MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 plasmid pQpRS_K_Q154

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011526	GGTA	2	8	804	811	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011526	GCTG	2	8	885	892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011526	CAGG	2	8	1215	1222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011526	TTTA	2	8	2838	2845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011526	AAAT	2	8	2903	2910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011526	TTTC	2	8	3146	3153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011526	CCTG	2	8	3898	3905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011526	ATTT	2	8	9242	9249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011526	ATGA	2	8	11198	11205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011526	GCGA	2	8	11454	11461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011526	CCGT	2	8	11996	12003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011526	AATA	2	8	12721	12728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011526	GAAA	2	8	12812	12819	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011526	AGGT	2	8	13315	13322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011526	GGCG	2	8	13815	13822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011526	CCAT	2	8	14536	14543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011526	GAAA	2	8	14690	14697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011526	GGAT	2	8	15546	15553	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011526	TCTA	2	8	15695	15702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011526	GCTC	2	8	15820	15827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011526	CGAG	2	8	18058	18065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011526	AAAT	2	8	19152	19159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011526	TTAA	2	8	19212	19219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011526	CCGT	2	8	21304	21311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011526	ATTT	2	8	21344	21351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011526	ATTT	2	8	21556	21563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011526	TTAA	2	8	21573	21580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011526	ATTT	2	8	22067	22074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011526	CAGG	2	8	22444	22451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011526	TGGC	2	8	22472	22479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011526	ATTT	2	8	23347	23354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011526	AAGT	2	8	23400	23407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011526	AAAT	2	8	23430	23437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011526	AGAT	2	8	25745	25752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011526	TTAA	2	8	25815	25822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011526	TTCT	2	8	31725	31732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011526	TGTT	2	8	39131	39138	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011526	TTTA	2	8	39142	39149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011526	TAGT	2	8	39160	39167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011526	TTTA	2	8	39172	39179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.