899	16908	20 %	60 %	0 %	20 %	212208419
9	NC_011526	TTTAA	2	10	20957	20966	40 %	60 %	0 %	0 %	212208424
10	NC_011526	ATCTT	2	10	25137	25146	20 %	60 %	0 %	20 %	212208430
11	NC_011526	CTTTT	2	10	26663	26672	0 %	80 %	0 %	20 %	212208433
12	NC_011526	TGGAT	2	10	28180	28189	20 %	40 %	40 %	0 %	212208436
13	NC_011526	TGATT	2	10	29884	29893	20 %	60 %	20 %	0 %	212208436
14	NC_011526	GCAAT	2	10	30905	30914	40 %	20 %	20 %	20 %	212208438
15	NC_011526	ATGAT	2	10	30950	30959	40 %	40 %	20 %	0 %	212208438
16	NC_011526	TTTAA	2	10	31075	31084	40 %	60 %	0 %	0 %	212208438
17	NC_011526	ATCCC	2	10	31280	31289	20 %	20 %	0 %	60 %	212208438
18	NC_011526	ATCAA	2	10	31457	31466	60 %	20 %	0 %	20 %	212208438
19	NC_011526	ATAAA	2	10	31557	31566	80 %	20 %	0 %	0 %	212208438
20	NC_011526	TTACG	2	10	35259	35268	20 %	40 %	20 %	20 %	212208444
21	NC_011526	AAACA	2	10	36764	36773	80 %	0 %	0 %	20 %	212208445
22	NC_011526	AGATT	2	10	37688	37697	40 %	40 %	20 %	0 %	212208446
23	NC_011526	ATAAA	2	10	38063	38072	80 %	20 %	0 %	0 %	212208446
24	NC_011526	TTGAA	2	10	38132	38141	40 %	40 %	20 %	0 %	212208446
25	NC_011526	GAGCT	2	10	38524	38533	20 %	20 %	40 %	20 %	212208447
26	NC_011526	TTGAT	2	10	38940	38949	20 %	60 %	20 %	0 %	212208447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.